公开(公告)号：CN117050984A

公开(公告)日：2023-11-14

申请号：CN202311016746.7

申请日：2023-08-14

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 叶碧姗 ,  张乐 ,  李鑫辉 ,  邵志峰

IPC: C12N15/10

Abstract: 本发明属于染色体提取技术领域，具体公开了一种简便高效的中期染色体提取的方法。具体是先将低渗细胞匀浆处理，离心除去较大杂质；PA buffer重悬后再经过两步滤膜过滤分别除去较大和中等杂质；然后加入NaCl和Triton X‑100高盐冰浴处理分离黏附杂质，离心去除剩余杂质。这样将离心与滤膜过滤方法结合，并辅以多胺缓冲液保护和高盐冰浴提纯，不仅避免了多次离心带来的染色体损害、结团问题以及滤膜过滤存在的染色体大量损失问题，使得本发明能够回收所有尺寸的染色体、回收率高、不破坏染色体形态，而且显著提升回收的染色体纯度，同时操作简单、耗时短、无需专用大型设备、成本低，易于推广应用。

公开(公告)号：CN119753092A

公开(公告)日：2025-04-04

申请号：CN202510033281.9

申请日：2025-01-09

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 李鑫辉 ,  张乐 ,  唐颖 ,  叶碧姗 ,  徐泽千 ,  刘金玲

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6876 ,  C40B50/06 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种高效获取中期染色体上核小体全基因组的定位和定量方法，包括：制备并富集中期细胞，通过离心滤膜整合式方法纯化中期染色体；采用优化的MNase buffer重悬中期染色体沉淀，保护中期染色体结构，保持核小体位置不变；加入MNase酶于低温(4℃)酶切反应；加EDTA终止酶切反应，获得中期染色体单核小体悬液；DNA提取和定量；可定量化的UMI接头结合DNA文库建库试剂盒进行文库构建，质量检测后测序和分析。本发明可以高效稳定获得中期细胞染色体上的单核小体，结合定量化建库和高通量测序技术实现中期染色体上核小体全基因组的定位和定量，结果稳健，定量精确。