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公开(公告)号:CN111349719B
公开(公告)日:2020-10-20
申请号:CN202010160002.2
申请日:2020-03-09
Applicant: 广州医科大学附属第一医院(广州呼吸中心) , 广州呼吸健康研究院 , 北京源生康泰基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开一种用于新型冠状病毒检测的特异引物及应用,包括步骤:对采集样本进行灭活,并提取病毒RNA;将经所述步骤S1提取质检合格的病毒RNA反转进行cDNA合成;使用特异引物进行片段扩增形成PCR反应产物样品;对所述PCR反应产物样品进行标识,并构建测序文库;所述测序文库进行纳米孔测序操作;本发明测序质量良好,通过本发明得到的样本比对到新冠基因组时,可实现最高达94.16%的reads比对率,从而可以辅助判定患者的感染情况,可实现新型冠状病毒的快速精准检测。
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公开(公告)号:CN111349719A
公开(公告)日:2020-06-30
申请号:CN202010160002.2
申请日:2020-03-09
Applicant: 广州医科大学附属第一医院(广州呼吸中心) , 广州呼吸健康研究院 , 北京源生康泰基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开一种用于新型冠状病毒检测的特异引物及快速检测方法,包括步骤:对采集样本进行灭活,并提取病毒RNA;将经所述步骤S1提取质检合格的病毒RNA反转进行cDNA合成;使用特异引物进行片段扩增形成PCR反应产物样品;对所述PCR反应产物样品进行标识,并构建测序文库;所述测序文库进行纳米孔测序操作;本发明测序质量良好,通过本发明得到的样本比对到新冠基因组时,可实现最高达94.16%的reads比对率,从而可以辅助判定患者的感染情况,可实现新型冠状病毒的快速精准检测。
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公开(公告)号:CN117701678A
公开(公告)日:2024-03-15
申请号:CN202311702148.5
申请日:2023-12-12
Applicant: 北京源生康泰基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6806
Abstract: 本发明涉及微生物基因检测技术领域,具体涉及一种用于高效去除感染样本宿主核酸的方法,特别适用于肺泡灌洗液、痰液、脑脊液等感染样本的病原体宏基因组检测和宏转录组检测。通过RIPA裂解液将宿主和微生物差异裂解,并使用全能核酸酶去除宿主核酸,大大降低宿主基因组占比,包括步骤:对采集样本进行富集;裂解宿主细胞;消化宿主核酸;富集微生物细胞;裂解微生物,回收微生物核酸。本发明可同时消化宿主DNA和RNA,使其同时适用于宏基因组测序和宏转录组测序。该方法可在60min内完成宿主核酸的去除及回收微生物核酸全过程,可去除感染样本中2%‑95%的宿主核酸,大幅提高感染样本中病原微生物核酸比例,具有高效、简易、低成本和快速去宿主核酸的特点。
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