甘蔗割手密种非生物胁迫条件下的荧光定量内参基因的筛选和应用

    公开(公告)号:CN115820915B

    公开(公告)日:2024-10-22

    申请号:CN202211521597.5

    申请日:2022-11-30

    Abstract: 本发明公开了甘蔗割手密种非生物胁迫条件下的荧光定量内参基因的筛选和应用。本发明所述内参基因序列来自割手密种全基因组水平上的多个不同转录组数据,与以往的其他物种的内参基因相比,本发明筛选出的内参基因具有组成型表达、表达量适中、稳定性好等优点,其中泛素蛋白基因UBC在非生物胁迫下比通用内参基因eEf‑1ɑ,GAPDH和Actin具有更好的稳定性,为割手密种基因在非生物胁迫下的表达分析、筛选、验证工作提供了有效的、准确的、均一性的内参基因。新开发的内参基因不仅丰富了植物内参基因的种类和数量,而且也对甘蔗属及其近缘属(蔗茅属和芒属)植物基因表达量校正提供了重要的候选基因资源。

    一种鉴定甘蔗抗褐锈病基因位点紧密连锁的分子标记方法

    公开(公告)号:CN105713989B

    公开(公告)日:2019-03-22

    申请号:CN201610271692.2

    申请日:2016-04-28

    Abstract: 本发明提供了一种鉴定甘蔗抗褐锈病基因位点紧密连锁的分子标记方法,分别以待鉴定甘蔗和“POJ2878”的基因组DNA为模板,利用引物1和引物2进行扩增,将扩增的PCR产物利用限制性核酸内切酶HaeIII进行酶切,通过琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物,与抗褐锈病甘蔗品种POJ2878的酶切产物进行比较,来判断所待鉴定甘蔗的抗病性。本发明方法可用于甘蔗抗褐锈病基因的图位克隆和分子标记辅助选择,通过检测抗褐锈病基因位点来预测待鉴定甘蔗对褐锈病的抗性,不仅节约生产成本而且大大提高选择效率,进而加速甘蔗抗褐锈病育种进程。

    快速鉴定甘蔗抗褐锈病基因位点的分子标记引物及应用

    公开(公告)号:CN105713988B

    公开(公告)日:2019-03-22

    申请号:CN201610271677.8

    申请日:2016-04-28

    Abstract: 本发明提供了一种快速鉴定甘蔗抗褐锈病基因位点的分子标记引物及应用,分别以待鉴定甘蔗和“POJ2878”的基因组DNA为模板,利用引物1、引物2、引物3、引物4进行扩增,将扩增的PCR产物利用限制性核酸内切酶HaeIII进行酶切,通过琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物,与抗褐锈病甘蔗品种POJ2878的酶切产物(分别为389bp和606bp)进行比较,来判断所待鉴定甘蔗的抗病性。本发明方法可用于甘蔗抗褐锈病基因的图位克隆和分子标记辅助选择,通过检测抗褐锈病基因位点来预测待鉴定甘蔗对褐锈病的抗性,不仅节约生产成本而且大大提高选择效率,进而加速甘蔗抗褐锈病育种进程。

    快速鉴定甘蔗抗褐锈病基因位点的分子标记引物及应用

    公开(公告)号:CN105713988A

    公开(公告)日:2016-06-29

    申请号:CN201610271677.8

    申请日:2016-04-28

    CPC classification number: C12Q1/6895 C12Q2600/13

    Abstract: 本发明提供了一种快速鉴定甘蔗抗褐锈病基因位点的分子标记引物及应用,分别以待鉴定甘蔗和“POJ2878”的基因组DNA为模板,利用引物1、引物2、引物3、引物4进行扩增,将扩增的PCR产物利用限制性核酸内切酶HaeIII进行酶切,通过琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物,与抗褐锈病甘蔗品种POJ2878的酶切产物(分别为389bp和606bp)进行比较,来判断所待鉴定甘蔗的抗病性。本发明方法可用于甘蔗抗褐锈病基因的图位克隆和分子标记辅助选择,通过检测抗褐锈病基因位点来预测待鉴定甘蔗对褐锈病的抗性,不仅节约生产成本而且大大提高选择效率,进而加速甘蔗抗褐锈病育种进程。

