一种黄牛NPM1基因插入突变多态性的检测方法

    公开(公告)号:CN101671725B

    公开(公告)日:2011-12-28

    申请号:CN200910024136.5

    申请日:2009-09-29

    Abstract: 本发明公开了一种黄牛NPM1基因插入突变多态性的检测方法,包括以下步骤:1)以包含NPM1基因的待测黄牛基因组为模版,以引物P为引物进行PCR扩增;2)将PCR扩增后的片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,200V电压电泳50~60min后EB染色;3)根据聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果对NPM1基因插入突变多态性进行分型。本发明提供一种与经济性状关联的黄牛NPM1基因多态性检测方法,针对NPM1基因编码区位点上存在的12bp的插入突变导致编码蛋白构象发生变化的基因多态性,通过设定特定引物PCR扩增后,根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果对其基因型分型,为检测中国地方黄牛NPM1基因遗传变异提供了技术支持。

    一种检测黄牛Dapperl基因单核苷酸多态性的方法

    公开(公告)号:CN102206706A

    公开(公告)日:2011-10-05

    申请号:CN201110062694.8

    申请日:2011-03-18

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛Dapper1基因单核苷酸多态性的方法,以包含Dapper1基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P(P1、P2、P3、P4)为引物,PCR扩增黄牛Dapper1基因;用限制性内切酶MspI、HindII、NcoI、HhaI分别消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛Dapper1基因第8344位、第8428位、第10513位、第10765位的单核苷酸多态性。本发明提供的检测方法为Dapper1基因的单核苷酸多态性与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种检测黄牛SH2B1基因单核苷酸多态性的方法

    公开(公告)号:CN102094081A

    公开(公告)日:2011-06-15

    申请号:CN201010236903.1

    申请日:2010-07-26

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SH2B1基因单核苷酸多态性的方法,以包含SH2B1基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛SH2B1基因;用限制性内切酶BglI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SH2B1基因第2795位的单核苷酸多态性。由于SH2B1基因功能涉及体重、日增重、体斜长和胸围4个重要的生长性状,本发明提供的检测方法为SREBPlc基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种检测黄牛ANGPTL4基因单核苷酸多态性的方法

    公开(公告)号:CN101921856A

    公开(公告)日:2010-12-22

    申请号:CN201010255658.9

    申请日:2010-08-18

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛ANGPTL4基因单核苷酸多态性的方法,以包含ANGPTL4基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛ANGPTL4基因;用限制性内切酶MspI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定黄牛ANGPTL4基因第1422位的单核苷酸多态性。由于ANGPTL4基因功能涉及体重、日增重、体斜长和胸围4个重要的生长性状,本发明提供的检测方法为ANGPTL4基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种奶山羊weaver基因的单核苷酸多态性及其检测方法

    公开(公告)号:CN101871006A

    公开(公告)日:2010-10-27

    申请号:CN201010003635.9

    申请日:2010-01-05

    Abstract: 本发明公开了一种奶山羊weaver基因的单核苷酸多态性及其检测方法,其基因多态性包括:在奶山羊的weaver基因第99045位为T或C的碱基多态性;在奶山羊的weaver基因第99116位为T或C的碱基多态性。上述奶山羊weaver基因的单核苷酸多态性为:以包含weaver基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增奶山羊weaver基因;用限制性内切酶消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定奶山羊的单核苷酸多态性。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记,可用于奶山羊的分子育种。

    鸡内脂素基因9bpindel多态性检测方法及其应用

    公开(公告)号:CN101805787A

    公开(公告)日:2010-08-18

    申请号:CN200910227401.X

    申请日:2009-12-09

    Abstract: 本发明涉及一种鸡内脂素基因9bp indel多态性检测方法及其应用,所述的检测方法包括以鸡内脂素基因9bp indel位点的位置设计引物;然后进行PCR扩增;通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测该基因9bp indel多态性,9bp缺失时为DD基因型,9bp插入时为II基因型,该位点杂合的个体为ID基因型。利用上述检测结果结合鸡经济性状进行关联分析,用于鸡的辅助选择和分子育种。本发明的检测方法无需酶切,节约成本和时间;使用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,克服了琼脂糖电泳对小片段核苷酸差异检测的局限性;该方法不仅分辨率高,检测灵敏,判型准确,且该凝胶对染色方法也没有要求,溴化乙啶(EB)染色和银染均可。

    一种黄牛NPM1基因插入突变多态性的检测方法

    公开(公告)号:CN101671725A

    公开(公告)日:2010-03-17

    申请号:CN200910024136.5

    申请日:2009-09-29

    Abstract: 本发明公开了一种黄牛NPM1基因插入突变多态性的检测方法,包括以下步骤:1)以包含NPM1基因的待测黄牛基因组为模版,以引物P为引物进行PCR扩增;2)将PCR扩增后的片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,200V电压电泳50~60min后EB染色;3)根据聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果对NPM1基因插入突变多态性进行分型。本发明提供一种与经济性状关联的黄牛NPM1基因多态性检测方法,针对NPM1基因编码区位点上存在的12bp的插入突变导致编码蛋白构象发生变化的基因多态性,通过设定特定引物PCR扩增后,根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果对其基因型分型,为检测中国地方黄牛NPM1基因遗传变异提供了技术支持。

    一种检测黄牛Six6基因单核苷酸多态性的方法

    公开(公告)号:CN101629209A

    公开(公告)日:2010-01-20

    申请号:CN200910023595.1

    申请日:2009-08-14

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛Six6基因单核苷酸多态性的方法,以包含Six6基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛Six6基因;用限制性内切酶HhaI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定黄牛Six6基因第2015位的单核苷酸多态性;由于Six6基因功能涉及日增重、体高、体重、体斜长、坐骨端宽等生长性状,本发明提供的检测方法为Six6基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种检测山羊催乳素基因单核苷酸多态性的PCR-RFLP方法

    公开(公告)号:CN101063169A

    公开(公告)日:2007-10-31

    申请号:CN200710017973.6

    申请日:2007-06-04

    Abstract: 本发明公开了一种快速检测山羊催乳素(PRL)基因单核苷酸多态性(SNP)的PCR-RFLP(聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性)方法,该方法是以山羊基因组DNA或包含PRL基因的DNA序列为模板,在Taq DNA聚合酶、Buffer(缓冲环境)、Mg++、dNTPs存在的情况下,利用1对PCR(聚合酶链式反应)引物,在PCR条件下进行扩增,然后利用限制性内切酶对其进行酶切,再根据琼脂糖凝胶电泳对其进行片段大小分离,利用凝胶成像系统分析其片段大小,从而确定其单核苷酸多态性。该方法操作简单、快速,成本低,而且检测的精确度高,便于推广应用。

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