公开(公告)号：CN106699882B

公开(公告)日：2019-11-15

申请号：CN201611018055.0

申请日：2016-11-18

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 余梅 ,  杨万宝 ,  肖玉净 ,  李新云 ,  李小平 ,  曹建华 ,  赵书红

IPC: C07K16/18 ,  C12N15/10 ,  G01N33/68

Abstract: 本发明涉及一种KAP13‐1基因在绵羊毛纤维细度鉴定中的应用。根据牛KAP13‐1基因设计引物，以绵羊皮肤cDNA为模板，RT‐PCR绵羊KAP13‐1基因片段；根据绵羊KAP13‐1基因的氨基酸序列制备多克隆抗体，用免疫组化检测KAP13‐1基因在绵羊毛囊中表达量；(3)利用2A肽序列构建绵羊启动子驱动的共表达绵羊KAP13‐1和绿荧光蛋白的重组载体；以KAP13‐1基因和ZsGreen1‐1载体中绿荧光蛋白基因设计引物；融合PCR得到KAP13‐1‐2A‐ZSG，用连接酶将KAP13‐1‐2A‐ZSG连接到双酶切载体中；以绵羊脾脏基因组为模板扩增KAP11‐1基因启动子，酶切连接到中间载体中获重组载体(4)用重组载体转化昆明小鼠，鉴定转基因阳性小鼠毛纤维皮质部中的表达量，并检测距离毛囊底部130μm处毛纤维的直径。

公开(公告)号：CN106544418B

公开(公告)日：2019-11-15

申请号：CN201610898124.5

申请日：2016-10-14

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 余梅 ,  洪林君 ,  李小平 ,  李新云 ,  曹建华 ,  李长春 ,  朱猛进 ,  赵书红

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪的分子标记制备技术领域，具体涉及猪初生重性状相关HAI‑1基因分子标记的克隆及其应用。该分子标记是从影响哺乳动物胎盘发育的HAI‑1基因中克隆得到，其部分核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的36位碱基处存在一个T/C的等位基因突变，该突变导致Alu1‑RFLP多态性。本发明公开了所述分子标记在猪猪初生重性状关联分析中的应用。本发明为猪的标记辅助选育提供了新的遗传资源。

公开(公告)号：CN110408707A

公开(公告)日：2019-11-05

申请号：CN201910680292.0

申请日：2019-07-23

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘小磊 ,  许婧雅 ,  唐振双 ,  尹立林 ,  项韬 ,  赵书红 ,  李新云 ,  殷东 ,  刘向东 ,  周全 ,  马云龙 ,  余梅 ,  朱猛进

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及克隆自InDel片段的与猪毛色性状相关的分子标记。该分子标记通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所中公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据，对比猪参考基因组序列获得基因分型数据，根据全基因组关联分析(GWAS)得到一种与猪毛色性状相关的分子标记，即发生在Chr 11:50076946bp处的缺失，由原片段CTGGGAACTT缺失为C，具体核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。当个体基因型为CC时，有利于个体拥有渐变带毛色。本发明公开了筛选猪毛色性状相关分子标记的方法及其关联分析的应用，为猪毛色性状的标记辅助选择提供了新的InDel分子标记。

公开(公告)号：CN110373477A

公开(公告)日：2019-10-25

申请号：CN201910680683.2

申请日：2019-07-23

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘小磊 ,  许婧雅 ,  马云龙 ,  余梅 ,  尹立林 ,  唐振双 ,  殷东 ,  赵书红 ,  项韬 ,  朱猛进 ,  李新云

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及克隆自CNV片段的与猪耳形性状相关的分子标记。该分子标记为通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据，对比猪参考基因组序列获得基因分型数据，根据全基因组关联分析(GWAS)技术得到一种与猪耳形性状关联的拷贝数变异分子标记(CNV)，当个体拥有该片段的多拷贝(拷贝数>3)时，则有利于猪拥有非直立的耳形，该片段的核苷酸序列如序列表中所示。公开了筛选与猪耳形相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪耳形的标记辅助选择提供了遗传标记资源。

公开(公告)号：CN106591439B

公开(公告)日：2019-08-06

申请号：CN201611090411.X

申请日：2016-12-01

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 李长春 ,  罗文哲 ,  李菁璇 ,  邹成 ,  张皓源 ,  胡岸 ,  赵书红 ,  余梅 ,  李新云

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种猪屠宰后24小时眼肌pH值相关基因SVEP1的分子标记及其应用。所述眼肌pH值相关基因SVEP1的分子标记为一组分子标记，分别为分子标记SVEP1‑PHU1和分子标记SVEP1‑PHU2，其中，所述SVEP1‑PHU1的核苷酸序列的641bp处有一个SNP位点A/G，SVEP1‑PHU2的核苷酸序列的94bp处有一个SNP位点C/G。本发明联合利用这一组分子标记可迅速预测不同基因型群体猪之间屠宰后24小时眼肌pH值的差别，同时在猪育种工作中，该分子标记可作为屠宰后24小时眼肌pH值的可靠标记，有效缩短育种年限，加快选择进程，促进新品种培育。

