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公开(公告)号：CN111349719B
公开(公告)日：2020-10-20
申请号：CN202010160002.2
申请日：2020-03-09
Applicant: 广州医科大学附属第一医院(广州呼吸中心) , 广州呼吸健康研究院 , 北京源生康泰基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开一种用于新型冠状病毒检测的特异引物及应用，包括步骤：对采集样本进行灭活，并提取病毒RNA；将经所述步骤S1提取质检合格的病毒RNA反转进行cDNA合成；使用特异引物进行片段扩增形成PCR反应产物样品；对所述PCR反应产物样品进行标识，并构建测序文库；所述测序文库进行纳米孔测序操作；本发明测序质量良好，通过本发明得到的样本比对到新冠基因组时，可实现最高达94.16％的reads比对率，从而可以辅助判定患者的感染情况，可实现新型冠状病毒的快速精准检测。
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公开(公告)号：CN111349719A
公开(公告)日：2020-06-30
申请号：CN202010160002.2
申请日：2020-03-09
Applicant: 广州医科大学附属第一医院(广州呼吸中心) , 广州呼吸健康研究院 , 北京源生康泰基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开一种用于新型冠状病毒检测的特异引物及快速检测方法，包括步骤：对采集样本进行灭活，并提取病毒RNA；将经所述步骤S1提取质检合格的病毒RNA反转进行cDNA合成；使用特异引物进行片段扩增形成PCR反应产物样品；对所述PCR反应产物样品进行标识，并构建测序文库；所述测序文库进行纳米孔测序操作；本发明测序质量良好，通过本发明得到的样本比对到新冠基因组时，可实现最高达94.16％的reads比对率，从而可以辅助判定患者的感染情况，可实现新型冠状病毒的快速精准检测。
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公开(公告)号：CN116705160A
公开(公告)日：2023-09-05
申请号：CN202310718964.9
申请日：2023-06-16
Applicant: 北京源生康泰基因科技有限公司
Abstract: 本发明涉及基因组测序技术领域，具体涉及一种基于纳米孔测序数据的病原宏基因组分析方法，首先在第一轮比对中，通过并行Kraken2、Centrifuge、Pandora和Minimap2四种快速比对软件和算法实现了针对典型数据(1Gb纳米孔测序数据)的物种初步判别；在第二轮和第三轮验证分析中，使用精确比对算法BLAST分别将上一轮判别的各个物种的读段与该物种参考序列及本样本识别到的其他病原参考序列进行交叉比对验证，有效减少了精确比对的计算量。通过Minimap2与耐药基因/点突变数据库进行比对，并通过blast精确比对算法进行耐药基因/点突变的识别。通过构建该方法和系统，实现了典型纳米孔测序病原宏基因组数据在30min内的准确分析和报告生成，并有效兼容二代测序数据分析。
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公开(公告)号：CN117821664A
公开(公告)日：2024-04-05
申请号：CN202410002923.4
申请日：2024-01-02
Applicant: 北京源生康泰基因科技有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明涉及生物检测技术领域，具体涉及一种用于人腺病毒检测的特异引物及快速检测方法，包括步骤：对采集样本进行灭活，并提取DNA；将经所述步骤S1提取质检合格的DNA；使用特异引物进行片段扩增形成PCR反应产物样品；对所述PCR反应产物样品进行标识，并构建测序文库；所述测序文库进行纳米孔测序；本发明测序质量良好，通过本发明得到的样本比对到人腺病毒参考序列时，扩增产物片段长，特异性强，利用该引物组进行扩增并进行纳米孔测序检测，可实现较高的reads比对率，灵敏度强。从而可以辅助判定患者的感染情况，实现人腺病毒的快速精准检测。
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