公开(公告)号：CN103668471A

公开(公告)日：2014-03-26

申请号：CN201310706375.5

申请日：2013-12-19

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 李鑫辉 ,  杨文超 ,  邵志峰

IPC: C40B50/06 ,  C40B40/06 ,  C12N15/10 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明提供了一种构建DNA高通量测序文库的方法及其配套试剂盒，具体地，本发明提供了一种基于核酸样品构建测序文库的方法，所述方法包括：对用于构建测序文库的核酸样品进行变性处理使其解链为单链核酸，将其与第一衔接子进行退火反应和连接反应，从而形成“第一衔接子-单链核酸”复合物；将所述复合物吸附于磁珠，与第二衔接子进行退火反应和连接反应，从而形成吸附有“第一衔接子-单链核酸-第二衔接子”复合物的磁珠，将经清洗的磁珠进行PCR反应，获得扩增产物，用于构建测序文库。

公开(公告)号：CN103525807A

公开(公告)日：2014-01-22

申请号：CN201310483404.6

申请日：2013-10-15

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 杨文超 ,  李鑫辉 ,  邵志峰

IPC: C12N15/10

Abstract: 本发明公开了一种分离冈崎片段的方法，通过氯化铯提取基因组DNA和蔗糖梯度离心以及核酸外切酶降解等主要步骤，分离获得高质量的冈崎片段。本发明的冈崎片段的分离方法，操作容易，质控严格，获得的产物纯度高，污染少，适用于各种培养的酵母细胞。

公开(公告)号：CN102749239A

公开(公告)日：2012-10-24

申请号：CN201210238654.9

申请日：2012-07-10

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 邵志峰 ,  李林 ,  丹尼尔·恰科夫 ,  孙洁林 ,  沈轶 ,  胡钧

IPC: G01N1/28

Abstract: 本发明公开了一种新型磷脂双分子层褶皱态的构建方法，包括下列步骤：提供一基底，所述基底为云母或其它基底；在所述基底表面制备一层胶态下的第一磷脂双分子层；在所述第一磷脂双分子层上再制备一层第二磷脂双分子层，从而稳定实现其褶皱态。本发明提出的新型磷脂双分子层褶皱态的构建方法，该层新基底还可用于其它生物样品的制备，如磷脂双分子层、蛋白质等等。本发明可使制备的生物样品更接近于自然状态，适合生物学的研究，且操作手段简单、成本低廉。

公开(公告)号：CN113189071B

公开(公告)日：2022-11-22

申请号：CN202110477789.X

申请日：2021-04-29

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 李小卫 ,  李敏 ,  邵志峰

IPC: G01N21/64

Abstract: 本发明提供了一种用于完整器官血管三维网络精准成像的试剂盒及成像方法。具体地，包括：(A)抗凝血剂；(B)去血剂，所述去血剂包括抗凝血剂和血管扩张剂；(C)血管标记物，所述血管标记物包括荧光微球；(D)组织固定剂；和(E)荧光微球稀释液，其中所述荧光微球稀释液包括肝素钠和碳化二亚胺(EDAC)。本发明的试剂盒可实现实验动物或其组织器官的快速、完整、稳定的血管标记。

公开(公告)号：CN114371206A

公开(公告)日：2022-04-19

申请号：CN202210036356.5

申请日：2022-01-13

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 阮鉴鉴 ,  刘美君 ,  于晗 ,  丹尼尔·恰可夫 ,  邵志峰 ,  程酩 ,  沈轶

IPC: G01N27/327 ,  G01N27/26

Abstract: 一种稳定均一纳米孔的制备方法，将纳米孔单体与粒径均匀的脂质囊泡生理缓冲液悬浊液混合孵育，在脂质囊泡上形成均匀稳定的纳米孔前体；依次加入解锁剂使脂质囊泡上的纳米孔前体形成纳米孔，加入交联剂使形成的纳米孔结构更稳固，加入表面活性剂破坏脂质囊泡，使纳米孔进入水溶液，形成纳米孔与脂质的混合液；经分离纯化得到分子量一致、孔径均一、结构稳固的纳米孔。本发明得到的成孔蛋白能够在特制的脂质囊泡上形成预成孔复合物，再结合使用交联剂和表面活性剂使得纳米孔的结构更加稳固、成孔成功率更高。

