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公开(公告)号：CN101705289B
公开(公告)日：2012-06-27
申请号：CN200910219003.3
申请日：2009-11-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了奶山羊GHRHR基因的单核苷酸多态性及其检测方法，其基因单核苷酸多态性包括：在如SEQ ID N0.1所示的奶山羊的GHRHR基因序列表的第231位为C或G的碱基多态性。其检测方法为：以包含GHRHR基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增奶山羊GHRHR基因；用限制性内切酶MspI消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定其多态性。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记，以用于奶山羊的辅助选择和分子育种，加快奶山羊良种繁育速度。
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公开(公告)号：CN112813175B
公开(公告)日：2023-07-07
申请号：CN202110342428.4
申请日：2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 柴亚楠 , 刘贤 , 李克丽 , 杜雪儿 , 郑中华 , 乔小玉 , 郎利敏 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛CHRDL1基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及其应用：以牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR技术，用两对引物P1、P2分别对牛CHRDL1基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增，根据2*2‑ΔΔCt确定个体CHRDL1基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据CHRDL1基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果，本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于牛生长性状的标记辅助选择，加速良种选育进程。
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公开(公告)号：CN113444811B
公开(公告)日：2023-05-26
申请号：CN202110893489.X
申请日：2021-08-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种基于山羊GPR157基因CNV标记评估生长性状的分子诊断方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术，以山羊个体基因组DNA为模板，以一对特异性引物扩增GPR157基因拷贝数变异区域的部分片段，以另外一对特异性引物扩增MC1R基因的部分片段作为内参，利用2*2‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于GPR157基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，可用于快速建立山羊遗传资源优势种群，有利于加快山羊分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN111321232B
公开(公告)日：2022-08-16
申请号：CN202010192466.1
申请日：2020-03-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种快速检测肉牛EIF4A2基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以云岭牛基因组DNA为模板，利用一对引物扩增地方肉牛(例如，云岭牛)EIF4A2基因的拷贝数变异区域部分片段，同时利用另外一对引物扩增牛通用转录因子3基因部分片段作为内参，对定量结果进行计算，判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在肉牛EIF4A2基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上，有利于加快肉牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN111321232A
公开(公告)日：2020-06-23
申请号：CN202010192466.1
申请日：2020-03-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种快速检测肉牛EIF4A2基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以云岭牛基因组DNA为模板，利用一对引物扩增地方肉牛(例如，云岭牛)EIF4A2基因的拷贝数变异区域部分片段，同时利用另外一对引物扩增牛通用转录因子3基因部分片段作为内参，对定量结果进行计算，判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在肉牛EIF4A2基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上，有利于加快肉牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110029156A
公开(公告)日：2019-07-19
申请号：CN201910379421.2
申请日：2019-05-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊KAT6A基因CNV标记的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术，以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板，扩增茶卡羊KAT6A基因拷贝数变异区域，并以扩增的茶卡羊ANKDR1基因片段作为内参，利用2–ΔΔCt的方法计算个体的拷贝数，通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析，该拷贝数变异区域的不同基因型显著影响茶卡羊的生长性状。本发明在DNA水平上检测与茶卡羊生长性状密切相关的分子遗传标记，可用于茶卡羊生长性状的标记辅助选择，以便快速建立遗传资源优良的茶卡羊种群。
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公开(公告)号：CN109943647A
公开(公告)日：2019-06-28
申请号：CN201910354837.9
申请日：2019-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛MLLT10基因CNV标记的方法及其应用，基于实时荧光定量PCR技术，以黄牛基因组DNA为模板，利用特异性PCR引物扩增黄牛MLLT10基因拷贝数变异区，并扩增黄牛BTF3基因部分片段作为内参，最后利用2-ΔΔCt方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立黄牛MLLT10基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础，检测方法简单、快速，可用于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN109943646A
公开(公告)日：2019-06-28
申请号：CN201910354830.7
申请日：2019-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛PLAG1基因CNV分子标记辅助检测生长性状的方法及其应用：以黄牛基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增PLAG1基因拷贝数变异区域和内参基因BTF3的部分片段，根据2-ΔΔCt方法将定量结果分为多拷贝型和正常型，从而鉴定黄牛个体PLAG1基因的拷贝数变异类型。本发明在DNA水平上检测与黄牛生长性状密切相关的拷贝数变异，该拷贝数变异可作为中国黄牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记，用于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作。
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公开(公告)号：CN109355359A
公开(公告)日：2019-02-19
申请号：CN201811377400.9
申请日：2018-11-19
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊MYLK4基因CNV标记的检测方法及其应用。该方法基于实时荧光定量PCR，以山羊基因组DNA为模板，扩增山羊MYLK4基因的拷贝数变异区域，接着运用-ΔΔCt计算并根据结果判定个体的拷贝数变异类型。本发明利用个体的CNV类型与生长性状进行关联分析。本发明所提供的检测方法为MYLK4基因拷贝数变异与山羊生长性状关系的建立奠定了理论基础，该方法简单快捷，便于推广使用，有利于加快建立种质资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号：CN103243156B
公开(公告)日：2016-06-22
申请号：CN201310003907.9
申请日：2013-01-06
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种验证黄牛CIDEC基因SNPs位点遗传效应的方法，以包含CIDEC基因的黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛CIDEC基因不同单倍型；用限制性内切酶KpnI和XhoI分别消化PCR扩增产物和pGL3-Basic空载体后，再使用DNA连接酶将不同单倍型连接到pGL3-Basic载体上，构建pGL3-Basic-CIDEC-H1、H2、H3、H4、H8、H9表达载体，将构建成功的表达载体转染至3T3-L1细胞中，使用双荧光报告系统试剂盒检测不同单倍型的转录活性。综合不同单倍型的转录活性，以及SNP位点改变顺式作用元件的信息来验证关联分析结果。本发明提供的检测方法为验证CIDEC基因的单核苷酸多态性遗传效应奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择（MAS），快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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