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公开(公告)号：CN108949746A
公开(公告)日：2018-12-07
申请号：CN201810814365.6
申请日：2018-07-23
申请人： 杭州和壹基因科技有限公司
IPC分类号： C12N15/10 , C12Q1/6806
CPC分类号： C12N15/1013 , C12Q1/6806 , C12Q2523/125
摘要： 本发明提供一种人粪便总DNA亚硫酸盐转化及纯化的方法，采用热变性法95℃10‑20分钟后，立即冰置5‑10分钟防止复性，然后将DNA在75℃进行转化45‑60分钟，并采用磁珠法以及含PEG6000/8000的结合液对转化DNA进行纯化，能够得到高转化率、高质量的甲基化DNA，有利于甲基化检测的标准化及全自动化操作，用于后续粪便样本中人源DNA中基因的甲基化水平分析。
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公开(公告)号：CN108495937A
公开(公告)日：2018-09-04
申请号：CN201680079795.7
申请日：2016-11-25
申请人： 新加坡科技研究局
IPC分类号： C12Q1/6858
CPC分类号： C12Q1/6858 , C12Q1/6886 , C12Q2600/154 , C12Q2523/125 , C12Q2525/113 , C12Q2535/131 , C12Q2537/163 , C12Q2563/155 , C12Q2565/107
摘要： 本发明涉及用于确定样品中靶核酸分子的甲基化状态的方法和试剂盒，其包括：(a)用亚硫酸氢盐处理所述靶核酸；(b)用甲基化特异性引物扩增经处理的靶核酸；(c)使扩增子与甲基化特异性等离子体纳米探针接触；以及(d)基于杂交探针和所述靶核酸的解链温度Tm，确定所述甲基化状态。特别地，等离子体金纳米颗粒共价偶联至吗啉代寡核苷酸探针。本发明还请求保护用于确定Septin 9(SEPT9)基因启动子的甲基化状态的方法和试剂盒。
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公开(公告)号：CN108350485A
公开(公告)日：2018-07-31
申请号：CN201680061631.1
申请日：2016-10-26
申请人： 精密科学发展有限责任公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/686
CPC分类号： C12Q1/6806 , C12N15/1006 , C12Q1/6837 , C12Q1/686 , C12Q2600/154 , C12Q2600/166 , C12Q2523/125 , C12Q2527/146 , C12Q2537/143 , C12Q2563/159 , C12Q2537/149 , C12Q2561/109 , C12Q2521/537 , C12Q2527/125 , C12Q2563/149
摘要： 本文提供的技术涉及经亚硫酸氢盐处理的DNA的基于扩增的检测，具体地涉及但非仅涉及在进一步表征样品DNA之前用于低水平样品DNA的多重扩增的方法和组合物。该技术还提供了从血液或血液产品样品例如血浆样品分离DNA的方法。
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公开(公告)号：CN104520442B
公开(公告)日：2018-05-01
申请号：CN201380039009.7
申请日：2013-05-22
申请人： 约翰霍普金斯大学
发明人： S·苏库马尔 , 玛丽·乔·法克勒 , 维·文·泰奥 , 索伊拉·阿雷利·洛佩斯布让达
CPC分类号： C12Q1/6883 , C12Q1/686 , C12Q1/6886 , C12Q2600/118 , C12Q2600/154 , C12Q2600/16 , C12Q2523/125 , C12Q2525/301 , C12Q2545/114 , C12Q2563/107 , C12Q2565/1015
摘要： 本发明的cMethDNA方法是QM‑MSP方法(美国专利号8,062,849)的新颖的改进，特别地旨在以已经报道的最低拷贝数定量检测流体诸如血清或血浆中的肿瘤DNA(或其他循环DNA)。与任何其他基于PCR的测定相比特有的是，将少量拷贝的合成的多核苷酸标准品(STD基因)添加至等分的患者血清。在标准过程中，将用于多个感兴趣的基因(TARGET基因)的标准品的混合物添加至血清样品。纯化并处理总DNA后，进行PCR(多重步骤)，其中用相同的外部引物组共扩增STD基因和TARGET基因。在第二巢式PCR步骤中，存在于第一PCR反应的稀释物中的扩增子经受实时PCR，并通过双色实时PCR对一个孔中的各基因进行定量。产物通过用对甲基化的TARGET基因和相关的STD基因特异性的内部引物组的绝对定量来计算。公开了制备STD基因标准品的方法及cMethDNA方法的用途以及包含其的试剂盒。
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公开(公告)号：CN105074010B
公开(公告)日：2018-04-17
申请号：CN201480018778.3
申请日：2014-03-07
申请人： 积水医疗株式会社 , 国立大学法人三重大学
CPC分类号： C12Q1/6848 , C12Q1/6827 , C12Q1/686 , G01N30/96 , C12Q2523/125 , C12Q2565/137 , G01N2030/8827
摘要： 本发明提供一种迅速且简便的甲基化DNA的检测方法。一种甲基化DNA的检测方法，其特征在于，包括以下工序：(1)用亚硫酸氢盐处理样品DNA的工序；(2)将该用亚硫酸氢盐处理了的样品DNA通过PCR进行扩增的工序；以及(3)将得到的PCR扩增产物施加于离子交换色谱的工序。