公开(公告)号：CN105838795B

公开(公告)日：2019-08-06

申请号：CN201610268426.4

申请日：2016-04-27

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 李长春 ,  邹成 ,  罗文哲 ,  李菁璇 ,  张皓源 ,  吴宇 ,  胡岸 ,  赵书红 ,  余梅 ,  李新云

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及猪分子标记制备领域，具体地指一种猪背膘厚与肌内脂肪性状相关基因SVEP1的分子标记及其应用。本发明利用SVEP1基因序列中包含一个SNP位点，位于核苷酸序列SEQ ID NO.1的第44581bp处，该位点为A/G的碱基突变，导致Sfc Ⅰ‑RFLP多态性。这个碱基突变位于SVEP1基因第3内含子中，不改变其翻译的氨基酸序列。故在SVEP1基因序列的SNP位点附近设计引物，得到分子标记序列SEQ ID NO.2，从而鉴定猪背膘厚和肌内脂肪性状。本发明利用现有的PCR‑RFLP技术，在SVEP1基因第44581bp处发现一个A/G突变，且发现此多态位点与背膘厚和肌内脂肪性状(极)显著相关，对猪生长性状和肉质性状的研究有一定帮助。

公开(公告)号：CN109666719A

公开(公告)日：2019-04-23

申请号：CN201811499487.7

申请日：2018-12-09

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 曹建华 ,  孙艳 ,  赵书红

IPC: C12Q1/6806

Abstract: 本发明属于细胞生物学实验技术领域，具体涉及一种提高细胞分辨率染色质可及性的方法。本发明基于新的NEBNext FS片段化酶以及片段选择策略，针对性地进行了系统优化和配置，使染色质切割效率和精度最大化，最终获得高分辨率的染色质开放区域信息，同时极大地降低了实验成本。本发明为染色质开放区域的研究提供了新的技术路线，得到的数据质量高，还可以与二代建库测序的标准程序进行无缝对接，是研究染色质可及性的便捷方法。

公开(公告)号：CN109609655A

公开(公告)日：2019-04-12

申请号：CN201810047328.7

申请日：2018-01-18

Applicant: 华中农业大学 ,  广西扬翔股份有限公司

Inventor： 赵书红 ,  李新云 ,  赵志超 ,  栾宁 ,  刘华珍 ,  刘向东 ,  朱猛进 ,  刘小磊 ,  马云龙 ,  余梅 ,  刘望宏 ,  施亮 ,  李家连 ,  钱平

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及OSTN基因片段作为猪免疫性状的分子标记及应用。所述的分子标记由猪OSTN基因中克隆得到。本发明筛选得到一种与猪免疫性状相关的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第37位的碱基处存在一个A/T的等位基因突变，该突变导致Sequenom SNP分型多态性。本发明公开筛选分子标记的方法和关联分析方法的应用。本发明为猪免疫性状的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记资源。

公开(公告)号：CN108866211A

公开(公告)日：2018-11-23

申请号：CN201811017200.2

申请日：2018-08-31

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘向东 ,  李信颉 ,  赵书红 ,  李新云 ,  南九红 ,  尹立林 ,  唐振双 ,  杜小勇 ,  朱猛进 ,  张杰

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6888 ,  C12Q2600/124 ,  C12Q2600/156

Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选领域，涉及一种影响猪红细胞数目的SNP分子标记。该分子标记尤其与80日龄猪红细胞数性状SNP分子标记相关，克隆自登陆号为MARC0065518基因，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与聚肌胞感染后猪红细胞数目相关的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第101位碱基处有一个T/C的等位基因突变,该突变使SEQ ID NO：1序列产生了多态性。且当SEQ ID NO：1上的第101位核苷酸为C时，表明猪具有更高的红细胞数目。本发明公开了筛选分子标记的方法及其关联分析的应用。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。

公开(公告)号：CN108411006A

公开(公告)日：2018-08-17

申请号：CN201810529294.5

申请日：2018-05-27

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘向东 ,  冯帅飞 ,  周玉 ,  叶灯灯 ,  马官军 ,  尹立林 ,  唐振双 ,  赵书红 ,  刘小磊

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于动物分子标记筛选技术领域，具体涉及S1M1基因作为母猪肢蹄骨密度相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为ASGA0003306的S1M1基因，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与母猪肢蹄骨密度相关的分子标记，其序列如SEQ ID NO：1所示，在序列的第51位的碱基处存在一个C/T的等位基因突变，当SEQ ID NO：1上的第51位核苷酸为T时，则母猪的肢蹄具有更高的骨密度。公开了筛选与母猪肢蹄骨密度相关分子标记的方法及其关联分析的应用。本发明为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。