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公开(公告)号:CN108192985B
公开(公告)日:2020-02-21
申请号:CN201810186689.X
申请日:2018-03-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CTNNB1基因插入/缺失的检测方法及其应用。该方法是以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增山羊CTNNB1基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊CTNNB1基因存在插入/缺失位点多态性。大样本(N>600)相关分析结果揭示,CTNNB1基因插入/缺失的不同类型与陕北白绒山羊第一胎产羔性状之间存在显著相关,提示CTNNB1基因插入/缺失的不同类型可作为提高山羊第一胎产羔性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊CTNNB1基因插入/缺失的方法,可在中国山羊繁殖性状的标记辅助选择育种中应用,有利于快速建立高产羔数性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN110468218A
公开(公告)日:2019-11-19
申请号:CN201910878058.9
申请日:2019-09-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊IGF2BP1基因插入/缺失标记的检测方法:以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊IGF2BP1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊IGF2BP1基因15-bp插入/缺失多态性位点和5-bp插入/缺失多态性位点的基因型。所述山羊IGF2BP1基因的15-bp和5-bp插入/缺失多态性位点的不同基因型及两个位点的组合基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系,可以作为提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊IGF2BP1基因插入/缺失标记的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN109957614A
公开(公告)日:2019-07-02
申请号:CN201910375848.5
申请日:2019-05-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊CMTM2基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊CMTM2基因NC_030825.1:g.35582961_35582974位14‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现,山羊CMTM2基因的14‑bp插入/缺失多态性的不同基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系,存在提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊CMTM2基因插入/缺失多态性的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN103866032B
公开(公告)日:2016-03-23
申请号:CN201410130751.5
申请日:2014-03-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测山羊STAT3基因单核苷酸多态性的方法及应用,以包含STAT3基因的待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P1、P2或P3为引物,PCR扩增山羊STAT3基因;用限制性内切酶DdeI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定山羊STAT3基因第45204位、第62058位或第62230位的单核苷酸多态性。3个位点能够作为提高西农萨能奶山羊体高的分子标记,1个位点作为提高海南黑山羊管围的分子标记,1个作为提高海南黑山羊体长指数的标记,这些有利于中国地方山羊生长性状的标记辅助选择(MAS),有利于快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN103866032A
公开(公告)日:2014-06-18
申请号:CN201410130751.5
申请日:2014-03-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156 , C12Q2535/138
Abstract: 本发明公开了一种检测山羊STAT3基因单核苷酸多态性的方法及应用,以包含STAT3基因的待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P1、P2或P3为引物,PCR扩增山羊STAT3基因;用限制性内切酶DdeI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定山羊STAT3基因第45204位、第62058位或第62230位的单核苷酸多态性。3个位点能够作为提高西农萨能奶山羊体高的分子标记,1个位点作为提高海南黑山羊管围的分子标记,1个作为提高海南黑山羊体长指数的标记,这些有利于中国地方山羊生长性状的标记辅助选择(MAS),有利于快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN117417993A
公开(公告)日:2024-01-19
申请号:CN202311482765.9
申请日:2023-11-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种绵羊E2F8基因插入/缺失标记的繁殖性状早期选择的应用。以澳洲白绵羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增E2F8基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定E2F8基因32‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。关联分析结果表明,所鉴定的E2F8基因的32‑bp插入/缺失多态性位点的不同基因型与澳洲白绵羊的产羔数差异显著相关,并存在提高绵羊产羔数性状的DNA标记,可用于快速建立优良绵羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN117363756A
公开(公告)日:2024-01-09
申请号:CN202311591064.9
申请日:2023-11-27
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开一种山羊C3H1orf226基因插入或缺失(InDel)标记的繁殖性状早期选择的应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊C3H1orf226基因NC_030810.1:g.112753708‑112753709位插入或缺失(InDel)多态性位点的基因型。本发明能够简单、快速、低成本、精确地检测所述插入或缺失多态性位点的基因型,检测的插入或缺失(InDel)多态性位点能够作为山羊产羔数的分子标记位点,从而加快建立产羔数性状优良的山羊种群,提高良种选育速度。
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公开(公告)号:CN112980969B
公开(公告)日:2023-05-16
申请号:CN202110374309.7
申请日:2021-04-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN110904247B
公开(公告)日:2022-05-31
申请号:CN201911385215.9
申请日:2019-12-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法及其应用。该方法是通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳鉴定山羊Sox9基因中的一个InDel位点的多态性,根据对InDel位点与山羊生长性状进行的关联性分析,发现该Sox9基因InDel位点的不同基因型与陕北白绒山羊胸围之间存在显著相关,提示所述InDel位点的基因型可作为提高山羊胸围的DNA标记,本发明的检测方法可以在山羊生长性状的标记辅助选择育种中应用,快速建立优良的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN108441566B
公开(公告)日:2021-06-29
申请号:CN201810301992.X
申请日:2018-04-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊ATBF1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过PCR技术扩增山羊ATBF1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊ATBF1基因indel位点多态性。相关分析结果揭示,ATBF1基因的indel位点的不同基因型与陕北白绒山羊、关中奶山羊和海南黑山羊的体高、胸围存在显著相关,揭示ATBF1基因indel位点的基因型可作为提高山羊体高和胸围性状的DNA标记。本发明可应用在山羊标记辅助选择育种中,有利于快速建立优良体尺性状的山羊遗传资源群体。
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