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公开(公告)号:CN113444793A
公开(公告)日:2021-09-28
申请号:CN202110597293.6
申请日:2021-05-31
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B20/50
摘要: 本发明涉及检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒,所述试剂盒含有检测以下基因表达量的检测试剂:RP11‑539L10.2、AKR1C2、RP11‑572H4.1、TRIM16L、RARA、SESN2、RP5‑827L5.2、CTD‑2139B15.5、Metazoa_SRP、snoU13、RP11‑545H22.1、KRT8P30、TALDO1、TRAPPC13P1、GS1‑388B5.2、RP11‑267L5.1、TRAV11、RP11‑699A7.1、AL132671.1。与现有技术相比,本发明通过运用RNA测序、LASSO和二分类Logistic回归筛选与抗氧化应激通路相关的基因,并构建评分Score,通过ROC曲线分析得到肺腺癌中相应评分的截断值,可用于肺腺癌中抗氧化应激通路相关基因(KEAP1、NFE2L2、CUL3)突变的预测。该发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变,经TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库,实验以及多组学数据库验证,发现该预测方法具有准确性高,特异性好的优点,有很好的应用前景。
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公开(公告)号:CN113637748A
公开(公告)日:2021-11-12
申请号:CN202110731156.7
申请日:2021-06-29
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , G16B40/20
摘要: 本发明提供了一种用于预测肿瘤患者顺铂敏感性的试剂盒,该试剂盒包含:miRcute miRNA提取分离试剂盒、TruSeq miRNA Sample Prep Kitv2试剂盒和TruSeq SR Cluster Kitv3‑cBot–HS试剂盒。本发明提供的用于预测肿瘤患者顺铂敏感性的试剂盒,在数十例人肺腺癌组织和正常对照组织中进行验证,确定miR‑215‑5p,miR‑1283,miR‑129‑1‑3p,miR‑126‑3p,miR‑199b‑5p较目前其他预测顺铂敏感性的参数有着更高的稳定性和应用价值。
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公开(公告)号:CN112760381B
公开(公告)日:2022-11-01
申请号:CN202110170365.9
申请日:2021-02-08
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , C12N15/113
摘要: 本发明涉及分子诊断技术领域,具体是一种检测肺腺癌预后的miRNA试剂盒,所述试剂盒包括检测分子组合物表达量的试剂。本发明运用miRNA测序、Lasso回归筛选与细胞增殖、预后有关的miRNA,构建预后评分Score,通过logistic回归获取得到肺腺癌中score相应的截断值,可用于肺腺癌预后的检测。通过实验验证,发现该方法具有准确性高、特异性好的优点,有很好的应用前景。
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公开(公告)号:CN113444793B
公开(公告)日:2022-09-23
申请号:CN202110597293.6
申请日:2021-05-31
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B20/50
摘要: 本发明涉及检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒,所述试剂盒含有检测以下基因表达量的检测试剂:RP11‑539L10.2、AKR1C2、RP11‑572H4.1、TRIM16L、RARA、SESN2、RP5‑827L5.2、CTD‑2139B15.5、Metazoa_SRP、snoU13、RP11‑545H22.1、KRT8P30、TALDO1、TRAPPC13P1、GS1‑388B5.2、RP11‑267L5.1、TRAV11、RP11‑699A7.1、AL132671.1。本发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变,经TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库,实验以及多组学数据库验证,发现该预测方法具有准确性高,特异性好的优点,有很好的应用前景。
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公开(公告)号:CN112760381A
公开(公告)日:2021-05-07
申请号:CN202110170365.9
申请日:2021-02-08
申请人: 复旦大学附属中山医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , C12N15/113
摘要: 本发明涉及分子诊断技术领域,具体是一种检测肺腺癌预后的miRNA试剂盒,所述试剂盒包括检测分子组合物表达量的试剂。本发明运用miRNA测序、Lasso回归筛选与细胞增殖、预后有关的miRNA,构建预后评分Score,通过logistic回归获取得到肺腺癌中score相应的截断值,可用于肺腺癌预后的检测。通过实验验证,发现该方法具有准确性高、特异性好的优点,有很好的应用前景。
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