-
公开(公告)号：CN104003902B
公开(公告)日：2016-05-04
申请号：CN201410203327.9
申请日：2014-05-14
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C247/10 , C07H19/10 , C07H1/00 , C09K11/06 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种三氮烯连接单元的合成及其在DNA测序中的用途；该三氮烯连接单元结构式如下：其中-CH2OH和-CH2N3分别连接于三氮烯结构的邻位、对位或间位。该酸敏感的三氮烯连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的可逆终端可用于DNA合成测序。与现有技术相比，本发明合成了一类新的酸敏感连接单元，并用于合成了基于这种连接单元的可逆终端；该类可逆终端可用于DNA合成测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
-
公开(公告)号：CN103819523B
公开(公告)日：2016-02-10
申请号：CN201410030095.1
申请日：2014-01-22
IPC: C07H19/167 , C07H1/00 , C07H19/173 , C07H19/20
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷的合成方法；所述方法包括如下步骤：式(III)化合物在碱性条件下去保护基得式(IV1)或(IV2)化合物；进一步去甲基得式(I)化合物，即所述7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷；其中，R1为H或OH，R2为I、Br或Cl，R3为H或本发明合成的7-去氮-7-卤素-鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料，目前其销售价格很高，且合成方法复杂，难以控制；而本发明的合成方法所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
-
公开(公告)号：CN105256003A
公开(公告)日：2016-01-20
申请号：CN201510582998.5
申请日：2015-09-14
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2525/101 , C12Q2563/107
Abstract: 本发明公开了一种基于酸敏感修饰核苷酸的DNA测序方法；所述方法包括：用式(I)所示的酸敏感修饰核苷酸为可逆终止剂，参与DNA链延伸反应以及对所述酸敏感修饰核苷酸中的酸敏感连接单元进行断裂；(I)；其中，所述荧光素选自：BODIPY、罗丹明、香豆素、咕吨、花青、芘、酞菁、Alexa、squaring染料、产生能量转移染料，或其组合；所述Base表示选自如下碱基：U、T、C、A、G。与现有技术相比，本发明提供一种准确性高，特别是在模板为连续多个相同碱基时能够具有较高的延伸效率和剪切效率的延伸方法。
-
公开(公告)号：CN103087131B
公开(公告)日：2015-07-08
申请号：CN201310015235.3
申请日：2013-01-15
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种可逆终端及其合成和在DNA合成测序中的用途。所述可逆终端的结构式如式(I)所示：其中R1为荧光素，R2为连接单元。本发明的可裂解该可逆终端可用于DNA合成测序；同时，本发明的可逆终端的合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用，并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应要求，具备较好的实用前景。
-
公开(公告)号：CN103484106A
公开(公告)日：2014-01-01
申请号：CN201310401580.0
申请日：2013-09-05
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种四色荧光标记可逆终端及其在DNA测序中的用途；所述可逆终端的结构式如式(I)所示：(I)；其中，R1为三磷酸盐；R2为H或者OH；碱基为U，C，A，G或其衍生物；连接单元为在温和条件下可以断裂的双官能团化合物；荧光基团选自BODIPY、荧光素、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、alexa、squarene染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种。本发明的可逆终端可用于DNA单分子测序；同时，本发明的可逆终端的合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用，并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应要求，具备很好的实用前景。
-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN103175780A
公开(公告)日：2013-06-26
申请号：CN201310090802.1
申请日：2013-03-20
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N21/00
Abstract: 本发明提供了一种大尺度生物组织连续切片的成像系统，包括：图像获取单元，其获得所述连续切片的数字化图像；拼接单元，其对所述图像进行二维拼接从而形成大尺寸切片的完整图像；及控制单元，其控制所述图像获取单元自动进行成像并控制所述拼接单元自动进行拼接。所述控制单元控制图像获取单元自动连续获取所述切片的图像，并控制取所述拼接单元对由所述图像获取单元获取的连续切片图像进行拼接，从而获得试样完整的数字化图像。
-
公开(公告)号：CN108251516B
公开(公告)日：2021-04-02
申请号：CN201711280069.4
申请日：2017-12-06
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种DNA单分子测序方法与测序系统，所述DNA单分子测序方法包括如下步骤：S1对基体表面进行修饰，将水溶性双功能连接单元连接于基体表面；然后将引物P1与水溶性双功能连接单元连接，即得固定有引物的基体；S2、将含待测DNA模板、聚合酶、四色荧光标记可逆终止剂的混合溶液置于固定有引物P1的基体上，进行延伸，形成含荧光素的引物/模板复合物；S3、对延伸后的引物/模板复合物进行成像，确定参与延伸的核苷酸碱基种类；S4、将参与延伸的核苷酸的可裂解连接单元断裂，进行下一次延伸；S5、重复上述步骤S2至步骤S4，获得待测DNA模板的碱基序列。本发明能够完美地做到一次测序循环只延伸一个可逆终止剂的效果。
-
公开(公告)号：CN111579769A
公开(公告)日：2020-08-25
申请号：CN202010407241.3
申请日：2015-04-30
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N33/533
Abstract: 本发明公开了一种对组织样本进行免疫标记的方法，具体地，本发明(a)提供一标记体系，所述标记体系含有待进行免疫标记的组织样本、用于对所述组织样本进行标记的探针和缓冲液；和(b)将所述的标记体系置于电场作用下进行标记处理，从而使得所述的探针进入所述组织样本内部，从而对所述组织样本进行免疫标记，获得经免疫标记的组织样本。本发明不仅能够缩短探针进入组织样本内部的时间，还能保持组织内部的完整性，具有极大的应用价值。
-
公开(公告)号：CN110343612A
公开(公告)日：2019-10-18
申请号：CN201810308292.3
申请日：2018-04-08
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种基于多色荧光可逆终止核苷酸的DNA单分子测序系统及装置，所述测序系统包括引物、待测DNA模板、多色荧光可逆终止核苷酸测序试剂；所述引物固定在流通池反应器表面；将待测DNA模板与测序引物进行杂交，然后用多色荧光可逆终止核苷酸延伸引物后，检测延伸引物的荧光信号即可得到待测DNA序列信息；所述待测DNA模板的3’端不需要标记定位荧光。本发明通过利用测序循环过程中，延伸反应物的荧光作为下一次延伸的定位荧光，或采用固定在流通池反应器表面的定位荧光标记物作为定位荧光，无需对待测DNA模板的3’端标记定位荧光，从而有效避免了由于淬灭而导致定位信息丢失的问题，可进一步大幅延长测序读长并降低错误率。
-
公开(公告)号：CN108251516A
公开(公告)日：2018-07-06
申请号：CN201711280069.4
申请日：2017-12-06
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种DNA单分子测序方法与测序系统，所述DNA单分子测序方法包括如下步骤：S1对基体表面进行修饰，将水溶性双功能连接单元连接于基体表面；然后将引物P1与水溶性双功能连接单元连接，即得固定有引物的基体；S2、将含待测DNA模板、聚合酶、四色荧光标记可逆终止剂的混合溶液置于固定有引物P1的基体上，进行延伸，形成含荧光素的引物/模板复合物；S3、对延伸后的引物/模板复合物进行成像，确定参与延伸的核苷酸碱基种类；S4、将参与延伸的核苷酸的可裂解连接单元断裂，进行下一次延伸；S5、重复上述步骤S2至步骤S4，获得待测DNA模板的碱基序列。本发明能够完美地做到一次测序循环只延伸一个可逆终止剂的效果。
-
-
-
-
-
-
-
-
-
Search Results
59
records
(took 0.025 seconds)
