筛选三阴性乳腺癌特异性血清代谢标志物的方法

    公开(公告)号:CN105738526B

    公开(公告)日:2018-05-25

    申请号:CN201610137478.8

    申请日:2016-03-11

    Abstract: 本发明公开了一种筛选三阴性乳腺癌特异性血清代谢标志物的方法,采用LC/MS仪器分别对实验组A和对照组B的血清样本进行代谢组学分析,对所有样本中物质的峰的响应强度数据进行模型判别分析,分别对实验组A和对照组B进行PCA分析,并在此基础上进行PLS‑DA、OPLS‑DA的模型构建,从而获得差异性表达代谢物,筛选并鉴定与乳腺癌发生、转移相关的生物标志物:溶血性卵磷脂、鞘磷脂和小分子氨基酸。其结果对于阐明三阴性乳腺癌患者血清特征性代谢物含量变化规律以及代谢物在肿瘤的发生发展过程中的作用具有重要的意义;同时应用此筛选方法可以获得有效的乳腺癌早期诊断靶点,并为建立特异性癌症诊断模型提供数据基础。

    应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法

    公开(公告)号:CN109060989A

    公开(公告)日:2018-12-21

    申请号:CN201810997414.4

    申请日:2018-08-29

    CPC classification number: G01N30/02 G01N30/06

    Abstract: 本发明公开了一种应用iTRAQ技术研究三阴性乳腺癌外泌体差异表达蛋白的方法,包含以下步骤:(1)外泌体及外泌体蛋白质的提取处理;(2)对步骤(1)所得外泌体蛋白样品进行酶解和除盐得到多肽;(3)对步骤(2)所得多肽进行iTRAQ标记、混合;(4)对步骤(3)标记的多肽肽段混合物进行HPLC分离及LC‑MS分析;(5)对上述所得到质谱鉴定结果进行生物信息学分析、定量分析获取三阴性乳腺癌外泌体的差异表达蛋白。本发明提供的iTRAQ技术结合MS/MS技术能快速有效进行三阴性乳腺癌外泌体蛋白质组的研究,为研究三阴性乳腺癌的疾病机制以及发现三阴性乳腺癌相关的生物标志物提供参考。

    核酸靶序列捕获测序文库的制备方法

    公开(公告)号:CN105734679B

    公开(公告)日:2018-10-30

    申请号:CN201610185978.9

    申请日:2016-03-29

    Abstract: 本发明公开了核酸靶序列捕获测序文库的制备方法;a)根据目标靶序列设计并合成捕获探针A和B溶液;b)在待测DNA或RNA样品中加入探针A溶液,同时加入DNA聚合酶或逆转录酶、dNTP和含Mg2+的缓冲液,延伸探针A;c)再加入链霉亲合素包被的磁珠与探针A结合并洗涤磁珠;d)在含有磁珠的缓冲液中再添加探针B溶液;e)在缓冲液中加入DNA聚合酶、dNTP和含Mg2+的缓冲液延伸探针B;f)洗涤磁珠,通过加热变性使捕获探针B延伸产物从磁珠上解离洗脱下来;g)以捕获探针B延伸产物为模板,用公共引物a和b进行文库PCR扩增,本发明具有高通量、高特异性、高灵敏度、操作方便、操作成本低、适用范围广。

    筛选三阴性乳腺癌特异性血清代谢标志物的方法

    公开(公告)号:CN105738526A

    公开(公告)日:2016-07-06

    申请号:CN201610137478.8

    申请日:2016-03-11

    CPC classification number: G01N30/02 G01N2030/027 G01N2570/00

    Abstract: 本发明公开了一种筛选三阴性乳腺癌特异性血清代谢标志物的方法,采用LC/MS仪器分别对实验组A和对照组B的血清样本进行代谢组学分析,对所有样本中物质的峰的响应强度数据进行模型判别分析,分别对实验组A和对照组B进行PCA分析,并在此基础上进行PLS?DA、OPLS?DA的模型构建,从而获得差异性表达代谢物,筛选并鉴定与乳腺癌发生、转移相关的生物标志物:溶血性卵磷脂、鞘磷脂和小分子氨基酸。其结果对于阐明三阴性乳腺癌患者血清特征性代谢物含量变化规律以及代谢物在肿瘤的发生发展过程中的作用具有重要的意义;同时应用此筛选方法可以获得有效的乳腺癌早期诊断靶点,并为建立特异性癌症诊断模型提供数据基础。

    核酸靶序列捕获测序文库的制备方法

    公开(公告)号:CN105734679A

    公开(公告)日:2016-07-06

    申请号:CN201610185978.9

    申请日:2016-03-29

    Abstract: 本发明公开了核酸靶序列捕获测序文库的制备方法;a)根据目标靶序列设计并合成捕获探针A和B溶液;b)在待测DNA或RNA样品中加入探针A溶液,同时加入DNA聚合酶或逆转录酶、dNTP和含Mg2+的缓冲液,延伸探针A;c)再加入链霉亲合素包被的磁珠与探针A结合并洗涤磁珠;d)在含有磁珠的缓冲液中再添加探针B溶液;e)在缓冲液中加入DNA聚合酶、dNTP和含Mg2+的缓冲液延伸探针B;f)洗涤磁珠,通过加热变性使捕获探针B延伸产物从磁珠上解离洗脱下来;g)以捕获探针B延伸产物为模板,用公共引物a和b进行文库PCR扩增,本发明具有高通量、高特异性、高灵敏度、操作方便、操作成本低、适用范围广。

    一种诊断卵巢癌的磁性纳米探针的制备方法

    公开(公告)号:CN103604920B

    公开(公告)日:2016-01-06

    申请号:CN201310627413.8

    申请日:2013-12-02

    Abstract: 本发明公开了一种诊断卵巢癌的磁性纳米探针的制备方法,步骤如下:(1)磁性纳米粒子的制备与表征;(2)磁性纳米粒子的硅烷化及氨基化修饰与表征;(3)采用氨基硅烷化的磁性纳米粒子,经戊二醛活化后,与CA125单抗交联制备卵巢癌磁性纳米探针。同时,本发明还公开了一种诊断卵巢癌的检测方法。本发明制备的磁性纳米探针,磁性粒子体积小可吸附更多抗原或抗体,因磁性微粒子核心为铁,在磁场中下沉速度快,易进行洗涤和固相载体分离;可特异性的捕获早期卵巢癌患者外周血中的CA125,采用酶联免疫吸附法(ELISA)对富集后的样品进行检测,构建一种基于纳米探针在卵巢癌预警及早期诊断的方法。

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