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公开(公告)号:CN116287266A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310225516.5
申请日:2023-03-07
申请人: 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声诊断医疗器械有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司
IPC分类号: C12Q1/6886 , G16B20/20 , G16B20/50 , G16B20/30 , G16B45/00
摘要: 本申请涉及分子诊断技术领域,具体提供一种DNA复制晚期区域在泛癌种诊断中的应用。
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公开(公告)号:CN118957076A
公开(公告)日:2024-11-15
申请号:CN202411299485.9
申请日:2024-03-01
申请人: 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声诊断医疗器械有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司
IPC分类号: C12Q1/6886 , G16B20/20 , G16B20/50 , G16B20/30 , G16B45/00
摘要: 本申请涉及分子诊断技术领域,具体提供一种DNA复制晚期区域在泛癌种诊断中的应用。本申请通过多种组学数据发现DNA复制晚期区域在肿瘤中呈现DNA低甲基化,高突变频率,且在肿瘤cfDNA中呈现更高的片段短长比和独特的末端模体特征。这个现象存在于多个癌种中,属于泛癌种标志物,基于此建立泛癌种的诊断方法和应用。
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公开(公告)号:CN118006784A
公开(公告)日:2024-05-10
申请号:CN202410236627.0
申请日:2024-03-01
申请人: 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声诊断医疗器械有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司
IPC分类号: C12Q1/6886 , G16B20/20 , G16B20/50 , G16B20/30 , G16B45/00
摘要: 本申请涉及分子诊断技术领域,具体提供一种DNA复制晚期区域在泛癌种诊断中的应用。本申请通过多种组学数据发现DNA复制晚期区域在肿瘤中呈现DNA低甲基化,高突变频率,且在肿瘤cfDNA中呈现更高的片段短长比和独特的末端模体特征。这个现象存在于多个癌种中,属于泛癌种标志物,基于此建立泛癌种的诊断方法和应用。
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公开(公告)号:CN115424666A
公开(公告)日:2022-12-02
申请号:CN202211109652.X
申请日:2022-09-13
申请人: 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司
摘要: 本申请涉及生物信息学技术领域,具体提供一种基于全基因组重亚硫酸盐测序数据筛选泛癌早筛分子标志物的方法及系统。本方法基于全基因组重亚硫酸盐测序数据,根据癌旁样本的甲基化水平以及肿瘤样本的肿瘤占比,对肿瘤样本的甲基化水平进行校正,筛选出具有真实差异的甲基化区间。通过自编码模型对初筛分子标志物进行贡献度排序,从分子水平上评估其在肿瘤样本与癌旁样本及白细胞中的差异精简初筛分子标志物,提升开发产品的准确率和经济性。
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公开(公告)号:CN115083516B
公开(公告)日:2023-03-21
申请号:CN202210818316.6
申请日:2022-07-13
申请人: 北京先声医学检验实验室有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司 , 江苏先声医学诊断有限公司
摘要: 本申请属于生信分析技术领域,具体涉及一种基于靶向RNA测序技术检测基因融合的Panel设计和评估方法,该方法具有全面、精简、覆盖准确等优势。
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公开(公告)号:CN115424666B
公开(公告)日:2023-07-11
申请号:CN202211109652.X
申请日:2022-09-13
申请人: 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司
摘要: 本申请涉及生物信息学技术领域,具体提供一种基于全基因组重亚硫酸盐测序数据筛选泛癌早筛分子标志物的方法及系统。本方法基于全基因组重亚硫酸盐测序数据,根据癌旁样本的甲基化水平以及肿瘤样本的肿瘤占比,对肿瘤样本的甲基化水平进行校正,筛选出具有真实差异的甲基化区间。通过自编码模型对初筛分子标志物进行贡献度排序,从分子水平上评估其在肿瘤样本与癌旁样本及白细胞中的差异精简初筛分子标志物,提升开发产品的准确率和经济性。
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公开(公告)号:CN115083516A
公开(公告)日:2022-09-20
申请号:CN202210818316.6
申请日:2022-07-13
申请人: 北京先声医学检验实验室有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司 , 江苏先声医学诊断有限公司
摘要: 本申请属于生信分析技术领域,具体涉及一种基于靶向RNA测序技术检测基因融合的Panel设计和评估方法,该方法具有全面、精简、覆盖准确等优势。
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公开(公告)号:CN112362877A
公开(公告)日:2021-02-12
申请号:CN202011167856.X
申请日:2020-10-27
申请人: 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声医疗器械有限公司 , 江苏先声诊断技术有限公司
摘要: 本发明提供一种MBP重组蛋白以及其应用,通过抗原结构优化和细胞亚定位改造,提高了MBP重组蛋白在CBA试剂盒产品的稳定性,以及对MBP抗体检测的灵敏度和检测速率,特异性达到100%。
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公开(公告)号:CN115572759A
公开(公告)日:2023-01-06
申请号:CN202210958891.6
申请日:2022-08-10
申请人: 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声医疗器械有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司
IPC分类号: C12Q1/6883 , C12Q1/6806 , C12N15/11
摘要: 本申请涉及分子诊断技术领域,具体提供一种高效检测HLA‑DRB1基因分型的方法,通过分析HLA‑DRB1基因区域保守序列,设计覆盖HLA‑DRB1 2‑4号外显子的全部序列扩增引物,通过转座酶法一步完成模板打断和接头连接,进而构建二代测序文库,用于测序检测。
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公开(公告)号:CN115354067A
公开(公告)日:2022-11-18
申请号:CN202210041455.2
申请日:2022-01-14
申请人: 郑州大学第一附属医院 , 江苏先声医学诊断有限公司
IPC分类号: C12Q1/6806 , C40B50/06 , C12Q1/34
摘要: 本发明提供一种游离DNA甲基化建库的方法,有效的解决了甲基化双链建库在使用中成本较高、检测灵敏度低、冗余度高的问题;包括步骤:S1:提供样本DNA,使用TET酶对样本DNA中的5mC和5fmC进行氧化,分别转化为5caC/5gC,完成氧化并加入终止反应液,然后进行磁珠纯化;S2:将纯化产物变性为单链DNA,使用APOBEC酶,将未修饰的胞嘧啶转化形成尿嘧啶,然后进行磁珠纯化,得到完成C到U转化的单链DNA模板;S3:对纯化产物进行修复,使用单链连接酶进行第一接头连接,得到3’端连接有接头的产物单链DNA分子;一种游离DNA甲基化建库的方法,由于酶法甲基化转化条件温和,可最大程度的减少DNA在转化过程中的损失,提高了文库建库效率。
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