公开(公告)号：CN118629517A

公开(公告)日：2024-09-10

申请号：CN202410950802.2

申请日：2024-07-16

申请人： 中山大学 ,  中山大学·深圳 ,  深圳市光明区疾病预防控制中心

发明人： 杜向军 ,  王铁强 ,  辛玉婷 ,  唐静 ,  易超 ,  汪东篱 ,  陈小良 ,  冯镜儒 ,  张洁 ,  杜海荣

IPC分类号： G16B40/20 ,  G16B20/20 ,  G16B35/20 ,  G16H50/30 ,  G16H50/80

摘要： 本发明公开了一种用于新冠病毒易感性的预测标志物以及预测方法、装置，用于解决现有相关方法中存在的生物标志物发现不稳定、风险预测局限性较大、可行性较低的问题。方法包括：首先提供一种用于新冠病毒易感性的预测标志物，所述预测标志物为基于人体血液样本进行提取的差异性表达基因组；其次提供一种相应的新冠病毒易感性的预测方法，获取待测血液样本，并从待测血液样本中提取待测PBMC样本；从基因表达谱中提取预测标志物在待测PBMC样本中的待测基因表达数据；将待测基因表达数据输入至预训练的新冠易感预测模型进行易感风险判断，获得待测血液样本所对应人体的新冠易感风险评估结果，从而简单快速且准确地预测人体新冠易感风险。

公开(公告)号：CN118782148A

公开(公告)日：2024-10-15

申请号：CN202410988849.8

申请日：2024-07-23

申请人： 中山大学 ,  中山大学·深圳 ,  深圳市宝安区疾病预防控制中心(深圳市宝安区卫生检验中心、深圳市宝安区职业病防治所)

发明人： 杜向军 ,  陈亿雄 ,  冯镜儒 ,  韩文杰 ,  任萌 ,  翟珂 ,  张弛 ,  陈绎霖 ,  龙浩雨 ,  程佩文 ,  张晟 ,  王梓琪

IPC分类号： G16B30/10 ,  G16B40/20 ,  G16B40/30 ,  G16B20/30

摘要： 本发明公开了一种新型冠状病毒毒株抗原性快速鉴别方法及装置，用于解决现有相关技术中存在的时间经济成本较高，突变分析不够及时准确的技术问题。所述方法包括：获取新型冠状病毒的多组毒株对序列，以及每一组毒株对序列各自对应的多位抗原描述符；基于多个多位抗原描述符，将多组毒株对序列转换为抗原描述数据集，并根据抗原描述数据集，通过模型训练获得抗原关系预测模型；获取毒株序列信息，并对毒株序列信息进行层级采样，获得待测序列信息；采用抗原关系预测模型对待测序列信息进行抗原相似性预测，获得待测序列信息中多个毒株两两之间抗原相似关系的预测结果。

公开(公告)号：CN118942538A

公开(公告)日：2024-11-12

申请号：CN202410989243.6

申请日：2024-07-23

申请人： 中山大学 ,  广州国家实验室

发明人： 杜向军 ,  蒋太交 ,  韩文杰 ,  苗智超 ,  程佩文 ,  翟珂 ,  曾金锋 ,  冯镜儒 ,  张弛 ,  陈绎霖

IPC分类号： G16B20/30 ,  G16B40/30

摘要： 本申请公开了一种B型流感病毒抗原性快速鉴别方法、装置、终端及介质。本申请首先基于现有B型流感病毒Victoria谱系和Yamagata谱系毒株的血凝抑制试验数据分别判断两个谱系内部不同毒株之间的抗原关系，然后，基于两两毒株的血凝素蛋白上的HA1片段之间氨基酸序列的差异确定了四组与抗原改变相关的特征，分别是与抗原表位、物理化学性质、受体结合区域和氮糖基化改变有关的特征。基于以上四组特征，使用机器学习算法分别构建针对Victoria和Yamagata谱系的抗原关系预测模型，并应用于预测对应谱系内部任意两个毒株之间的抗原关系，可以实现对B型流感两个谱系病毒抗原性的快速预测。