公开(公告)号：CN104003902B

公开(公告)日：2016-05-04

申请号：CN201410203327.9

申请日：2014-05-14

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 沈玉梅 ,  龚兵 ,  魏晓飞 ,  伍新燕 ,  邵志峰 ,  李小卫 ,  赵小东

IPC: C07C247/10 ,  C07H19/10 ,  C07H1/00 ,  C09K11/06 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种三氮烯连接单元的合成及其在DNA测序中的用途；该三氮烯连接单元结构式如下：其中-CH2OH和-CH2N3分别连接于三氮烯结构的邻位、对位或间位。该酸敏感的三氮烯连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的可逆终端可用于DNA合成测序。与现有技术相比，本发明合成了一类新的酸敏感连接单元，并用于合成了基于这种连接单元的可逆终端；该类可逆终端可用于DNA合成测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。

公开(公告)号：CN103819523B

公开(公告)日：2016-02-10

申请号：CN201410030095.1

申请日：2014-01-22

Applicant: 上海交通大学 ,  华东理工大学

Inventor： 沈玉梅 ,  汤道年 ,  邵志峰 ,  龚兵 ,  刘亚智 ,  伍新燕 ,  赵小东 ,  李小卫 ,  魏晓飞 ,  胡蔚

IPC: C07H19/167 ,  C07H1/00 ,  C07H19/173 ,  C07H19/20

CPC classification number: Y02P20/55

Abstract: 本发明公开了一种7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷的合成方法；所述方法包括如下步骤：式(III)化合物在碱性条件下去保护基得式(IV1)或(IV2)化合物；进一步去甲基得式(I)化合物，即所述7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷；其中，R1为H或OH，R2为I、Br或Cl，R3为H或本发明合成的7-去氮-7-卤素-鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料，目前其销售价格很高，且合成方法复杂，难以控制；而本发明的合成方法所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。

公开(公告)号：CN103087131B

公开(公告)日：2015-07-08

申请号：CN201310015235.3

申请日：2013-01-15

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 沈玉梅 ,  赵小东 ,  邵志峰 ,  龚兵 ,  汤道年 ,  李小卫 ,  彭丽娜 ,  邢宇洋 ,  庄园 ,  黎庆 ,  伍新燕

IPC: C07H19/10 ,  C07H1/00 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种可逆终端及其合成和在DNA合成测序中的用途。所述可逆终端的结构式如式(I)所示：其中R1为荧光素，R2为连接单元。本发明的可裂解该可逆终端可用于DNA合成测序；同时，本发明的可逆终端的合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用，并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应要求，具备较好的实用前景。

公开(公告)号：CN103012771B

公开(公告)日：2014-10-15

申请号：CN201210442960.4

申请日：2012-11-07

Applicant: 上海交通大学 ,  华东理工大学

Inventor： 沈玉梅 ,  龚兵 ,  庄园 ,  伍新燕 ,  朱方霞 ,  黎庆 ,  汤道年

IPC: C08G65/48 ,  C08G81/00 ,  C07D309/10 ,  C07D307/20 ,  A61K47/34 ,  A61P35/00

Abstract: 本发明公开了一种酸敏感可裂解连接单元及其用途。所述可裂解连接单元的结构式为：其中，m为1或2，n为0～44中的任一整数，X为Br、NH2、N3或OH，Y为Br、NH2、N3或OH。该类连接单元在酸性条件下可以实现有效裂解；并可与亲水性化合物、疏水性化合物实现高效率连接，得到两亲性嵌段共聚物；该嵌段共聚物自组装胶束可作为药物运输载体。与现有技术相比，合成本发明化合物所需的原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，反应条件温和，易于大量合成。

