公开(公告)号：CN105354440A

公开(公告)日：2016-02-24

申请号：CN201510493825.6

申请日：2015-08-12

Applicant: 中国科学技术大学

Inventor： 梁治 ,  牛立文 ,  滕脉坤 ,  何巍

IPC: G06F19/18

Abstract: 本发明涉及一种提取蛋白质-小分子相互作用模块的方法，具体是将蛋白质上构成小分子结合口袋的原子(或氨基酸)根据其性质进行定量化描述，然后对两两口袋原子(或氨基酸)之间的距离进行评估，建立距离矩阵，再利用聚类算法抽提出性质相似的口袋原子(或氨基酸)类别，最后通过后处理，获得蛋白质-小分子相互作用模块。可应用于生物信息学研究、蛋白质设计、药物筛选、小分子化学合成等多个方面。

公开(公告)号：CN105354440B

公开(公告)日：2019-06-21

申请号：CN201510493825.6

申请日：2015-08-12

Applicant: 中国科学技术大学

Inventor： 梁治 ,  牛立文 ,  滕脉坤 ,  何巍

IPC: G16B20/00

Abstract: 本发明涉及一种提取蛋白质‑小分子相互作用模块的方法，具体是将蛋白质上构成小分子结合口袋的原子(或氨基酸)根据其性质进行定量化描述，然后对两两口袋原子(或氨基酸)之间的距离进行评估，建立距离矩阵，再利用聚类算法抽提出性质相似的口袋原子(或氨基酸)类别，最后通过后处理，获得蛋白质‑小分子相互作用模块。可应用于生物信息学研究、蛋白质设计、药物筛选、小分子化学合成等多个方面。