公开(公告)号：CN118703680A

公开(公告)日：2024-09-27

申请号：CN202410959105.3

申请日：2024-07-17

Applicant: 华南农业大学 ,  广东兆华航天育种创新研究院

Inventor： 沈任佳 ,  郭涛 ,  孙凯 ,  王慧 ,  黄翠红 ,  周丹华 ,  王加峰 ,  肖武名 ,  杨瑰丽 ,  王键宽 ,  吴满 ,  陈志强

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  G16B20/20

Abstract: 本发明提供了一种检测水稻单细胞基因序列变异的方法及其应用，属于农业技术领域。本发明中的方法主要包括取样、测序和生信分析三方面，其中取样获取的是单个水稻小孢子性细胞。本发明成功分离出单个水稻小孢子性细胞，并对已有水稻单细胞变异检测技术流程所存在的完整性不强、检测连贯性有待提升等缺陷进行了完善，此外还通过重离子诱变技术，鉴定确认了变异位点的真实性。本发明中的方法拓宽了水稻单细胞诱变材料的来源范围，为创制更多样的育种材料、进行更高效的诱变育种提供了新的思路和方法。同时小孢子性细胞作为雄配子，基因组携带的突变能够通过杂交进入子代，可实现变异的遗传和固定，也为优异变异基因的快速利用提供了途径。

公开(公告)号：CN110343781B

公开(公告)日：2021-03-30

申请号：CN201910718870.5

申请日：2019-08-05

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 郭涛 ,  陈淳 ,  周丹华 ,  黄翠红 ,  严贤诚 ,  孙凯 ,  王慧 ,  陈志强

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6848

Abstract: 本发明公开了一种水稻Wx基因突变的鉴定方法，包括：提取待测水稻植株基因组构建DNA混合池，同时提取对照水稻植株的基因组DNA；针对Wx基因设计4对巢式PCR引物；以待测水稻植株基因组构建的DNA混合池和对照水稻植株的基因组DNA为模板分别进行巢式PCR；对PCR产物进行HRM分析，确定疑似突变混合池；分别提取疑似突变混合池对应的单株DNA，将单株DNA与对照植株DNA混合进行巢式PCR，扩增产物进行HRM分析获得疑似突变单株，以其DNA为模板进行PCR并进行琼脂糖凝胶电泳鉴定。本发明将TILLING技术与HRM检测手段相结合应用于水稻Wx基因的突变筛选，为水稻诱变后代高效定向筛选提供了新思路。

公开(公告)号：CN111647679A

公开(公告)日：2020-09-11

申请号：CN202010429741.7

申请日：2020-05-20

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 郭涛 ,  黄翠红 ,  孙凯 ,  周丹华 ,  陈淳 ,  黄明 ,  杨瑰丽 ,  王加峰 ,  王慧 ,  陈志强

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了一种基于HRM的水稻全基因组SNP标记开发的方法及应用，涉及分子标记开发技术领域。本发明利用水稻SNP信息数据库HapRice以及RICE6K，挖掘基于HRM技术的全基因组SNP分子标记。利用本发明所述方法开发出599个基于HRM技术的SNP分子标记，并构建覆盖水稻12条染色体的HRM-SNP分子标记图谱，该图谱标记密度达到1.60个SNP/Mb，任一SNP标记至少在2个实验材料之间表现有多态性，利用该套标记将一个斑点叶基因Spl32(t)定位于水稻第11号染色体的22.35Mb～24.07Mb之间。

公开(公告)号：CN110343781A

公开(公告)日：2019-10-18

申请号：CN201910718870.5

申请日：2019-08-05

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 郭涛 ,  陈淳 ,  周丹华 ,  黄翠红 ,  严贤诚 ,  孙凯 ,  王慧 ,  陈志强

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6848

Abstract: 本发明公开了一种水稻Wx基因突变的鉴定方法，包括：提取待测水稻植株基因组构建DNA混合池，同时提取对照水稻植株的基因组DNA；针对Wx基因设计4对巢式PCR引物；以待测水稻植株基因组构建的DNA混合池和对照水稻植株的基因组DNA为模板分别进行巢式PCR；对PCR产物进行HRM分析，确定疑似突变混合池；分别提取疑似突变混合池对应的单株DNA，将单株DNA与对照植株DNA混合进行巢式PCR，扩增产物进行HRM分析获得疑似突变单株，以其DNA为模板进行PCR并进行琼脂糖凝胶电泳鉴定。本发明将TILLING技术与HRM检测手段相结合应用于水稻Wx基因的突变筛选，为水稻诱变后代高效定向筛选提供了新思路。

公开(公告)号：CN110029187A

公开(公告)日：2019-07-19

申请号：CN201910355843.6

申请日：2019-04-29

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 郭涛 ,  陈志强 ,  王慧 ,  刘永柱 ,  王加峰 ,  肖武名 ,  黄明 ,  杨瑰丽 ,  黄翠红 ,  周丹华 ,  陈淳 ,  孙凯

IPC: C12Q1/6895

Abstract: 本发明提供了一种基于竞争性等位PCR构建水稻分子标记图谱的方法及利用图谱进行育种的应用，属农业技术领域。本发明通过对水稻进行全基因重组测序，并对重组测序数据SNP挖掘，寻找SNP位点；基于SNP位点结合现有SNP数据库，获得育种所需的565个SNP位点；利用挑选出的565个SNP位点进行分子标记，构建出水稻分子标记的图谱。本发明构建的水稻分子标记图谱的SNP标记物理位置清晰、检测方法简便，可直接用于部分重要农艺性状的分子鉴定和遗传背景分析，对于提升水稻分子育种效率具有重要应用价值。