一种提取蛋白质-小分子相互作用模块的方法

    公开(公告)号:CN105354440B

    公开(公告)日:2019-06-21

    申请号:CN201510493825.6

    申请日:2015-08-12

    Abstract: 本发明涉及一种提取蛋白质‑小分子相互作用模块的方法,具体是将蛋白质上构成小分子结合口袋的原子(或氨基酸)根据其性质进行定量化描述,然后对两两口袋原子(或氨基酸)之间的距离进行评估,建立距离矩阵,再利用聚类算法抽提出性质相似的口袋原子(或氨基酸)类别,最后通过后处理,获得蛋白质‑小分子相互作用模块。可应用于生物信息学研究、蛋白质设计、药物筛选、小分子化学合成等多个方面。

    一种提取蛋白质-小分子相互作用模块的方法

    公开(公告)号:CN105354440A

    公开(公告)日:2016-02-24

    申请号:CN201510493825.6

    申请日:2015-08-12

    Abstract: 本发明涉及一种提取蛋白质-小分子相互作用模块的方法,具体是将蛋白质上构成小分子结合口袋的原子(或氨基酸)根据其性质进行定量化描述,然后对两两口袋原子(或氨基酸)之间的距离进行评估,建立距离矩阵,再利用聚类算法抽提出性质相似的口袋原子(或氨基酸)类别,最后通过后处理,获得蛋白质-小分子相互作用模块。可应用于生物信息学研究、蛋白质设计、药物筛选、小分子化学合成等多个方面。

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