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公开(公告)号：CN102838751B
公开(公告)日：2014-12-10
申请号：CN201210311659.X
申请日：2012-08-29
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于分子胶的两亲性嵌段共聚物自组装胶束及其用途。所述共聚物结构式如下：其中，n为2～225中的任意一个整数，m为0～135中的任意一个整数。将该两亲性嵌段共聚物在水性溶液中自组装即得两亲性嵌段共聚物胶束。该胶束作为药物载体,可用于包裹疏水性药物。本发明采用有机合成的方法在聚合物PEG(聚乙二醇)，PLA（聚乳酸）大分子中分别引入具有氢键序列特异性的分子胶单链，从而通过形成分子胶双链可选择性的高效合成一系列两亲性嵌段共聚物，合成所需原料简单易得，合成过程均为常规反应，适合较大规模生产。
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公开(公告)号：CN104031268A
公开(公告)日：2014-09-10
申请号：CN201410196559.6
申请日：2014-05-09
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种聚乙烯亚胺三嵌段共聚物及其在基因载体中的用途；所述共聚物PEI-PLA-PEG的结构式如下所示：其中，PEG的分子量为2000～10000g/mol中的任意一个整数，PLA的分子量为3000～10000g/mol，PEI的分子量为1800～10000g/mol。该嵌段共聚物可以自组装成纳米胶束作为基因载体应用于基因药物输送体系，在负载基因药物的同时还可以包裹疏水小分子药物，从而成为基因/疏水药物的双重载体。
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公开(公告)号：CN103911449A
公开(公告)日：2014-07-09
申请号：CN201410138517.7
申请日：2014-04-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2563/143 , C12Q2525/173 , C12Q2525/131
Abstract: 本发明涉及一种检测RNA？PAS（Poly？A？Site）的方法，提供了一种基于3T-seq全基因组范围分析APA的方法，包括含有oligo？dT的磁珠制备，即将5'端生物素修饰的oligo？dT引物与带链霉亲和素的磁珠混合结合；用所述磁珠与总RNA混合，筛选含有Poly？A的RNA；逆转录，双链cDNA第二链合成，双链cDNA断裂；移除Poly？A结构；末端修饰后连接测序接头；文库回收。该方法减少了RNA水平操作，在DNA水平移除Poly？A序列，消除Poly结构对测序的影响；选择双链DNA断裂酶处理，在不影响文库质量的基础上在DNA水平断裂；简化实验流程，降低实验难度和造价，使其应用范围更广。
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公开(公告)号：CN102516208B
公开(公告)日：2014-06-18
申请号：CN201110331659.1
申请日：2011-10-27
Applicant: 上海交通大学 , 华东理工大学 , 深圳华因康基因科技有限公司
IPC: C07D307/20 , C07D309/10 , C08G65/00 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种可裂解连接单元及其合成方法与用途。可裂解连接单元的结构式为：，其中，n为1或2，m为0～20中的任意一个整数，k为1～20中的任意一个整数。该可裂解连接单元可用于DNA合成测序。与现有技术相比，本发明的化合物合成原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，易于实现大量合成；该类化合物可与核苷酸和荧光素实现高效率的连接；通过研究该类化合物的裂解性能，发现该类化合物在温和的条件下可以实现高效率的完全裂解，可应用于DNA测序。
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公开(公告)号：CN103709410A
公开(公告)日：2014-04-09
申请号：CN201310643667.9
申请日：2013-12-03
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种酸敏感两亲性嵌段共聚物及其自组织胶束、用途；其结构式为式(I)所示：其中，n为1～300中的任意一个整数，m为1～100中的任意一个整数，R为式(II)、(III)、(IV)、(V)或(VI)所示的结构：其中，t＝1或2。本发明化合物合成原料简单易得，合成过程均为常规反应，反应条件温和，可以大量制备；由该类嵌段共聚物自组装而成的胶束可用于药物运输载体。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN103484106A