公开(公告)号：CN108572099B

公开(公告)日：2021-03-26

申请号：CN201810368691.9

申请日：2018-04-23

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 李小卫 ,  邵志峰 ,  张倪

IPC: G01N1/31 ,  G05D27/02

Abstract: 一种实现生物组织快速染色的装置包括染色箱，其中，所述染色箱内部具有1‑100个电泳腔放置槽；所述的电泳腔放置槽具有电泳腔、温度传感器、离子浓度传感器、pH传感器、电流传感器和流速传感器。本发明的装置能够有效提高染色的效率，能大幅够减少染色的时间，显著提高染色的质量，具有简单、通用性强、易于组装、且成本低的优点。

公开(公告)号：CN112390839A

公开(公告)日：2021-02-23

申请号：CN202011286386.9

申请日：2020-11-17

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 沈玉梅 ,  邵志峰 ,  龚兵 ,  汤博为

IPC: C07H19/073 ,  C07H1/00 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明提供了一种三氮烯四色荧光可逆终止核苷酸测序试剂及DNA单分子测序系统及测序方法，所述三氮烯四色荧光可逆终止核苷酸测序试剂包括以下基于三氮烯连接单元的不同荧光素标记四种不同碱基的可逆终止核苷酸：本发明在包含所述三氮烯四色荧光可逆终止核苷酸测序试剂的DNA单分子集成测序系统中，通过前一次DNA链延伸产物的荧光信号图像作为下一次延伸产物的定位荧光，无需额外的定位荧光，并且三氮烯荧光标记核苷酸在断裂反应后，在DNA链上无残基保留，理论上读长无限制。

公开(公告)号：CN107727732B

公开(公告)日：2021-01-29

申请号：CN201711139298.4

申请日：2017-11-16

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 沈轶 ,  丹尼尔·恰可夫 ,  滕子优 ,  邵志峰 ,  孙洁林

IPC: G01N27/72

Abstract: 本发明公开了一种用于蛋白相互作用组单分子力谱方法，用于高效测量多种不同生物分子间单分子相互作用。该方法通过磁场对待测生物分子微阵列表面所有磁性物质产生作用力，使磁性物质对连接在其与基底间的生物分子或生物分子对产生作用力；通过磁性物质在微阵列上位置，获得对应的与该磁性物质连接的生物分子或生物分子对种类，再通过检测记录磁性物质空间运动轨迹，来分析获得该生物分子或生物分子对的物理化学参量的表征信息。本发明具有高效、连续、高通量测量等优点。

公开(公告)号：CN106083676B

公开(公告)日：2019-01-11

申请号：CN201610402708.9

申请日：2016-06-07

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 沈玉梅 ,  王雪里 ,  邵志峰 ,  龚兵 ,  谭连江

IPC: C07C323/52 ,  C07C323/25 ,  C07H19/10 ,  C07H19/14 ,  C07H1/00 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明公开一种硫代缩酮连接单元及其合成方法、用途；所述硫代缩酮连接单元的结构如式(Ⅰ)所示:其中，R＝‑OH或者‑COOH；R1与R2的满足如下条件中的一种：(1)R1＝R2＝甲基；或，(2)R1＝苯基、对甲氧基苯基、2,4,6‑三甲氧基苯基、萘基或对甲氧基萘基，R2＝H；或，(3)R1、R2共同构成环己基或环戊基。该单元与核苷酸及荧光素连接得到的荧光素标记核苷酸可用于DNA测序。与现有技术相比，本发明连接单元的可逆终止剂用于DNA测序时，其延伸效率接近100％，并且在模板为连续多个相同碱基时，一次只延伸一个可逆终止剂；其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。

公开(公告)号：CN108796039A

公开(公告)日：2018-11-13

申请号：CN201810697732.9

申请日：2018-06-29

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 康亚妮 ,  赵小东 ,  邵志峰 ,  毛湛睿 ,  金戈旋

IPC: C12Q1/6806

CPC classification number: C12Q1/6806 ,  C12Q2563/131

Abstract: 本发明公开了一种用于DNA甲基化检测的试剂盒，其至少包括生物素标记的甲基化的λ‑DNA和链霉素包被的磁珠。还公开了该试剂盒在少量DNA样品甲基化检测中的应用，样品量可低至1ng。本发明还公开了一种DNA甲基化检测的方法及其应用。本发明提供的技术方案显著降低了DNA甲基化检测所需的最低起始样品量，且不需要特定的试剂盒和实验设备，节省成本，具有较高的普适性。在富集甲基化DNA的同时不引入外源DNA污染，若采取文库构建和高通量测序的检测方法时不会受到外源DNA信息的影响，有利于进一步降低测序成本，提高数据质量。