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公开(公告)号：CN107760773A
公开(公告)日：2018-03-06
申请号：CN201711016714.1
申请日：2017-10-26
申请人： 北京中仪康卫医疗器械有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q2523/125 , C12Q2525/191 , C12Q2531/113
摘要： 本发明提供了一种对胚胎培养液进行单细胞简化代表性重亚硫酸盐测序（Single-cell reduced-representation bifulfite sequencing，scRRBS）的方法。本发明采用“试管婴儿”操作中的医疗废弃物（囊胚培养液）为原料，可同时对胚胎的染色体非整倍性状况及DNA甲基化状况进行双重分析，从表观遗传及胚胎与培养环境的反应的全新角度评估胚胎的发育潜能，为在辅助生殖中选择“正确”的胚胎提供了新的参考，对提高“试管婴儿”周期的成功率提供了强力支持。
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公开(公告)号：CN107667179A
公开(公告)日：2018-02-06
申请号：CN201680030118.6
申请日：2016-06-10
申请人： 拜奥卡蒂斯股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12M1/00
CPC分类号： C12Q1/6806 , B01L7/525 , B01L2400/0487 , C12Q1/6827 , C12Q2523/125 , C12Q2527/101
摘要： 本发明基于通过以下的敏感且特异性的甲基化检测的发现：a)在通过将DNA转化试剂(例如，亚硫酸氢盐试剂)直接与含有核酸的样品一起温育而控制转化前的过量DNA降解，而不需要从所述样品预先纯化核酸且不需要在98℃的升高的温度下预先使核酸变性，和b)通过控制亚硫酸氢盐处理的样品在自动化系统内的提取膜上的泵送流动速率而优化亚硫酸氢盐去除。
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公开(公告)号：CN107406874A
公开(公告)日：2017-11-28
申请号：CN201580068711.5
申请日：2015-12-18
申请人： 表观基因组股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6848 , C12Q1/6858 , C12Q2600/154 , C12Q2600/156 , C12Q2600/158 , C12Q2523/125 , C12Q2525/186 , C12Q2525/197 , C12Q2525/204 , C12Q2537/163 , C12Q2537/164
摘要： 本发明涉及药物基因组学领域，并且特别地涉及检测高甲基化DNA的存在或不存在。DNA标记中CpG甲基化的检测可用于癌症的诊断，并且本发明为此提供了改进的方法。这些改进的方法特别地允许在未甲基化DNA标记的高背景下更灵敏地检测甲基化DNA标记。
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公开(公告)号：CN107254539A
公开(公告)日：2017-10-17
申请号：CN201710622707.X
申请日：2012-07-27
申请人： 剑桥表现遗传学有限公司
发明人： 迈克尔·约翰·布思 , 尚卡尔·巴拉苏不拉曼尼安
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6876 , C01G55/002 , C07H1/00 , C07H21/02 , C07H21/04 , C12Q1/6806 , C12Q1/6827 , C12Q2600/154 , C12Q2523/115 , C12Q2523/125 , C12Q1/6869
摘要： 本发明涉及修饰的胞嘧啶残基，如5‑甲基胞嘧啶(5mC)、5‑羟甲基胞嘧啶(5hmC)和5‑甲酰基胞嘧啶(5fC)的识别，以与样品核苷酸序列中的胞嘧啶(C)区别开来。本方法可包括氧化或还原包括样品核苷酸序列的多核苷酸的第一部分；用重亚硫酸盐处理氧化的或还原的多核苷酸的第一部分和第二部分；在步骤ii)和iii)后，测序群体中第一和第二部分中的多核苷酸，以分别生成第一和第二核苷酸序列，以及；识别对应于样品核苷酸序列中胞嘧啶的第一和第二核苷酸序列中的残基。这些方法例如可用于基因组DNA和/或RNA的分析中。
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公开(公告)号：CN106480210A
公开(公告)日：2017-03-08
申请号：CN201611044422.4
申请日：2016-11-22
申请人： 敬善生物科技(上海)有限公司
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6848 , C12Q1/6858 , C12Q2600/154 , C12Q2600/158 , C12Q2600/166 , C12Q2523/125 , C12Q2545/101 , C12Q2545/113 , C12Q2563/107
摘要： 本发明提供了肿瘤循环DNA甲基化PCR检测引物、探针、阻断片段和试剂盒，以及检测肿瘤循环DNA甲基化的方法。本发明具有灵敏度高，特异性强、重复性好、操作简单、安全等优点，检测结果具有较高的精密度和重复性，对大肠癌的早期检测有一定的辅助诊断作用。
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