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公开(公告)号:CN112760383A
公开(公告)日:2021-05-07
申请号:CN202110228229.0
申请日:2021-03-02
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了应用于肺腺癌细胞亚群的一组qRT‑PCR内参基因及其应用,属于基因检测技术领域。本发明的内参基因选自基因RPL41、TPT1、RPL34、RPS29、RPL27A、HLA‑B、SERF2、RPS13和RPL7中的至少一种。本发明的内参基因相较于多数目前研究中常用的内参基因表达更加稳定,更加适用于从肺腺癌中分选出的肿瘤细胞和正常细胞,通过qRT‑PCR检测肺腺癌不同细胞亚群的基因的表达量,以获得更加可靠的标准化定量结果,从而为在复杂生理病理背景中探索肿瘤疾病的病因、肺腺癌的治疗和预后提供精确且可靠的数据支持。
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公开(公告)号:CN113789396B
公开(公告)日:2024-01-23
申请号:CN202111078574.7
申请日:2021-09-15
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本发明公开了一种用于检测食管癌患者特定肠道菌群占比的基因组合物及其应用。本发明的基因组合物包括基因SNX3、AKIRIN2、TMEM87B、STEAP3、PPME1、LGALS7B、ARFRP1、STX11、RP11‑295P9.3和RP11‑434D12.1。本发明运用LASSO回归(套索回归)和二分类Logistic回归筛选与肠道菌群占比相关的基因,并构建评分Score,通过ROC曲线分析得到食管癌中对应评分的截断值,可用于食管癌患者相关肠道菌群的占比的推测。本发明基于基因组合物构建的评分模型经验证,具有准确性高,特异性好的优点,有很好的应用前景。
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公开(公告)号:CN116790757A
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN202310914559.4
申请日:2023-07-24
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种用于检测肺腺癌不同亚型巨噬细胞浸润水平及预测患者预后的试剂盒。本发明在单细胞水平上识别了肿瘤相关巨噬细胞不同亚群,基于单细胞测序技术所得巨噬细胞亚群单核细胞、单核细胞‑巨噬细胞中间亚群、间质巨噬细胞、肺泡巨噬细胞,分别提取其前十位的高变基因作为其亚群的特征基因。利用上述特征基因的表达水平,用反卷积方法预测肺腺癌患者中不同亚群巨噬细胞的浸润水平,同时利用该水平预测患者预后。利用不同亚群的巨噬细胞浸润水平预测肺腺癌患者的预后,相较于目前常用的检测方法具有操作便捷、可定量分析、准确性高、灵敏度和特异性好的优势。
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公开(公告)号:CN116716292A
公开(公告)日:2023-09-08
申请号:CN202310913255.6
申请日:2023-07-24
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本发明公开了一种同时提取线粒体DNA及蛋白的试剂盒。本发明的试剂盒包括:Digitonin缓冲液、NP‑40缓冲液、悬浮液、裂解液、洗涤液1、洗涤液2和洗脱液。该试剂盒提取的线粒体DNA利用实时荧光定量PCR进行扩增,线粒体特征基因MT‑ND1、MT‑CO2、MT‑ATP6等均可以被很好地扩增;且同时提取得到的胞质蛋白提取物、线粒体蛋白提取物、核蛋白提取物中各自表达胞质特征蛋白AKT,线粒体特征蛋白VDAC,核特征蛋白Lamin B1,纯度好。本发明的试剂盒能够同时提取线粒体DNA及蛋白,还能获得细胞质DNA、细胞质蛋白、核DNA、核蛋白等产物,方便用于后续的分子生物学分析。
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公开(公告)号:CN115747332A
公开(公告)日:2023-03-07
申请号:CN202211251112.5
申请日:2022-10-13
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , G16B25/10 , G16B20/50
Abstract: 本发明公开了一种检测肺腺癌SMAD4突变的试剂盒。本发明通过运用limma包筛选与SMAD4密切相关的差异基因,通过Lasso回归最终挑选出13个基因TRIM48,HS3ST1,GPA33,STK39,GPR110,IPCEF1,ALPPL2,KCNQ3,ADAM28,CDC42EP1,ZBTB18,MYCN和HKDC1,并通过logistic回归构建上述基因组成的评分模型;绘制受试者工作特征曲线获得截断值,可用于肺腺癌SMAD4突变的检测。实验验证该方法具有灵敏度、特异度高的特点,有广泛的应用前景。
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公开(公告)号:CN113444793B
公开(公告)日:2022-09-23
