公开(公告)号：CN115678998A

公开(公告)日：2023-02-03

申请号：CN202211439309.1

申请日：2022-11-17

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 詹成 ,  梁嘉琪 ,  卞赟艺 ,  毕国澍 ,  张欢 ,  隋启海

IPC: C12Q1/6886 ,  C12N15/113 ,  C12Q1/6869 ,  G16B20/50

Abstract: 本发明公开了一种检测肺腺癌EGFR突变的miRNA标志物、试剂盒及方法。所述的miRNA标志物由miR‑10a‑5p、miR‑10b‑5p、miR‑34a‑5p、miR‑181a‑5p、miR‑203a‑3p、miR‑30e‑3p、miR‑542‑3p和miR‑4772‑3p组成。本发明通过运用limma包筛选与肺腺癌EGFR突变密切相关的差异miRNA，通过Lasso回归和logistic回归构建上述miRNA组合物的评分Score，可用于肺腺癌EGFR突变的检测。本发明的检测方法具有灵敏度、特异度高的特点，同时性价比高，能够简便、快速地为临床上EGFR‑TKI治疗提供科学的指导。

公开(公告)号：CN113564259A

公开(公告)日：2021-10-29

申请号：CN202111020869.9

申请日：2021-09-01

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 单光耀 ,  毕国澍 ,  卞赟艺 ,  詹成 ,  范虹

IPC: C12Q1/6886 ,  C12N15/113

Abstract: 本发明公开了一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型。本发明通过运用RNA测序、套索算法(LASSO)和二分类Logistic回归获得与细胞周期通路状态高度相关的ncRNA，并构建评分score，进而通过受试者工作曲线(ROC)分析得到肺腺癌中score相应的截断值，可用于预测肺腺癌细胞周期通路相关基因突变。本发明的预测模型经验证在应用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变中具有灵敏度高，特异性强的优点，具有较好的应用前景。

公开(公告)号：CN113444793A

公开(公告)日：2021-09-28

申请号：CN202110597293.6

申请日：2021-05-31

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 金星 ,  郑元生 ,  陈振淙 ,  卞赟艺 ,  毕国澍 ,  单光耀 ,  黄宜炜 ,  赵梦男 ,  詹成 ,  王群

IPC: C12Q1/6886 ,  C12N15/11 ,  G16B20/50

Abstract: 本发明涉及检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒，所述试剂盒含有检测以下基因表达量的检测试剂：RP11‑539L10.2、AKR1C2、RP11‑572H4.1、TRIM16L、RARA、SESN2、RP5‑827L5.2、CTD‑2139B15.5、Metazoa_SRP、snoU13、RP11‑545H22.1、KRT8P30、TALDO1、TRAPPC13P1、GS1‑388B5.2、RP11‑267L5.1、TRAV11、RP11‑699A7.1、AL132671.1。与现有技术相比，本发明通过运用RNA测序、LASSO和二分类Logistic回归筛选与抗氧化应激通路相关的基因，并构建评分Score，通过ROC曲线分析得到肺腺癌中相应评分的截断值，可用于肺腺癌中抗氧化应激通路相关基因(KEAP1、NFE2L2、CUL3)突变的预测。该发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变，经TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库，实验以及多组学数据库验证，发现该预测方法具有准确性高，特异性好的优点，有很好的应用前景。

公开(公告)号：CN113151471A

公开(公告)日：2021-07-23

申请号：CN202110465786.4

申请日：2021-04-28

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 卞赟艺 ,  毕国澍 ,  梁嘉琪 ,  郑元生 ,  单光耀 ,  薛亮 ,  张毅 ,  姚光宇 ,  詹成 ,  范虹

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明用于检测肺腺癌KRAS突变的基因组合物、试剂盒和方法，属于分子诊断技术领域。其中，基因组合物由以下25种基因组成：ELN、PODN、LAMC3、COL5A3、CRYAB、SOX18、AKT3、FAM101B、TIE1、SH3PXD2A、EXOC3L2、NOTCH1、NDST1、MMRN2、SH3RF3、ZMIZ1、RNF122、FLT4、F10、TLN1、SOX17、PIP5K1C、TMEM255B、WSCD1和PCDHB3。本发明中通过上述基因组合物构建Score评分模型用于检测肺腺癌KRAS突变，具有准确性高、灵敏度和特异性好的优点，操作便捷且可定量分析，应用前景广阔。

公开(公告)号：CN113151460A

公开(公告)日：2021-07-23

申请号：CN202110127761.3

申请日：2021-01-29

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 梁嘉琪 ,  陈振淙 ,  郑元生 ,  黄宜炜 ,  卞赟艺 ,  毕国澍 ,  詹成 ,  王群

IPC: C12Q1/6886 ,  A61K45/00 ,  A61P35/00

Abstract: 本发明涉及一种识别肺腺癌肿瘤细胞的基因标志物及其应用，属于分子生物学技术领域。所述基因标志物选自基因ERRFI1、MAL2、RNASE1、ATP11A、CYB5A、LGALS3BP、LPCAT1、SPINT2、ATP1A1、SMIM22和TSPAN3中的至少一种；其中MAL2、CYB5A和ATP11A这三种基因在肺腺癌肿瘤细胞的表达量为正常细胞的3‑6倍，本发明还通过Logistic回归方法建立了风险评估模型，以更准确地识别单细胞类型的肺腺癌肿瘤细胞，该模型的特异性和敏感性均接近90％。本发明的识别肺腺癌肿瘤细胞的基因标志物，为临床上研发诊断肺腺癌的方法和治疗肺腺癌的药物提供了新的分子靶标。