公开(公告)号：CN102977358B

公开(公告)日：2014-10-15

申请号：CN201210442360.8

申请日：2012-11-07

Applicant: 上海交通大学 ,  华东理工大学

Inventor： 沈玉梅 ,  龚兵 ,  赵读恩 ,  伍新燕 ,  刘亚智

IPC: C08G65/48 ,  C08G63/78 ,  C08G63/688 ,  C08G63/08 ,  C08G81/00 ,  C07D249/04 ,  C07C323/52 ,  C07C319/20

Abstract: 本发明公开了一种具有氢键序列特异性组合的模块化合物及其制备方法。所述模块化合物的结构式如下：其中，当R为（m为1～200中任一整数）时，该模块化合物为亲水模块化合物P2；当R为（n为2～140中任一整数）时，该模块化合物对应为疏水模块化合物BLOCK-1、BLOCK-2或BLOCK-3。本发明的模块化合物由于具有氢键序列特异性而且两种互补的单链可以相互特异性地识别、配对从而形成分子胶，所以利用分子胶集团可以方便地制备用其它方法不容易合成的嵌段共聚物。

公开(公告)号：CN102516208B

公开(公告)日：2014-06-18

申请号：CN201110331659.1

申请日：2011-10-27

Applicant: 上海交通大学 ,  华东理工大学 ,  深圳华因康基因科技有限公司

Inventor： 沈玉梅 ,  龚兵 ,  黎庆 ,  邵志峰 ,  伍新燕 ,  盛司潼 ,  郭勋祥

IPC: C07D307/20 ,  C07D309/10 ,  C08G65/00 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种可裂解连接单元及其合成方法与用途。可裂解连接单元的结构式为：，其中，n为1或2，m为0～20中的任意一个整数，k为1～20中的任意一个整数。该可裂解连接单元可用于DNA合成测序。与现有技术相比，本发明的化合物合成原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，易于实现大量合成；该类化合物可与核苷酸和荧光素实现高效率的连接；通过研究该类化合物的裂解性能，发现该类化合物在温和的条件下可以实现高效率的完全裂解，可应用于DNA测序。

公开(公告)号：CN103484106A

公开(公告)日：2014-01-01

申请号：CN201310401580.0

申请日：2013-09-05

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 沈玉梅 ,  邵志峰 ,  赵小东 ,  汤道年 ,  龚兵 ,  李小卫 ,  江敏 ,  刘亚智 ,  魏晓飞 ,  伍新燕

IPC: C09K11/06 ,  C07H19/10 ,  C07H19/14 ,  C07H1/00 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种四色荧光标记可逆终端及其在DNA测序中的用途；所述可逆终端的结构式如式(I)所示：(I)；其中，R1为三磷酸盐；R2为H或者OH；碱基为U，C，A，G或其衍生物；连接单元为在温和条件下可以断裂的双官能团化合物；荧光基团选自BODIPY、荧光素、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、alexa、squarene染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种。本发明的可逆终端可用于DNA单分子测序；同时，本发明的可逆终端的合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用，并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应要求，具备很好的实用前景。

公开(公告)号：CN103012771A

公开(公告)日：2013-04-03

申请号：CN201210442960.4

申请日：2012-11-07

Applicant: 上海交通大学 ,  华东理工大学

Inventor： 沈玉梅 ,  龚兵 ,  庄园 ,  伍新燕 ,  朱方霞 ,  黎庆 ,  汤道年

IPC: C08G65/48 ,  C08G81/00 ,  C07D309/10 ,  C07D307/20 ,  A61K47/34 ,  A61P35/00

Abstract: 本发明公开了一种酸敏感可裂解连接单元及其用途。所述可裂解连接单元的结构式为：其中，m为1或2，n为0～44中的任一整数，X为Br、NH2、N3或OH，Y为Br、NH2、N3或OH。该类连接单元在酸性条件下可以实现有效裂解；并可与亲水性化合物、疏水性化合物实现高效率连接，得到两亲性嵌段共聚物；该嵌段共聚物自组装胶束可作为药物运输载体。与现有技术相比，合成本发明化合物所需的原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，反应条件温和，易于大量合成。