申请号:CN202110597293.6
申请日:2021-05-31
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B20/50
Abstract: 本发明涉及检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒,所述试剂盒含有检测以下基因表达量的检测试剂:RP11‑539L10.2、AKR1C2、RP11‑572H4.1、TRIM16L、RARA、SESN2、RP5‑827L5.2、CTD‑2139B15.5、Metazoa_SRP、snoU13、RP11‑545H22.1、KRT8P30、TALDO1、TRAPPC13P1、GS1‑388B5.2、RP11‑267L5.1、TRAV11、RP11‑699A7.1、AL132671.1。本发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变,经TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库,实验以及多组学数据库验证,发现该预测方法具有准确性高,特异性好的优点,有很好的应用前景。
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公开(公告)号:CN113736888B
公开(公告)日:2024-02-23
申请号:CN202111161269.4
申请日:2021-09-30
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明提供了一种检测肺鳞癌抗氧化应激驱动通路相关基因突变的试剂、试剂盒和方法,本发明通过运用RNA测序、Lasso套索算法特征筛选抗氧化应激通路相关的基因,通过构建评分RiskScore,运用二分类logistic回归构建模型,并通过ROC曲线得到肺鳞癌中评分RiskScore的最佳截断值,可用于肺鳞癌中抗氧化应激通路相关基因(KEAP1、NFE2L2、CUL3)突变的预测;本发明通过利用各个基因组合得到的表达量来预测肺鳞癌特定驱动通路基因突变,经TCGA数据库验证,该方法具有灵敏度高、特异性好的优点,可以有效指导肺鳞癌患者的个体化治疗,为精准治疗和个体化治疗添加更多重要的希冀,提高临床获益。
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公开(公告)号:CN113736888A
公开(公告)日:2021-12-03
申请号:CN202111161269.4
申请日:2021-09-30
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明提供了一种检测肺鳞癌抗氧化应激驱动通路相关基因突变的试剂、试剂盒和方法,本发明通过运用RNA测序、Lasso套索算法特征筛选抗氧化应激通路相关的基因,通过构建评分RiskScore,运用二分类logistic回归构建模型,并通过ROC曲线得到肺鳞癌中评分RiskScore的最佳截断值,可用于肺鳞癌中抗氧化应激通路相关基因(KEAP1、NFE2L2、CUL3)突变的预测;本发明通过利用各个基因组合得到的表达量来预测肺鳞癌特定驱动通路基因突变,经TCGA数据库验证,该方法具有灵敏度高、特异性好的优点,可以有效指导肺鳞癌患者的个体化治疗,为精准治疗和个体化治疗添加更多重要的希冀,提高临床获益。
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公开(公告)号:CN221228743U
公开(公告)日:2024-06-28
申请号:CN202322608513.8
申请日:2023-09-25
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本实用新型公开了一种用于阴茎根部皮瓣移植术后的阴茎固定内裤。包括内裤本体和阴茎固定装置,所述内裤本体的左侧和/或右侧设有用于从侧边穿脱的拉链或多组纽扣‑扣眼,所述内裤本体的裆部设有漏斗状的阴茎固定装置,所述阴茎固定装置与内裤本体之间通过环形拉链连接。本实用新型的阴茎固定内裤,能够使得阴茎处于直立位置,有效避免阴茎四周的移植皮瓣出现张力不均的情况,有助于其功能恢复和美观的需求。
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公开(公告)号:CN216964653U
公开(公告)日:2022-07-15
申请号:CN202122836989.8
申请日:2021-11-18
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: B01L3/02
Abstract: 本申请公开了气压式移液器量程转换接头,所述气压式移液器配合连接吸头用于转移液体,其特征在于,量程转换接头包括两段连通的空心圆柱,上空腔内设有上活塞,下空腔内设有下活塞,上活塞和下活塞之间通过连杆连接,还设有和外界连通的透气孔,透气孔位于上活塞和下活塞之间;上空腔的截面面积与下空腔的截面面积之比不为1;所述量程转换接头中继连接所述气压式移液器和所述吸头,使得移液器可精确吸取并转移多个其它量程范围内的液体,且本量程转换接头可以用于高温高压灭菌,采用此量程转换接头与移液器、吸头配套使用时,移液器不再与吸头直接相通,从而避免污染。
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