    一种检测甘蔗中寄生白条病菌的实时荧光定量PCR方法

    公开(公告)号:CN102312015B

    公开(公告)日:2013-01-09

    申请号:CN201110316556.8

    申请日:2011-10-18

    Abstract: 本发明涉及一种检测甘蔗中寄生白条病菌拷贝数的实时荧光定量PCR方法。首先提供了一种利用实时荧光定量PCR方法检测甘蔗中寄生白条病菌的引物及探针,所述的引物为以下序列的引物对:正向引物序列5’-GGTTCCATTGCTTACCGATT-3’,反向引物序列5’-CAAGTTTCGACAGGAACAGC-3’,探针序列是FAM-5-CCACGGCTACGTCAATTCGGG-3-TAMRA,然后采集和处理甘蔗蔗汁并提取总DNA,利用实时荧光定量PCR方法检测甘蔗中感染的白条病菌HrpB基因,通过扩增过程生成的Ct值,代入标准曲线方程,转换成起始反应的DNA分子拷贝数,从而达到定量检测甘蔗中感染白条病菌数量的目的。

    一种大批量快速制备PCR模板的方法

    公开(公告)号:CN101294221B

    公开(公告)日:2011-05-04

    申请号:CN200810071267.4

    申请日:2008-06-23

    Abstract: 一种大批量快速制备PCR模板的方法,属植物分子检测技术领域,具体涉及植物组织在裂解液中加热裂解和裂解液中和。本发明的技术方案是:将微量植物叶片放入一定体积的裂解液中加热裂解,然后中和,反应混合液可直接作为PCR反应的模板,在添加适量聚合酶稳定剂的情况下,PCR反应稳定,重复性强。该方法特别适宜大批量PCR反应模板的快速制备,可以大幅度提高分子检测和遗传分析的效率,极显著地降低成本。

    甘蔗割手密种不同组织荧光定量内参基因的筛选和应用

    公开(公告)号:CN116064919B

    公开(公告)日:2024-10-22

    申请号:CN202211521380.4

    申请日:2022-11-30

    Abstract: 本发明公开了甘蔗割手密种不同组织荧光定量内参基因的筛选和应用。本发明所述的内参基因来源于割手密种全基因组水平上的不同组织的转录组数据库,与以往的其他物种的内参基因相比,本发明所开发的内参基因WDR比通用内参基因(eEf‑1ɑ,GAPDH和Actin)具有组成型表达、表达量适中、稳定性好等优点。因此本发明为割手密种基因不同组织的表达分析、筛选、验证工作提供了有效的、准确的、均一性的内参基因。此外,新开发的内参基因不仅丰富了植物内参基因的种类和数量,而且也对甘蔗属及其近缘属(蔗茅属和芒属)植物基因表达量校正提供了重要的候选基因资源。

    一种诱导甘蔗茎绵心发育的启动子及其应用

    公开(公告)号:CN116769776A

    公开(公告)日:2023-09-19

    申请号:CN202310567324.2

    申请日:2023-05-19

    Abstract: 本发明涉及一种诱导甘蔗茎绵心发育的启动子ProSsNAC1‑1及其应用。所述启动子ProSsNAC1‑1是从蔗茎绵心的甘蔗割手密种中克隆得到,核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。分别将ProSsNAC1‑1和蔗茎实心的甘蔗热带种来源的启动子ProSoNAC1‑1与GUS基因构建融合表达载体,转化拟南芥,将T3代纯合转基因拟南芥植株分别在不同组织及低温和干旱胁迫下进行表达模式分析和组织化学染色。结果证实,启动子ProSsNAC1‑1比ProSoNAC1‑1具有较强的表达量;启动子ProSsNAC1‑1能驱动NAC1‑1基因在甘蔗叶脉和茎秆的维管束组织高效表达,且其受低温和干旱诱导。本发明的启动子ProSsNAC1‑1对甘蔗茎绵心发育调控、甘蔗品质改良具重要价值。

    一种区分甘蔗种间三号染色体遗传背景的SSR标记与应用

    公开(公告)号:CN111663001B

    公开(公告)日:2022-10-14

    申请号:CN202010672152.1

    申请日:2020-07-14

    Abstract: 本发明公开了一种区分甘蔗高贵种和割手密种三号染色体遗传背景的微卫星分子标记与应用,包括四对位于甘蔗高贵种三号染色体的SSR分子标记核心引物对,研究基于甘蔗高贵种和割手密种全基因组数据,设计、合成SSR标记引物,并对5份高贵种材料、4份割手密种材料、2份栽培种材料品种资源进行分析。筛选出的4对引物可以分清SSR所在甘蔗高贵种和割手密种的染色体位置,准确、高效地鉴定甘蔗品种,可用于甘蔗遗传分析和品种鉴定。

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