公开(公告)号：CN119736250A

公开(公告)日：2025-04-01

申请号：CN202411921248.1

申请日：2024-12-25

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 梁嘉琪 ,  詹成 ,  毕国澍 ,  黄小龙 ,  朱君侃 ,  王群

IPC: C12N5/10 ,  C12N15/12 ,  C12N15/867 ,  C12N15/113 ,  C12N9/22 ,  C12Q1/02 ,  C12R1/91

Abstract: 本发明公开了敲除CD24的肺癌细胞系及其构建方法和应用。本发明首先设计了一种特异性靶向人CD24的sgRNA，通过CRISPR‑Cas9基因编辑技术成功敲除人肺癌细胞系PC‑9、HCC827、H1975细胞中的CD24基因。通过Western blot检测蛋白表达以及Sanger测序，证实敲除细胞构建的成功。本发明的肺癌细胞系可用于研究CD24在肺癌中的作用机制；以及用于筛选靶向CD24的抗肺癌药物。因此，本发明细胞系可广泛应用于科研及临床相关基础研究。

公开(公告)号：CN115873955B

公开(公告)日：2024-08-23

申请号：CN202211664856.X

申请日：2022-12-22

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 毕国澍 ,  詹成 ,  梁嘉琪 ,  单光耀 ,  卞赟艺

IPC: C12Q1/6886

Abstract: 本发明公开了一种用于评估顺铂治疗肺腺癌敏感性的试剂盒。本发明首先基于一系列细胞实验，结果发现基因RETSAT对铁死亡具有重要的介导作用，由此推断，RETSAT适合于作为预后指标判断肺腺癌患者对顺铂治疗的敏感性。随后采用qPCR的方法检测34例接受顺铂治疗的患者手术切除标本中RETSAT的表达情况，并分析其预后情况，发现RETSAT高表达的患者对顺铂治疗的反应较低表达患者更为敏感，预后较好。因此，RETSAT的表达水平可以用于预判肺腺癌患者对顺铂治疗是否敏感或耐药，利用现有的检测试剂即可方便地检测RETSAT的表达量，具有良好的临床应用价值和推广应用价值。

公开(公告)号：CN117106914A

公开(公告)日：2023-11-24

申请号：CN202311103497.5

申请日：2023-08-30

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 毕国澍 ,  詹成 ,  梁嘉琪 ,  卞赟艺 ,  单光耀

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6851

Abstract: 本发明公开了一种培美曲塞/顺铂联合化疗治疗肺腺癌预后评估的ODC1基因标志物及其应用，一方面提出ODC1基因在制备培美曲塞/顺铂联合化疗治疗肺腺癌预后评估的试剂中的应用，ODC1基因的Ensembl号为ENST00000234111.9，同时还提出一种用于评估肺腺癌对培美曲塞/顺铂联合化疗敏感性的试剂盒，其包含检测ODC1表达量的试剂。本发明基于细胞实验和临床数据验证发现ODC1基因对铁死亡具有重要的介导作用，其表达水平与细胞对铁死亡诱导剂及联合化疗处理的敏感性相关，作为生物标志物来辅助预判肺腺癌患者对化疗的敏感性或耐受性，具有重要的临床应用价值。

公开(公告)号：CN115910204A

公开(公告)日：2023-04-04

申请号：CN202211395976.4

申请日：2022-11-09

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 詹成 ,  梁嘉琪 ,  卞赟艺 ,  毕国澍 ,  张欢 ,  隋启海

IPC: G16B20/50 ,  G16B40/00 ,  C12Q1/6886

Abstract: 本发明公开了一种检测肺腺癌EGFR突变的基因组合物及其应用。所述基因组合物由CST5、ENPP3、FNDC5、GLIS2、IFNLR1、LRRC31、PSPH、TNFRSF10B组成。本发明通过运用limma包筛选与肺腺癌EGFR突变密切相关的差异基因，通过Lasso回归和logistic回归构建上述基因表达组成的评分Score，可用于肺腺癌EGFR突变的检测。实验验证该评分检测模型方法具有灵敏度高、特异度高的特点，同时性价比高，具有广泛的应用前景。

公开(公告)号：CN115747332A

公开(公告)日：2023-03-07

申请号：CN202211251112.5

申请日：2022-10-13

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 卞赟艺 ,  詹成 ,  毕国澍 ,  梁嘉琪 ,  单光耀 ,  金星 ,  张欢 ,  范虹 ,  王群

IPC: C12Q1/6886 ,  G16B25/10 ,  G16B20/50

Abstract: 本发明公开了一种检测肺腺癌SMAD4突变的试剂盒。本发明通过运用limma包筛选与SMAD4密切相关的差异基因，通过Lasso回归最终挑选出13个基因TRIM48，HS3ST1，GPA33，STK39，GPR110，IPCEF1，ALPPL2，KCNQ3，ADAM28，CDC42EP1，ZBTB18，MYCN和HKDC1，并通过logistic回归构建上述基因组成的评分模型；绘制受试者工作特征曲线获得截断值，可用于肺腺癌SMAD4突变的检测。实验验证该方法具有灵敏度、特异度高的特点，有广泛的应用前景。