-
公开(公告)号:CN105354440B
公开(公告)日:2019-06-21
申请号:CN201510493825.6
申请日:2015-08-12
Applicant: 中国科学技术大学
IPC: G16B20/00
Abstract: 本发明涉及一种提取蛋白质‑小分子相互作用模块的方法,具体是将蛋白质上构成小分子结合口袋的原子(或氨基酸)根据其性质进行定量化描述,然后对两两口袋原子(或氨基酸)之间的距离进行评估,建立距离矩阵,再利用聚类算法抽提出性质相似的口袋原子(或氨基酸)类别,最后通过后处理,获得蛋白质‑小分子相互作用模块。可应用于生物信息学研究、蛋白质设计、药物筛选、小分子化学合成等多个方面。
-
公开(公告)号:CN1418949A
公开(公告)日:2003-05-21
申请号:CN02143031.4
申请日:2002-09-13
Applicant: 中国科学技术大学
Abstract: 本发明是一种表达M1033GI的突变酶GIG138P的基因工程菌株M1033WZ及其构建方案,涉及表达葡萄糖异构酶的基因工程菌株以及构建方法。它是以基因敲除和基因置换的同源重组方法,对7号淀粉酶链霉菌M1033的染色体中表达GI的基因框架进行三轮染色体框架改造从而实现染色体分子突变,即结构基因138位点引入GIG138P突变位点构建成基因工程菌株。通过基因水平、蛋白水平和菌株传代实验验证,以此方法构建的M1033WZ酶活表达量极其稳定,由其表达的突变体酶GIG138P的热稳定性与野生型酶的热稳定性相比有极大提高,已具重组葡萄糖异构酶固相化反应柱的成熟工业生产条件。
-
公开(公告)号:CN1055727C
公开(公告)日:2000-08-23
申请号:CN95112782.9
申请日:1995-11-27
Applicant: 中国科学技术大学
Abstract: 本发明利用蛋白质工程的定点突变方法改良葡萄糖异构酶,提供了一种获得热稳定性提高的GI有意义突变体的突变方案,其特征在于将GI的138位Gly或某些GI中在同源性比较上相当SM33 GI Gly138的Gly替换成Pro,采用本方法获得的SM33 GI的突变体酶GIG138P,其热失活半衰期比野生型GI提高了0.9-1.1倍,最适反应温度提高了10-12℃,比活与野生型酶相当,它是热稳定性和最适反应温度同时获得改善的有意义突变体。
-
公开(公告)号:CN1213003A
公开(公告)日:1999-04-07
申请号:CN97119714.8
申请日:1997-09-30
Applicant: 中国科学技术大学
Abstract: 本发明提供一种蛋白质工程的定点突变方案及其SM33 GI的突变体酶和双突变体酶,其特征在于将SM33 GI的247位或在同源性比较相当于247位的Gly替换为Asp,获得的突变体酶SM33 GI G247D,其酶活较野生型粗酶GI有明显的提高;再将带有Asp247的SM 33 GI基因片段替代SM33 GI GI38P基因的相应片段,可获得双突变体酶SM33GI(GI38P,G247D),其酶活和热稳定性同时获得提高。
-
公开(公告)号:CN105354440A
公开(公告)日:2016-02-24
申请号:CN201510493825.6
申请日:2015-08-12
Applicant: 中国科学技术大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 本发明涉及一种提取蛋白质-小分子相互作用模块的方法,具体是将蛋白质上构成小分子结合口袋的原子(或氨基酸)根据其性质进行定量化描述,然后对两两口袋原子(或氨基酸)之间的距离进行评估,建立距离矩阵,再利用聚类算法抽提出性质相似的口袋原子(或氨基酸)类别,最后通过后处理,获得蛋白质-小分子相互作用模块。可应用于生物信息学研究、蛋白质设计、药物筛选、小分子化学合成等多个方面。
-
公开(公告)号:CN101418047A
公开(公告)日:2009-04-29
申请号:CN200810227452.8
申请日:2008-11-25
Applicant: 中国科学技术大学
IPC: C07K19/00 , C07K14/435 , C07K7/06
Abstract: 本发明公开了一种抗原-抗体复合物晶体及其制备方法与抗原表位。本发明的抗原和chA21抗体复合物晶体,由肿瘤表面抗原p185/HER2胞外区部分片段EP I和抗体chA21经木瓜蛋白酶酶切后得到的单链抗体scFv组成;所述EP I的氨基酸残基序列如序列表中序列1所示。chA21识别的表位可能是一个新的抗p185/HER2抗体药物的靶点,chA21可能在肿瘤治疗方面发挥独特的作用。本发明是又一个新的抗ErbB2抗体chA21的抗肿瘤作用的表位的晶体结构及表位研究结果。
-
公开(公告)号:CN1088108C
公开(公告)日:2002-07-24
申请号:CN97119714.8
申请日:1997-09-30
Applicant: 中国科学技术大学
Abstract: 本发明提供一种蛋白质工程的定点突变方案及其SM33 GI的突变体酶和双突变体酶,其特征在于将SM33 GI的247位或在同源性比较相当于247位的Gly替换为Asp,获得的突变体酶SM33 GI G247D,其酶活较野生型粗酶GI有明显的提高;再将带有Asp247的SM33 GI基因片段替代SM33 GI G138P基因的相应片段,可获得双突变体酶SM33 GI(G138P,G247D),其酶活和热稳定性同时获得提高。
-
公开(公告)号:CN101418047B
公开(公告)日:2011-04-20
申请号:CN200810227452.8
申请日:2008-11-25
Applicant: 中国科学技术大学
IPC: C07K19/00 , C07K14/435 , C07K7/06
Abstract: 本发明公开了一种抗原-抗体复合物晶体及其制备方法与抗原表位。本发明的抗原和chA21抗体复合物晶体,由肿瘤表面抗原p185/HER2胞外区部分片段EPI和抗体chA21经木瓜蛋白酶酶切后得到的单链抗体scFv组成;所述EPI的氨基酸残基序列如序列表中序列1所示。chA21识别的表位可能是一个新的抗p185/HER2抗体药物的靶点,chA21可能在肿瘤治疗方面发挥独特的作用。本发明是又一个新的抗ErbB2抗体chA21的抗肿瘤作用的表位的晶体结构及表位研究结果。
-
公开(公告)号:CN1156182A
公开(公告)日:1997-08-06
申请号:CN95112782.9
申请日:1995-11-27
Applicant: 中国科学技术大学
Abstract: 本发明利用蛋白质工程的定点突变方法改良葡萄糖异构酶,提供了一种获得热稳定性提高的GI有意义突变体的突变方案,其特征在于将GI的138位Gly或某些GI中在同源性比较上相当于SM33 GI Gly138的Gly替换成Pro,采用本方法获得的SM33 GI的突变体酶GIG138P,其热失活半衰期比野生型GI提高了0.9-1.1倍,最适反应温度提高了10-12℃,比活与野生型酶相当,它是热稳定性和最适反应温度同时获得改善的有意义突变体。
-
-
-
-
-
-
-
-