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公开(公告)号:CN108396057B
公开(公告)日:2021-11-09
申请号:CN201810168991.2
申请日:2018-02-28
Applicant: 重庆市肿瘤研究所
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了一种基于长链分子倒置探针的核酸靶向捕获测序文库制备方法;a)合成捕获探针A,捕获探针B以及连接子C;b)在连接酶反应体系里加入磷酸化的探针A,B以及连接子C,同时加入DNA连接酶,使A和B在C的桥接作用下连接;c)合并多个针对不同靶区的连接混合物,通过变性电泳或核酸纯化试剂盒分离和纯化连接的产物,得到长链分子倒置探针;d)长链分子倒置探针与待测的样品的DNA或cDNA混合,杂交,在缓冲液中加入DNA聚合酶、DNA连接酶、dNTP和含Mg2+的缓冲液延伸长链分子倒置探针,在DNA连接酶的作用下形成闭合的分子;e)加入核酸外切酶降解没有环化的DNA分子;f)用和长链分子倒置探针的公共序列区域对应的引物进行PCR扩增,得到靶向区域的测序文库。
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公开(公告)号:CN107841793A
公开(公告)日:2018-03-27
申请号:CN201710651290.X
申请日:2017-08-02
Applicant: 重庆市肿瘤研究所
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6886
CPC classification number: C40B50/06 , C12Q1/6869 , C12Q1/6886 , C12Q2600/156 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了一种肺癌多基因突变文库的构建方法,其特征在于:覆盖人类基因EGFR、K-ras、B-raf、N-ras、PIK3CA、c-MET、TP53、c-Kit、PDGFRA、ALK、ROS1、RET、ERBB2、NTRK1和NTRK3上的总共1435种体细胞突变。本发明的构建方法针对多个靶序列进行单管,快速完成文库的构建,整个文库构建过程仅需要2~3小时,手动时间仅仅需要45分钟即可,可通用于illumina和Ion torrent平台,结合高通量测序平台可以十分有效的解决目前对于临床上肺癌患者少量的石蜡组织切片和外周血样本基础上需要对体细胞多基因、多靶点检测这一难点,且成本低廉。
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公开(公告)号:CN108396057A
公开(公告)日:2018-08-14
申请号:CN201810168991.2
申请日:2018-02-28
Applicant: 重庆市肿瘤研究所
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了一种基于长链分子倒置探针的核酸靶向捕获测序文库制备方法;a)合成捕获探针A,捕获探针B以及连接子C;b)在连接酶反应体系里加入磷酸化的探针A,B以及连接子C,同时加入DNA连接酶,使A和B在C的桥接作用下连接;c)合并多个针对不同靶区的连接混合物,通过变性电泳或核酸纯化试剂盒分离和纯化连接的产物,得到长链分子倒置探针;d)长链分子倒置探针与待测的样品的DNA或cDNA混合,杂交,在缓冲液中加入DNA聚合酶、DNA连接酶、dNTP和含Mg2+的缓冲液延伸长链分子倒置探针,在DNA连接酶的作用下形成闭合的分子;e)加入核酸外切酶降解没有环化的DNA分子;f)用和长链分子倒置探针的公共序列区域对应的引物进行PCR扩增,得到靶向区域的测序文库。
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公开(公告)号:CN205795976U
公开(公告)日:2016-12-14
申请号:CN201620518733.9
申请日:2016-06-01
Applicant: 重庆市肿瘤研究所
Abstract: 本实用新型公开了头部定位板,包括板框、定位板架、一对弧形边、热缩膜网罩和一对固定件,板框与定位板架铰链接,一对弧形边分别安装在板框两侧,定位板架具有一对凸起,弧形边具有一条弧形穿孔,凸起端部穿过弧形穿孔并与固定件相配合,定位板架设有与热缩膜网罩相适配的框孔,框孔周围设有固定杆,热缩膜网罩设有与固定杆相配合的固定孔。本实用新型通过两个固定件与凸起相配合把定位板架固定在两个弧形边之间,通过把固定杆穿在固定孔上从而把热缩膜网罩固定在定位板架上,用到的热缩膜网罩在一定的温度下可以热缩,可以根据头部形状变型,通过此结构,可以调节头部的位置的同时并能使患者俯卧的时候也能放射治疗。
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