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公开(公告)号：CN113564259B
公开(公告)日：2023-09-26
申请号：CN202111020869.9
申请日：2021-09-01
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12N15/113
摘要： 本发明公开了一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型。本发明通过运用RNA测序、套索算法(LASSO)和二分类Logistic回归获得与细胞周期通路状态高度相关的ncRNA，并构建评分score，进而通过受试者工作曲线(ROC)分析得到肺腺癌中score相应的截断值，可用于预测肺腺癌细胞周期通路相关基因突变。本发明的预测模型经验证在应用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变中具有灵敏度高，特异性强的优点，具有较好的应用前景。
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公开(公告)号：CN115521983A
公开(公告)日：2022-12-27
申请号：CN202211232114.X
申请日：2022-10-10
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , G16B20/00
摘要： 本发明提供了一种检测实体肿瘤细胞对铁死亡诱导剂(erastin,RSL3,ML210,ML162)敏感度的组合物及其应用，所述组合物由检测相关基因表达量的试剂组成。本发明运用RNA测序、套索分析(LASSO)筛选出与铁死亡诱导剂敏感性显著相关的基因，并利用逻辑(Logistic)回归构建评分Predictive value，通过受试者工作曲线(ROC)分析得到实体肿瘤细胞中Predictive value相应的最佳界值，可用于预测实体肿瘤细胞对常用铁死亡药物的敏感度。该发明通过利用基因组合物表达量来预测实体肿瘤细胞对常用铁死亡药物的敏感度，具有灵敏度高，特异性好的优点，有较好的应用前景。
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公开(公告)号：CN110669844A
公开(公告)日：2020-01-10
申请号：CN201911117779.4
申请日：2019-11-15
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886
摘要： 本发明公开了一种用于检测培美曲塞+顺铂治疗适用性的试剂盒，其包括：hsa-miR-6077检测体系，记载用于确定hsa-miR-6077表达量高/低分界标准的数学模型的载体，当生物样本中hsa-miR-6077表达量不高于所述标准时，提示患者对培美曲塞+顺铂治疗敏感；反之当高于所述标准时，提示患者对培美曲塞+顺铂治疗不敏感。本发明的试剂盒能够用于判断肺腺癌患者是否适合采用培美曲塞+顺铂联合治疗方案，从而实现精准医疗。
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公开(公告)号：CN115341022A
公开(公告)日：2022-11-15
申请号：CN202210953535.5
申请日：2022-08-10
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6876 , C12Q1/6869 , G16B25/10 , G16B40/20
摘要： 本发明公开了一种检测实体肿瘤细胞铁死亡评分的试剂盒。该试剂盒包括检测一组miRNA的表达量的试剂和说明书。本发明利用R语言gsva函数计算出740种实体肿瘤细胞的铁死亡评分，进而运用miRNA测序、套索算法筛选出与铁死亡评分显著相关的miRNA，并利用二分类逻辑回归分析构建评分Score，通过受试者工作曲线(ROC)分析得到Score相应的最佳界值，可用于预测实体肿瘤细胞的铁死亡评分。该发明通过利用miRNA组合物的表达量来实现对实体肿瘤细胞铁死亡评分的预测，解决了GSVA算法对单个或者数量较少的样本适用性较差的问题，经验证发现该检测方法具有灵敏度高，特异性好的优点。
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公开(公告)号：CN113151479B
公开(公告)日：2022-09-20
申请号：CN202110511263.9
申请日：2021-05-11
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886
摘要： 本发明涉及分子诊断技术领域，具体是一种检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因(CDKN2A、CCND1、CCNE1、CDK4、RB1)突变的组合物及其应用，所述组合物由检测相关基因表达量的试剂组成。本发明通过运用RNA测序、LASSO和二分类Logistic回归筛选与细胞周期进展通路相关的基因，并构建评分Score，通过ROC分析得到肺腺癌中Score相应的截断值，可用于肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的预测。该发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变，经验证发现该预测方法具有准确性高，特异性好的优点，有很好的应用前景。
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公开(公告)号：CN113151471B
公开(公告)日：2022-08-12
申请号：CN202110465786.4
申请日：2021-04-28
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12N15/11
摘要： 本发明用于检测肺腺癌KRAS突变的基因组合物、试剂盒和方法，属于分子诊断技术领域。其中，基因组合物由以下25种基因组成：ELN、PODN、LAMC3、COL5A3、CRYAB、SOX18、AKT3、FAM101B、TIE1、SH3PXD2A、EXOC3L2、NOTCH1、NDST1、MMRN2、SH3RF3、ZMIZ1、RNF122、FLT4、F10、TLN1、SOX17、PIP5K1C、TMEM255B、WSCD1和PCDHB3。本发明中通过上述基因组合物构建Score评分模型用于检测肺腺癌KRAS突变，具有准确性高、灵敏度和特异性好的优点，操作便捷且可定量分析，应用前景广阔。
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公开(公告)号：CN113151479A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110511263.9
申请日：2021-05-11
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886
摘要： 本发明涉及分子诊断技术领域，具体是一种检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因(CDKN2A、CCND1、CCNE1、CDK4、RB1)突变的组合物及其应用，所述组合物由检测相关基因表达量的试剂组成。本发明通过运用RNA测序、LASSO和二分类Logistic回归筛选与细胞周期进展通路相关的基因，并构建评分Score，通过ROC分析得到肺腺癌中Score相应的截断值，可用于肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的预测。该发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变，经验证发现该预测方法具有准确性高，特异性好的优点，有很好的应用前景。
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公开(公告)号：CN107488722B
公开(公告)日：2020-08-21
申请号：CN201710839068.2
申请日：2017-09-18
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886
摘要： 本发明提供了任意一种或两种以上的长链非编码RNA在制备用于诊断肺腺癌的试剂中的用途，所述LncRNA为LINC00942、LINC00973、AFAP1‑AS1或者CLDN10‑AS1。所述的LINC00942长链非编码RNA的cDNA序列如SEQ ID NO.15所示。所述的LINC00973长链非编码RNA的cDNA序列如SEQ ID NO.16所示。所述的AFAP1‑AS1长链非编码RNA的cDNA序列如SEQ ID NO.17所示。所述的CLDN10‑AS1长链非编码RNA的cDNA序列如SEQ ID NO.18所示。本发明可应用于肺腺癌的诊断。
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公开(公告)号：CN113564259A
公开(公告)日：2021-10-29
申请号：CN202111020869.9
申请日：2021-09-01
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12N15/113
摘要： 本发明公开了一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型。本发明通过运用RNA测序、套索算法(LASSO)和二分类Logistic回归获得与细胞周期通路状态高度相关的ncRNA，并构建评分score，进而通过受试者工作曲线(ROC)分析得到肺腺癌中score相应的截断值，可用于预测肺腺癌细胞周期通路相关基因突变。本发明的预测模型经验证在应用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变中具有灵敏度高，特异性强的优点，具有较好的应用前景。
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