一种分子检测和鉴定甘蔗赤条病菌不同株系的试剂盒

    公开(公告)号:CN106222291B

    公开(公告)日:2019-06-28

    申请号:CN201610686714.1

    申请日:2016-08-19

    IPC分类号: C12Q1/689 C12Q1/04 C12R1/38

    摘要: 本发明涉及一种分子检测和鉴定甘蔗赤条病菌Acidovorax avenae subsp.avenae(Aaa)不同株系试剂盒。本发明的试剂盒中至少包括外侧引物对16S‑F4/23S‑R4和内侧引物对ITS‑F1/ITS‑R1,试剂盒内还有PCR反应液I和II、限制性内切酶反应液、Ex Taq酶液、HindIII内切酶、EcoRI内切酶、阳性样品DNA、阴性样品DNA和无核酸酶无菌水。本发明集合了巢式PCR检测方法的高度灵敏性和限制性内切酶切条带长度多态性与唯一性等优点,为甘蔗赤条病菌检测和鉴定提供了一种简便、快速、准确的方法。采用本发明试剂盒提供的试剂,经检测可判定是甘蔗赤条病菌及其株系类型。

    一种检测甘蔗褐锈病菌或黄锈病菌的PCR方法

    公开(公告)号:CN103060456A

    公开(公告)日:2013-04-24

    申请号:CN201310015703.7

    申请日:2013-01-16

    IPC分类号: C12Q1/68 C12Q1/04 C12R1/645

    摘要: 本发明涉及一种检测甘蔗褐锈病菌或黄锈病菌的PCR方法,包括基因组DNA的提取、PCR检测体系建立和PCR扩增产物的检测。本发明的一种检测甘蔗褐锈病菌或黄锈病菌的PCR方法,具有灵敏度高、效率高和所需要的DNA用量少的特点;与常规的根据病菌培养后的孢子形态特征鉴定或根据田间种植后病害表型症状鉴定的方法相比,具有操作简便快速、准确性高、高效和实用性好等优点。为甘蔗褐锈病菌和黄锈病菌的鉴定,提供了高灵敏度和高效率的快速检测体系,可用于田间甘蔗褐锈病菌和黄锈病菌的早期诊断及检测,对抗褐锈病或抗黄锈病甘蔗育种和抗褐锈病或抗黄锈病甘蔗种质资源的保护具有重要的意义。

    甘蔗黄锈病菌PCR检测方法

    公开(公告)号:CN102876798A

    公开(公告)日:2013-01-16

    申请号:CN201210397011.9

    申请日:2012-10-18

    IPC分类号: C12Q1/68 C12Q1/04 C12R1/645

    摘要: 本发明涉及一种甘蔗黄锈病菌的PCR检测方法,包括基因组DNA的提取、PCR检测体系建立和PCR扩增产物的检测。本发明的甘蔗黄锈病菌PCR检测方法,具有灵敏度高,所需要的DNA用量少的特点;与常规的根据病菌培养后的孢子形态特征鉴定或根据田间种植后病害表型症状鉴定的方法相比,具有实用性好、准确性高和操作简便快速等优点。为甘蔗黄锈病菌的鉴定,提供了高灵敏度的快速检测体系,可用于田间甘蔗黄锈病菌的早期诊断及检测,对我国抗黄锈病甘蔗育种和抗黄锈病甘蔗种质资源的保护具有重要的意义。

    一种检测甘蔗中寄生白条病菌的实时荧光定量PCR方法

    公开(公告)号:CN102312015B

    公开(公告)日:2013-01-09

    申请号:CN201110316556.8

    申请日:2011-10-18

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/11 C12R1/64

    摘要: 本发明涉及一种检测甘蔗中寄生白条病菌拷贝数的实时荧光定量PCR方法。首先提供了一种利用实时荧光定量PCR方法检测甘蔗中寄生白条病菌的引物及探针,所述的引物为以下序列的引物对:正向引物序列5’-GGTTCCATTGCTTACCGATT-3’,反向引物序列5’-CAAGTTTCGACAGGAACAGC-3’,探针序列是FAM-5-CCACGGCTACGTCAATTCGGG-3-TAMRA,然后采集和处理甘蔗蔗汁并提取总DNA,利用实时荧光定量PCR方法检测甘蔗中感染的白条病菌HrpB基因,通过扩增过程生成的Ct值,代入标准曲线方程,转换成起始反应的DNA分子拷贝数,从而达到定量检测甘蔗中感染白条病菌数量的目的。

    利用SCAR标记鉴定甘蔗抗褐锈病性方法

    公开(公告)号:CN102586460B

    公开(公告)日:2012-12-19

    申请号:CN201210070465.5

    申请日:2012-03-17

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 本发明涉及一种利用SCAR标记鉴定甘蔗抗褐锈病性的方法,包括基因组DNA的提取、SCAR-PCR标记的检测体系建立和SCAR-PCR产物的检测。本发明的利用SCAR标记鉴定甘蔗抗褐锈病性的方法,具有灵敏度高,所需要的DNA用量少的特点;与常规的抗性鉴定相比,具有操作简便、检测时间短、准确性高、容易判断、重复性好和不受环境条件影响等优点。为甘蔗种质资源的评价和新品种的审定工作,提供了更为简便有效的抗褐锈病性鉴定体系,对加强我国抗褐锈病甘蔗育种和抗褐锈病甘蔗种质资源的保护工作具有重要意义。

    一种大批量快速制备PCR模板的方法

    公开(公告)号:CN101294221B

    公开(公告)日:2011-05-04

    申请号:CN200810071267.4

    申请日:2008-06-23

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/10

    摘要: 一种大批量快速制备PCR模板的方法,属植物分子检测技术领域,具体涉及植物组织在裂解液中加热裂解和裂解液中和。本发明的技术方案是:将微量植物叶片放入一定体积的裂解液中加热裂解,然后中和,反应混合液可直接作为PCR反应的模板,在添加适量聚合酶稳定剂的情况下,PCR反应稳定,重复性强。该方法特别适宜大批量PCR反应模板的快速制备,可以大幅度提高分子检测和遗传分析的效率,极显著地降低成本。