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公开(公告)号:CN109486922A
公开(公告)日:2019-03-19
申请号:CN201710805585.8
申请日:2017-09-08
Applicant: 深圳华大基因股份有限公司
IPC: C12Q1/6869
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2565/519 , C12Q2525/191 , C12Q2535/122
Abstract: 一种基于单引物探针捕获检测微生物目标序列的方法,包括:将包含微生物目标序列的DNA样本片段化,然后进行末端修复;将末端修复后的DNA片段连接接头;使用单引物探针与靶序列的探针结合位点退火并延伸以进行靶序列捕获,其中探针结合位点位于靶序列的上游或下游,单引物探针包括探针序列部分和位于探针序列部分5’端的公共序列部分;使用一对通用PCR引物对捕获的靶序列进行扩增;对扩增产物进行测序分析。本发明的方法省去洗脱进行目的片段分离,简化操作步骤,减少目的片段不必要的损失,且杂交时间相对较短,适合快速检测需求;单引物探针即可进行捕获,减少前期探针设计的复杂度;扩增时采用公用引物去除不同引物富集产生的不均一性。
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公开(公告)号:CN108823312A
公开(公告)日:2018-11-16
申请号:CN201810741532.9
申请日:2018-07-05
Applicant: 苏州科诺医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/686 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q1/686 , C12Q2561/101 , C12Q2565/519
Abstract: 一种快速检测ALK融合基因的方法及富集探针和探测引物,属于基因检测领域。该方法先设置SEQ ID:1-28的富集探针捕获特异性匹配的DNA,再设置SEQ ID:29-50中的任意一对探测引物通过PCR方法检测ALK融合基因是否存在。该方法是基于富集探针和探测引物检测ALK融合基因的方法,具有快速准确、对样品要求低、灵敏度与特异性高等的优点,能够大幅提高肺癌的精治疗水平。
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公开(公告)号:CN108431234A
公开(公告)日:2018-08-21
申请号:CN201680063151.9
申请日:2016-09-06
Applicant: 纳米线科技公司
IPC: C12Q1/6827 , C12Q1/6876
CPC classification number: C12Q1/6827 , C12Q2525/161 , C12Q2525/313 , C12Q2563/179 , C12Q2565/514 , C12Q2565/519
Abstract: 本发明尤其涉及能够以单碱基分辨率准确和稳健地无酶和无扩增检测DNA和RNA(例如,检测单核苷酸多态性(SNP)、插入和缺失)的聚合物链、探针、组合物、方法和试剂盒。所述组合物、方法和试剂盒可进一步提供DNA和/或RNA和蛋白靶标的同时检测。
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公开(公告)号:CN107858426A
公开(公告)日:2018-03-30
申请号:CN201710726323.2
申请日:2017-08-22
Applicant: 上海派森诺生物科技股份有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6806
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q1/6806 , C12Q2600/106 , C12Q2600/156 , C12Q2565/519 , C12Q2531/113
Abstract: 本发明公开的一种用于肿瘤个体化用药16个基因热点检测的杂交捕获试剂盒,包括杂交用试剂、PCR扩增试剂及富集度检测试剂;其中所述杂交用试剂包括如下SEQ NO.1-SEQ NO.396探针混合物,且每条探针之间的摩尔数比均为1:1,检测时,浓度为10nM each的上述探针混合物用量为1μl。本发明的试剂盒是基于二代测序技术的基因检测,可一次性检测3种变异类型(突变、插入缺失、融合),同时应用高测序深度覆盖微量基因变异,从而在样本有限的前提下精准检测患者的突变情况,可准确检测1%的突变频率。一方面,多基因高敏感性的平行检测提升了可用药基因变异的检出率,不错失用药的机会;另一方面,可在一次检测中同时检出热点、罕见甚至是未知的基因变异,在发现药物敏感性突变的同时检测相关的耐药突变(如KRAS和ALK点突变),准确地反映患者用药后的敏感及耐药信息。
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公开(公告)号:CN107723353A
公开(公告)日:2018-02-23
申请号:CN201610664448.2
申请日:2016-08-12
Applicant: 嘉兴允英医学检验有限公司
IPC: C12Q1/6869
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2535/122 , C12Q2565/519 , C12Q2531/113
Abstract: 本发明公开了一种白血病基因突变和基因融合的高通量检测方法,本方法选取目前白血病最常见的突变基因和融合基因,结合第二代高通量测序技术,更全面的检测白血病的基因突变和融合情况。第二代高通量测序技术比目前多采用经典的Sanger测序方法检通量大、测序时间段、精确度高、费用低和信息量丰富,可以在短时间内对目标基因进行精确定位和分析。本方法在高通量检测技术的帮助下,可以为临床医生提供更为详尽的基因突变和融合谱来综合判断白血病的预后、指导个性化治疗。
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公开(公告)号:CN107723351A
