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公开(公告)号:CN110029156B
公开(公告)日:2022-07-29
申请号:CN201910379421.2
申请日:2019-05-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊KAT6A基因CNV标记的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊KAT6A基因拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKDR1基因片段作为内参,利用2–ΔΔCt的方法计算个体的拷贝数,通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,该拷贝数变异区域的不同基因型显著影响茶卡羊的生长性状。本发明在DNA水平上检测与茶卡羊生长性状密切相关的分子遗传标记,可用于茶卡羊生长性状的标记辅助选择,以便快速建立遗传资源优良的茶卡羊种群。
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公开(公告)号:CN110079610A
公开(公告)日:2019-08-02
申请号:CN201910379625.6
申请日:2019-05-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊BAG4基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊血样全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊BAG4基因的拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKDR1基因片段作为内参,利用2-ΔCt的方法计算个体的拷贝数,通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,该拷贝数变异区域的不同基因型显著影响茶卡羊的生长性状,本发明在DNA水平上检测与茶卡羊生长性状密切相关的分子遗传标记,可用于茶卡羊生长性状的标记辅助选择,从而快速建立优良的茶卡羊种群,该方法具有简单、快速,便于推广应用的特点。
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公开(公告)号:CN109988847A
公开(公告)日:2019-07-09
申请号:CN201910308792.1
申请日:2019-04-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊SHE基因的拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKRD1基因片段作为内参,然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,本发明提供的检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法为建立茶卡羊SHE基因拷贝数变异与体长性状之间的关联奠定了基础,可用于加快茶卡羊体长性状的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110079615B
公开(公告)日:2022-07-19
申请号:CN201910498477.X
申请日:2019-06-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊KMT2D基因CNV标记的方法及其应用:所述的CNV标记是指茶卡羊KMT2D基因候选区域Chr3:136830401‑136832800内的拷贝数变异,以茶卡羊基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR分别扩增茶卡羊KMT2D基因CNV区域和内参基因ANKRD1部分片段,根据2*2‑ΔCt将定量结果分为增加型、减少型和正常型。本发明在DNA水平上检测与茶卡羊体长性状密切相关的CNV标记,可作为茶卡羊生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,以便快速建立遗传资源优良的茶卡羊种群。
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公开(公告)号:CN110964790A
公开(公告)日:2020-04-07
申请号:CN201911404426.2
申请日:2019-12-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊PIGY基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩增茶卡羊PIGY基因的拷贝数变异区域部分片段,利用另外一对特异引物扩增茶卡羊的ANKRD1基因部分片段作为参照,然后利用2*2-ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型,根据对拷贝数变异与茶卡羊生长性状的关联分析结果,本发明提供的方法为利用茶卡羊PIGY基因CNV标记建立生长性状的优势种群奠定了基础,有利于加快分子标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号:CN110029156A
公开(公告)日:2019-07-19
申请号:CN201910379421.2
申请日:2019-05-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊KAT6A基因CNV标记的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊KAT6A基因拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKDR1基因片段作为内参,利用2–ΔΔCt的方法计算个体的拷贝数,通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,该拷贝数变异区域的不同基因型显著影响茶卡羊的生长性状。本发明在DNA水平上检测与茶卡羊生长性状密切相关的分子遗传标记,可用于茶卡羊生长性状的标记辅助选择,以便快速建立遗传资源优良的茶卡羊种群。
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公开(公告)号:CN102226200A
公开(公告)日:2011-10-26
申请号:CN201110109953.8
申请日:2011-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12N15/85 , A01K67/027
Abstract: 本发明涉及了一种牛Nramp1巨噬细胞特异性表达载体及其构建方法和应用。该方法以质粒pIRES2-EGFP为骨架载体,在多克隆位点Sal I与BamH I之间插入牛Nramp1开放阅读框序列,并用Nramp1基因表达调控序列替换掉骨架载体上巨细胞病毒(CMV)启动子序列,从而实现Nramp1基因在吞噬细胞内的特异性表达。本载体可以作为一种转基因载体应用在转基因抗病动物培育中。本发明还指出秦川牛Nramp1开放阅读框序列与GenBank中相应序列(GenBank序列号U12862.1)相似率为99.88%,存在两个碱基差异。
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公开(公告)号:CN110964790B
公开(公告)日:2023-02-21
申请号:CN201911404426.2
申请日:2019-12-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊PIGY基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩增茶卡羊PIGY基因的拷贝数变异区域部分片段,利用另外一对特异引物扩增茶卡羊的ANKRD1基因部分片段作为参照,然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型,根据对拷贝数变异与茶卡羊生长性状的关联分析结果,本发明提供的方法为利用茶卡羊PIGY基因CNV标记建立生长性状的优势种群奠定了基础,有利于加快分子标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号:CN110079610B
公开(公告)日:2022-08-19
申请号:CN201910379625.6
申请日:2019-05-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊BAG4基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊血样全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊BAG4基因的拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKDR1基因片段作为内参,利用2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数,通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,该拷贝数变异区域的不同基因型显著影响茶卡羊的生长性状,本发明在DNA水平上检测与茶卡羊生长性状密切相关的分子遗传标记,可用于茶卡羊生长性状的标记辅助选择,从而快速建立优良的茶卡羊种群,该方法具有简单、快速,便于推广应用的特点。
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公开(公告)号:CN109988847B
公开(公告)日:2022-07-19
申请号:CN201910308792.1
申请日:2019-04-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊SHE基因的拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKRD1基因片段作为内参,然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,本发明提供的检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法为建立茶卡羊SHE基因拷贝数变异与体长性状之间的关联奠定了基础,可用于加快茶卡羊体长性状的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。
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