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公开(公告)号：CN118942538A
公开(公告)日：2024-11-12
申请号：CN202410989243.6
申请日：2024-07-23
摘要： 本申请公开了一种B型流感病毒抗原性快速鉴别方法、装置、终端及介质。本申请首先基于现有B型流感病毒Victoria谱系和Yamagata谱系毒株的血凝抑制试验数据分别判断两个谱系内部不同毒株之间的抗原关系，然后，基于两两毒株的血凝素蛋白上的HA1片段之间氨基酸序列的差异确定了四组与抗原改变相关的特征，分别是与抗原表位、物理化学性质、受体结合区域和氮糖基化改变有关的特征。基于以上四组特征，使用机器学习算法分别构建针对Victoria和Yamagata谱系的抗原关系预测模型，并应用于预测对应谱系内部任意两个毒株之间的抗原关系，可以实现对B型流感两个谱系病毒抗原性的快速预测。
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公开(公告)号：CN118629517A
公开(公告)日：2024-09-10
申请号：CN202410950802.2
申请日：2024-07-16
申请人： 中山大学 , 中山大学·深圳 , 深圳市光明区疾病预防控制中心
摘要： 本发明公开了一种用于新冠病毒易感性的预测标志物以及预测方法、装置，用于解决现有相关方法中存在的生物标志物发现不稳定、风险预测局限性较大、可行性较低的问题。方法包括：首先提供一种用于新冠病毒易感性的预测标志物，所述预测标志物为基于人体血液样本进行提取的差异性表达基因组；其次提供一种相应的新冠病毒易感性的预测方法，获取待测血液样本，并从待测血液样本中提取待测PBMC样本；从基因表达谱中提取预测标志物在待测PBMC样本中的待测基因表达数据；将待测基因表达数据输入至预训练的新冠易感预测模型进行易感风险判断，获得待测血液样本所对应人体的新冠易感风险评估结果，从而简单快速且准确地预测人体新冠易感风险。
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公开(公告)号：CN118782148A
公开(公告)日：2024-10-15
申请号：CN202410988849.8
申请日：2024-07-23
摘要： 本发明公开了一种新型冠状病毒毒株抗原性快速鉴别方法及装置，用于解决现有相关技术中存在的时间经济成本较高，突变分析不够及时准确的技术问题。所述方法包括：获取新型冠状病毒的多组毒株对序列，以及每一组毒株对序列各自对应的多位抗原描述符；基于多个多位抗原描述符，将多组毒株对序列转换为抗原描述数据集，并根据抗原描述数据集，通过模型训练获得抗原关系预测模型；获取毒株序列信息，并对毒株序列信息进行层级采样，获得待测序列信息；采用抗原关系预测模型对待测序列信息进行抗原相似性预测，获得待测序列信息中多个毒株两两之间抗原相似关系的预测结果。
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公开(公告)号：CN116344067A
公开(公告)日：2023-06-27
申请号：CN202310108655.X
申请日：2023-01-17
摘要： 本发明公开了流感易感标志物和基于该标志物的流感高危人群预测模型的构建方法与应用，该流感易感标志物为“AMFR”、“HBQ1”、“DHRS9”、“SLC35E2A”、“BANK1”、“CD79A”、“TXNDC5”、“H2BC5”和“PRKY”的组合。该标志物和基于其建立的流感风险预测模型是基于健康成年人基线水平转录组的数据得到的，能够用于筛选健康成年人中甲型流感H3N2易感个体，AUC为0.94、准确度为0.91、精确度为1、召回率为0.75、F1评分为0.86，具有较好的准确度。
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公开(公告)号：CN117912568B
公开(公告)日：2024-08-06
申请号：CN202410020894.4
申请日：2024-01-05
IPC分类号： G16B40/00 , G16B20/20 , G16B20/50 , G16B30/00 , G16B50/30 , G16B45/00 , G06F18/23213 , G06F18/2431 , G06F18/20
摘要： 本发明公开了一种H9N2亚型禽流感毒株抗原性快速鉴别方法及装置，用于解决如何快速鉴别H9N2亚型禽流感毒株抗原性的技术问题。方法包括：获取H9N2亚型禽流感病毒的多组病毒对，确定每组病毒对的抗原关系，并基于抗原关系，采用多组病毒对构建预测数据集；对H9N2亚型禽流感病毒进行抗原表位系统定义，确定若干组抗原性影响特征；结合抗原关系以及若干组抗原性影响特征，构建抗原性预测模型，并采用预测数据集对抗原性预测模型进行训练，获得目标预测模型；获取待测抗原病毒数据，将其输入至目标预测模型进行抗原关系预测，并基于预测结果，对待测抗原病毒数据中多组病毒两两之间的抗原性进行鉴别。