公开(公告)日:2018-02-23
申请号:CN201610661854.3
申请日:2016-08-12
Applicant: 嘉兴允英医学检验有限公司
IPC: C12Q1/6869
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2535/122 , C12Q2565/549 , C12Q2565/519
Abstract: 本发明公开了一种循环肿瘤DNA肺癌驱动基因的高通量检测方法,本方法选取目前肺癌最常见的突变基因,结合第二代高通量测序技术,更全面的检测肺癌的基因突变情况。由于采用患者的血浆样本,因此,本方法可以极大的降低患者检测的创伤;其次、对22个肺癌基因进行全外显子检测,比基于real-time PCR和一代Sanger测序技术平台的检测方法更全面;由于只对22个基因进行检测,能以更高的测序深度对样本进行检测,因此,检测的精度可以达到0.1%。从而为患者的更多、更优的个体化精准治疗方案提供参考。
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公开(公告)号:CN107236727A
公开(公告)日:2017-10-10
申请号:CN201710397693.6
申请日:2017-05-31
Applicant: 江苏为真生物医药技术股份有限公司
CPC classification number: C12Q1/6806 , C12Q2525/117 , C12Q2563/143 , C12Q2563/149 , C12Q2565/519
Abstract: 本发明公开了一种多基因捕获测序的单链探针制备方法,该方法包括如下步骤:1、芯片合成,2、芯片DNA洗脱,3、用含dUTP的PCR反应体系扩增芯片DNA,4、PCR产物用磁珠纯化,5、使用单引物偏向扩增,该引物5’端经生物素标记,得到含有生物素单链与含有dUTP的链的杂合双链DNA,6、加入能够识别并切除dUTP的酶,将5步中的含有dUTP的母链消化,7、消化后产物经纯化,得到含有生物素标记的单链探针,8、稀释至所需浓度并进行分装保存。与市售合成的探针相比,酶法反应条件温和,成本降低,易于推广。
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公开(公告)号:CN107002147A
公开(公告)日:2017-08-01
申请号:CN201580067328.8
申请日:2015-12-02
Applicant: 通用电气公司
CPC classification number: C12Q1/6816 , C07H21/00 , C12Q1/6806 , C12Q2525/121 , C12Q2525/151 , C12Q2525/204 , C12Q2527/125 , C12Q2531/125 , C12Q2563/107 , C12Q2563/131 , C12Q2525/125 , C12Q2565/519 , C12Q2565/625
Abstract: 本文提供一种方法,其中俘获靶核酸的方法包括将核酸俘获探针施加至需要定义的俘获区,其中具有第一分子量的核酸俘获探针至少包含与靶核酸序列的至少一部分互补的序列,且核酸俘获探针基本固定在基质的俘获区上。所述方法进一步包括将包含具有第二分子量的靶核酸的样品施加至基质的样品施加区;其中包含靶核酸的样品通过侧向流动流经从样品施加区至俘获区的一段基质,且靶核酸通过与俘获区杂交被核酸俘获探针俘获。
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公开(公告)号:CN106967828A
公开(公告)日:2017-07-21
申请号:CN201710349783.8
申请日:2017-05-17
Applicant: 上海默礼生物医药科技有限公司
CPC classification number: C12Q1/6806 , C12Q1/686 , C12Q2527/125 , C12Q2563/143 , C12Q2563/149 , C12Q2563/107 , C12Q2565/519
Abstract: 本发明涉及一种用于检测低拷贝结核分枝杆菌的核酸提取试剂,其包括含有SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:2所示序列的捕获引物的裂解液;本发明还涉及包括上述核酸提取试剂的试剂盒及其检测方法,所述试剂盒包括冻干粉型荧光PCR反应体系,该反应体系包括如SEQ ID NO:3‑SEQ ID NO:4所示序列的结核分枝杆菌扩增引物和如SEQ ID NO:5所示的结核分枝杆菌扩增探针、冻干骨架、冻干保护剂、dNTPs和酶混合液。本发明通过优化结核分枝杆菌核酸的提取过程,尽量减少对荧光PCR产生的干扰物质,能够针对多种样本应用荧光PCR技术完成对低拷贝结核分枝杆菌核酸的检测;同时通过将结核分枝杆菌检测体系冻成干粉状,最大程度上增加荧光PCR的上样量,增强了结核分枝杆菌的检测出率。
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公开(公告)号:CN106929588A
公开(公告)日:2017-07-07
申请号:CN201710242214.3
申请日:2017-04-12
Applicant: 北京迈博恒业科技有限责任公司
CPC classification number: C12Q1/6883 , C12Q1/6869 , C12Q2600/156 , C12Q2600/166 , C12Q2565/519
Abstract: 本发明公开了SLC26A4基因捕获探针及其在SLC26A4基因突变检测中的应用。本发明公开的SLC26A4基因捕获探针的制备方法,包括:制备N个亚探针,连接N个亚探针,得到SLC26A4基因捕获探针;N为大于等于2的一个自然数;N个亚探针满足N个亚探针能覆盖SLC26A4基因的全部序列;在SLC26A4基因上任何两个相邻的亚探针均满足上游亚探针的下游有一个或多个核苷酸与下游亚探针的上游重叠;N个亚探针的长度均为50‑150bp。实验证明,利用本发明的SLC26A4基因捕获探针既能准确判断SLC26A4基因外显子的突变情况,又能精确定位至断裂点区域和片段大小。
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