一种可用于摇摆型碱基对等位基因分型精准测定的比率型DNA电化学传感器

    公开(公告)号:CN116559257A

    公开(公告)日:2023-08-08

    申请号:CN202310504271.X

    申请日:2023-05-07

    Abstract: 本发明公开一种可用于摇摆型碱基对等位基因分型的比率型DNA电化学传感器,特点是创新性地利用非特异性扩增策略(连接酶链式反应,LCR),以及与摇摆型碱基对(GT、AC)相比,沃克森碱基对(GC、AT)具有更高扩增效率且在LCR中占主导作用的特性。以等位基因为目标基因,基于沃克森碱基对互补原则,设计了两个LCR(LCRFc→G和LCRMB→A),选用在临床样品中具备稳定检测性能的电活性指示剂二茂铁(Fc)和亚甲基蓝(MB)作为两个LCR的电化学响应信号,并将其电流比值(IMB/IFc)作为等位基因分型的输出信号,最后,依据IMB/IFc区域划分可实现摇摆型碱基对等位基因分型(纯合野生型、纯合突变型、杂合型)的精准测定。

    一种可用于临床样品等位基因分型的DNA纳米筛可再生电化学传感器

    公开(公告)号:CN112326763A

    公开(公告)日:2021-02-05

    申请号:CN202011018217.7

    申请日:2020-09-24

    Abstract: 本发明公开一种可用于临床样品等位基因分型的DNA纳米筛可再生电化学传感器,特点是通过巯基修饰DNA在金电极表面的自组装构建一种能够区分ssDNA和dsDNA的界面型DNA纳米筛,其空腔大小可以通过改变巯基修饰DNA的浓度来调节,通过以[Ru(NH3)6]3+为氧化还原的电化学计时库仑法对界面上巯基DNA的间距进行表征,当巯基修饰DNA的间距小于dsDNA的长度时,dsDNA由于其刚性结构不能透过DNA纳米筛,而无规则卷曲结构的ssDNA由于其高度的柔韧性可以进入纳米筛,通过引入再生探针,构建了重现性性较好的DNA电化学模型。最后,我们以连接循环反应(LCR)为单链DNA扩增策略,构建了基于可再生纳米筛的DNA电化学传感器,实现了单个传感器的多个临床样本的连续检测。

    一种连接酶结合核酸外切酶“零背景”检测CYP2C19*2基因型的电化学方法

    公开(公告)号:CN115109855A

    公开(公告)日:2022-09-27

    申请号:CN202210274079.1

    申请日:2022-03-20

    Abstract: 本发明公开一种连接酶结合核酸外切酶“零背景”检测CYP2C19*2基因型的电化学方法。特点是选用生物样品检测中稳定性较强的电活性指示剂亚甲蓝(MB)修饰信号探针,作为电信号来源,结合两种酶促反应特异性扩增、剪切的特性,仅当CYP2C19*2存在时,MB修饰长ssDNA才会被指数扩增出来,随后,此ssDNA通过“倒立型”结构形式被具有筛选ssDNA特性的高密度DNA自组装单分子层捕获杂交,MB靠近金电极表面,发生电子传递,最后,使用方波伏安法(SWV)搜集电信号。在人全血临床样品检测中,本发明可区分CYP2C19*2的三种基因型,且实现了“零背景”空白检测。此外,本发明对如何降低检测背景信号具有较为重要的设计参考价值,同时可为个体化药物基因型检测方法提供新思路、新方向。

    一种可用于临床样品等位基因分型的DNA纳米筛可再生电化学传感器

    公开(公告)号:CN112326763B

    公开(公告)日:2022-10-21

    申请号:CN202011018217.7

    申请日:2020-09-24

    Abstract: 本发明公开一种可用于临床样品等位基因分型的DNA纳米筛可再生电化学传感器,特点是通过巯基修饰DNA在金电极表面的自组装构建一种能够区分ssDNA和dsDNA的界面型DNA纳米筛,其空腔大小可以通过改变巯基修饰DNA的浓度来调节,通过以[Ru(NH3)6]3+为氧化还原的电化学计时库仑法对界面上巯基DNA的间距进行表征,当巯基修饰DNA的间距小于dsDNA的长度时,dsDNA由于其刚性结构不能透过DNA纳米筛,而无规则卷曲结构的ssDNA由于其高度的柔韧性可以进入纳米筛,通过引入再生探针,构建了重现性性较好的DNA电化学模型。最后,我们以连接循环反应(LCR)为单链DNA扩增策略,构建了基于可再生纳米筛的DNA电化学传感器,实现了单个传感器的多个临床样本的连续检测。

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