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公开(公告)号：CN117912568A
公开(公告)日：2024-04-19
申请号：CN202410020894.4
申请日：2024-01-05
IPC分类号： G16B40/00 , G16B20/20 , G16B20/50 , G16B30/00 , G16B50/30 , G16B45/00 , G06F18/23213 , G06F18/2431 , G06F18/20
摘要： 本发明公开了一种H9N2亚型禽流感毒株抗原性快速鉴别方法及装置，用于解决如何快速鉴别H9N2亚型禽流感毒株抗原性的技术问题。方法包括：获取H9N2亚型禽流感病毒的多组病毒对，确定每组病毒对的抗原关系，并基于抗原关系，采用多组病毒对构建预测数据集；对H9N2亚型禽流感病毒进行抗原表位系统定义，确定若干组抗原性影响特征；结合抗原关系以及若干组抗原性影响特征，构建抗原性预测模型，并采用预测数据集对抗原性预测模型进行训练，获得目标预测模型；获取待测抗原病毒数据，将其输入至目标预测模型进行抗原关系预测，并基于预测结果，对待测抗原病毒数据中多组病毒两两之间的抗原性进行鉴别。
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公开(公告)号：CN111533790A
公开(公告)日：2020-08-14
申请号：CN202010387460.X
申请日：2020-05-09
申请人： 中山大学
IPC分类号： C07K14/165 , C07K19/00 , A61K39/215 , A61P31/14 , A61P11/00
摘要： 本发明提供了基于马赛克策略的冠状病毒抗原的构建方法及其应用，所述方法包括：(1)对人冠状病毒的天然结构蛋白进行分析，获取天然结构蛋白上存在的细胞毒性T淋巴细胞表位；(2)采用马赛克策略对人冠状病毒的结构蛋白进行分析，去除在天然结构蛋白中出现次数低的罕见表位后，获得由短肽组装形成的冠状病毒抗原。本发明基于人工智能算法对所有已知的CoV基因组序列进行大数据分析，基于马赛克策略设计新型抗原序列；新型抗原覆盖了所有已知的7种HCoVs上的天然S、M、N、E蛋白的大部分CTL表位，并与天然蛋白具有很好的结构相似性，在制备冠状病毒通用疫苗方面具有潜在的应用前景和价值。
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公开(公告)号：CN113284555B
公开(公告)日：2023-08-22
申请号：CN202110653805.6
申请日：2021-06-11
申请人： 中山大学
摘要： 本发明实施例公开了一种基因突变网络的构建方法、装置、设备及存储介质，所述方法包括：获取各毒株序列的基因序列数据，根据各毒株序列的基因序列数据确定各毒株序列之间的突变概率；根据各毒株序列之间的突变概率构建至少一个初始子网络；遍历各初始子网络，将两两初始子网络之间的全局最大突变概率的毒株序列对连接，得到连通网络；基于毒株序列的采样时间确定根毒株序列，根据连通网络的连通路径以及各毒株序列与根毒株序列的突变概率确定连通网络的网络方向，得到基因突变网络。本发明实施例提供的方法通过构建拓扑结构的基因突变网络，保留了更多进化与拓扑信息，所需参数少，构建方便、节省算力。
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公开(公告)号：CN113284555A
公开(公告)日：2021-08-20
申请号：CN202110653805.6
申请日：2021-06-11
申请人： 中山大学
摘要： 本发明实施例公开了一种基因突变网络的构建方法、装置、设备及存储介质，所述方法包括：获取各毒株序列的基因序列数据，根据各毒株序列的基因序列数据确定各毒株序列之间的突变概率；根据各毒株序列之间的突变概率构建至少一个初始子网络；遍历各初始子网络，将两两初始子网络之间的全局最大突变概率的毒株序列对连接，得到连通网络；基于毒株序列的采样时间确定根毒株序列，根据连通网络的连通路径以及各毒株序列与根毒株序列的突变概率确定连通网络的网络方向，得到基因突变网络。本发明实施例提供的方法通过构建拓扑结构的基因突变网络，保留了更多进化与拓扑信息，所需参数少，构建方便、节省算力。
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