一种甘蔗全长转录组数据大规模开发的SSR引物

    公开(公告)号:CN108841983A

    公开(公告)日:2018-11-20

    申请号:CN201810650240.4

    申请日:2018-06-22

    Abstract: 本发明提供一种甘蔗全长转录组数据大规模开发的SSR标记引物,基于22甘蔗栽培种的不同组织和生长阶段的混合转录组数据,开发的SSR标记引物,序列如SEQ ID NO.1-40所示,开发的引物应具有扩增结果稳定、电泳条带清晰可辨、多态性位点高的优点,可以用于甘蔗遗传多样性分析、品种鉴定和保护、DNA指纹图谱及遗传连锁图谱的构建。

    甘蔗赤条病菌巢式PCR检测方法

    公开(公告)号:CN102864244A

    公开(公告)日:2013-01-09

    申请号:CN201210392025.1

    申请日:2012-10-16

    Abstract: 本发明涉及一种甘蔗赤条病菌(Acidovoraxavenaesubsp.avenae)的巢式PCR检测方法,以感病的甘蔗叶片DNA为模板,根据甘蔗赤条病菌的16SrRNA核苷酸序列设计的特异性引物SRSD-16S-F1和SRSD-R2、SRSDF1和SRSDR1,采用巢式PCR扩增方法,检测甘蔗赤条病菌。本发明的甘蔗赤条病菌巢式PCR检测方法,克服了生物学鉴定、电镜技术、酶联免疫技术、常规PCR等方法的缺点,提供了一种快速、特异、灵敏的甘蔗赤条病菌的检测方法。

    转基因番木瓜55-1转化事件特异性PCR检测方法

    公开(公告)号:CN102311954A

    公开(公告)日:2012-01-11

    申请号:CN201110316550.0

    申请日:2011-10-18

    Abstract: 本发明提供了一种转基因番木瓜55-1转化事件特异性PCR检测方法,首先涉及一种转基因番木瓜55-1转化事件外源插入载体旁侧DNA片段,其碱基序列如SEQ.NO.1所示,由来源于番木瓜基因组序列的第1至1432碱基和来源于外源载体序列的第1433至3780个碱基共同组成。根据SEQNO.1所示的序列设计特异性引物,对待测样品DNA进行扩增,若扩增获得目的片段,则待测样品含有转基因番木瓜55-1转化事件来源的成分。本发明能够利用普通的PCR仪器、试剂快速准确鉴别出转基因番木瓜55-1,适用于对转基因番木瓜55-1(包括杂种F1代和后代)及其衍生产品进行检测、监测和标识制度管理。

    植物单花粉高通量收集与PCR检测方法

    公开(公告)号:CN100572560C

    公开(公告)日:2009-12-23

    申请号:CN200710008694.3

    申请日:2007-03-14

    Abstract: 本发明公开一种植物单花粉高通量收集与PCR检测方法,包括步骤为:显微镜分离花粉以及花粉破囊壁和染色;分装碱性裂解液于PCR板中,密封并离心使裂解液沉于管底;显微镜下用特殊镊子挑选着色单花粉粒并放入PCR管裂解液中;分装矿物油于PCR板中,短暂离心;置于PCR仪上90-98℃温度下裂解;在各管中加入TE缓冲液中和,离心,加入PCR反应成分;短暂离心,置于PCR仪上,反应参数为:90-98℃保持3-8分钟,热循环依不同反应而定,循环数为35-40,最后72℃延伸5-10分钟,保持于4℃下;PCR产物用电泳分离并在成像系统上进行扫描拍照。本发明具有效率高等优点,特别适用于生殖遗传统计分析。

    一种适合甘蔗外源基因拷贝数鉴定的内源基因筛选与应用

    公开(公告)号:CN106520947B

    公开(公告)日:2019-08-13

    申请号:CN201610989807.1

    申请日:2016-11-10

    Abstract: 本发明提供一种适合甘蔗外源基因拷贝数鉴定的内源基因筛选与应用,采用的引物和探针的核苷酸序列分别为SEQ ID No.1、SEQ ID No.2和SEQ ID No.3,所述内源基因PCR扩增长度为95 bp。鉴于目前甘蔗外源基因拷贝数鉴定方法复杂、工作量大、效率低下、准确性低等问题,提供一种适合甘蔗外源基因拷贝数鉴定的内源基因筛选与应用,所建立的内源基因和外源基因标准曲线的构建方法,操作简单、灵敏度高、特异性强、准确度高及可重复性高,为转基因甘蔗外源基因拷贝数鉴定提供科学、准确、实用的检测方法。

    用于PCR检测植物病害的内参基因的引物及其应用

    公开(公告)号:CN102367485B

    公开(公告)日:2013-04-17

    申请号:CN201110388017.5

    申请日:2011-11-30

    Abstract: 本发明提供了一种用于PCR检测植物病害的内参基因的引物及其应用,属于生物工程技术领域。所述内参基因为rbcL基因,所述引物为:正向:5’TATCTTGGCAGCATTCCGAGTA3’,反向:5’ACCCTCTTCAAATAGGTCTAATGG3’,所述引物特异性的扩增rbcL基因的228bp的DNA片段,用于出入境植物寄生病害检测过程中PCR模板的评价。本发明首次提出在植物病害定性PCR检测中建立通用的内参基因;首次提出将植物叶绿体的rbcL基因作为内参基因应用于植物病害定性PCR检测;本发明提出的检测引物,克服了针对一种植物一个内参基因的缺陷,大大的提高了检测效率、缩短了检测时间。

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