本发明公开了一种H9N2亚型禽流感毒株抗原性快速鉴别方法及装置，用于解决如何快速鉴别H9N2亚型禽流感毒株抗原性的技术问题。方法包括：获取H9N2亚型禽流感病毒的多组病毒对，确定每组病毒对的抗原关系，并基于抗原关系，采用多组病毒对构建预测数据集；对H9N2亚型禽流感病毒进行抗原表位系统定义，确定若干组抗原性影响特征；结合抗原关系以及若干组抗原性影响特征，构建抗原性预测模型，并采用预测数据集对抗原性预测模型进行训练，获得目标预测模型；获取待测抗原病毒数据，将其输入至目标预测模型进行抗原关系预测，并基于预测结果，对待测抗原病毒数据中多组病毒两两之间的抗原性进行鉴别。