公开(公告)日：2014-01-01
申请号：CN201310401580.0
申请日：2013-09-05
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种四色荧光标记可逆终端及其在DNA测序中的用途；所述可逆终端的结构式如式(I)所示：(I)；其中，R1为三磷酸盐；R2为H或者OH；碱基为U，C，A，G或其衍生物；连接单元为在温和条件下可以断裂的双官能团化合物；荧光基团选自BODIPY、荧光素、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、alexa、squarene染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种。本发明的可逆终端可用于DNA单分子测序；同时，本发明的可逆终端的合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用，并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应要求，具备很好的实用前景。
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公开(公告)号：CN103175780A
公开(公告)日：2013-06-26
申请号：CN201310090802.1
申请日：2013-03-20
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N21/00
Abstract: 本发明提供了一种大尺度生物组织连续切片的成像系统，包括：图像获取单元，其获得所述连续切片的数字化图像；拼接单元，其对所述图像进行二维拼接从而形成大尺寸切片的完整图像；及控制单元，其控制所述图像获取单元自动进行成像并控制所述拼接单元自动进行拼接。所述控制单元控制图像获取单元自动连续获取所述切片的图像，并控制取所述拼接单元对由所述图像获取单元获取的连续切片图像进行拼接，从而获得试样完整的数字化图像。
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公开(公告)号：CN102838751A
公开(公告)日：2012-12-26
申请号：CN201210311659.X
申请日：2012-08-29
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于分子胶的两亲性嵌段共聚物自组装胶束及其用途。所述共聚物结构式如下：其中，n为2～225中的任意一个整数，m为0～135中的任意一个整数。将该两亲性嵌段共聚物在水性溶液中自组装即得两亲性嵌段共聚物胶束。该胶束作为药物载体,可用于包裹疏水性药物。本发明采用有机合成的方法在聚合物PEG(聚乙二醇)，PLA（聚乳酸）大分子中分别引入具有氢键序列特异性的分子胶单链，从而通过形成分子胶双链可选择性的高效合成一系列两亲性嵌段共聚物，合成所需原料简单易得，合成过程均为常规反应，适合较大规模生产。
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公开(公告)号：CN115527610B
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN202211396624.0
申请日：2022-11-09
Applicant: 上海交通大学 , 苏州京脉生物科技有限公司
Abstract: 本申请涉及一种单细胞组学数据的聚类分析方法，包括步骤：S1，将单细胞基因组学数据进行标准化预处理，获得预处理数据；S2，将S1的预处理数据进行多层次聚类，根据不断增加干扰条件来分析单细胞聚类的结构特征，再采用细胞聚类流向获得聚类结果；S3，对S2获得的聚类结果，采用罚函数计算聚类结果的稳定性分值，从而得到稳定性高的聚类结果；S4，根据S3获得的稳定性高的聚类结果的稳定性变化体系及对应的聚类数目出现的频次，得到最适聚类数目及细胞子群的类型和聚类结果。
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公开(公告)号：CN117050984A
公开(公告)日：2023-11-14
申请号：CN202311016746.7
申请日：2023-08-14
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明属于染色体提取技术领域，具体公开了一种简便高效的中期染色体提取的方法。具体是先将低渗细胞匀浆处理，离心除去较大杂质；PA buffer重悬后再经过两步滤膜过滤分别除去较大和中等杂质；然后加入NaCl和Triton X‑100高盐冰浴处理分离黏附杂质，离心去除剩余杂质。这样将离心与滤膜过滤方法结合，并辅以多胺缓冲液保护和高盐冰浴提纯，不仅避免了多次离心带来的染色体损害、结团问题以及滤膜过滤存在的染色体大量损失问题，使得本发明能够回收所有尺寸的染色体、回收率高、不破坏染色体形态，而且显著提升回收的染色体纯度，同时操作简单、耗时短、无需专用大型设备、成本低，易于推广应用。
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