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公开(公告)号:CN111858510B
公开(公告)日:2021-08-20
申请号:CN202010688281.X
申请日:2020-07-16
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: G06F16/172 , G06F16/174 , H03M7/06 , G16B50/00
Abstract: 本发明公开DNA活字存储系统和方法。DNA活字存储方法包括提供内容活字实物库和索引活字实物库;将目标文件中的待储存数据拆分为多个数据元素,并针对各数据元素标注索引信息,将数据元素的内容信息对应至内容活字实物库中的特定内容活字寡核苷酸片段,将索引信息对应至索引活字实物库中的特定索引活字寡核苷酸片段;然后,将内容活字寡核苷酸片段和索引活字寡核苷酸片段连接构成DNA活字单元,由多个DNA活字单元构成保存有全部待储存数据元素的DNA存储文件。本发明的DNA活字实物库可一次合成,多次重复使用,自由组合,极大降低DNA合成成本,且可以避免多次设计及合成DNA片段的人工与时间投入,并避免引入大量纠错序列所带来的成本负担。
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公开(公告)号:CN112735530A
公开(公告)日:2021-04-30
申请号:CN202110090838.4
申请日:2021-01-22
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: G16B30/10 , G16B25/10 , G06F16/36 , G06F16/906
Abstract: 本发明提供了一种基于菌群结构进行样品溯源的方法,属于微生物分析技术领域。本发明通过16S序列扩增、宏基因组以及大数据获取大量样本的菌群结构,通过判断待测样品的香农指数以及菌群结构的相似性,从而确定某一确定来源的菌群图谱,并依据菌群图谱进行样品来源的溯源。本发明所述的样品溯源的方法高效、准确、快速,且操作简便。
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公开(公告)号:CN120089209A
公开(公告)日:2025-06-03
申请号:CN202510585864.2
申请日:2025-05-08
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: G16B40/00 , G06F18/214 , G06F18/243 , G06N20/20
Abstract: 本发明提供了一种鉴定肿瘤诱导产生的有核红细胞的方法和装置,涉及生物信息学技术领域。本发明提供的鉴定肿瘤诱导产生的有核红细胞的方法,利用高通量转录组数据结合机器学习技术,能够高效地识别肿瘤诱导产生的患者外周血中数量稀少的有核红细胞,具有更高的敏感性与特异性,为肿瘤诱导产生的有核红细胞在生物学过程中的作用研究奠定基础。本发明提供的鉴定肿瘤诱导产生的有核红细胞的装置,能够高效识别肿瘤诱导产生的有核红细胞,敏感性和特异性高,能够用于肿瘤的辅助诊断与预后预测,为肿瘤的个性化治疗提供更为精准的辅助信息,具有较好的临床应用潜力。
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公开(公告)号:CN119979706A
公开(公告)日:2025-05-13
申请号:CN202411650539.1
申请日:2024-11-19
Applicant: 北京市神经外科研究所 , 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种垂体瘤亚型区分方法,获取垂体肿瘤亚型样本,提取样本组织的RNA并逆转录为cDNA;通过可变剪接基因引物的PCR扩增,结合琼脂糖凝胶电泳实验,得到基因在对应垂体肿瘤亚型中存在特异性剪接事件的标准荧幕条带;利用基因在待测垂体肿瘤样本上进行PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳实验,得到待测垂体肿瘤样本的实验荧幕条带;将实验荧幕条带与对应垂体肿瘤亚型所呈现的标准荧幕条带进行比对,对待测垂体肿瘤样本的亚型做出区分。本发明可在术中进行比较有效的亚型诊断,利用较小的组织达到亚型诊断效果,可以较快的利用术后的组织标本进行诊断鉴别,若部分抗体存在失灵或灵敏度差时,还可以补充病理诊断对于部分暂不能确定的垂体肿瘤亚型进行诊断。
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公开(公告)号:CN114563574B
公开(公告)日:2025-03-04
申请号:CN202011362907.4
申请日:2020-11-27
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: G01N33/68 , C12N5/078 , C12Q1/6888 , A61K35/19 , A61P7/00 , A61P37/02 , A61P35/00 , A61P35/02 , A61P7/06 , A61P19/02 , A61P29/00 , A61P25/00 , A61P19/08 , A61P21/00 , A61P19/06 , A61P17/06
Abstract: 本发明涉及小鼠巨核细胞(MK)中可能存在的三种不同功能异质性的巨核细胞亚群,且分别鉴定出了这些亚群的特异性分子标记物,包括作为HSC的微环境支持细胞的MK分子标记物为MYLK4;行使免疫调节功能的MK分子标记物为LSP1、CD53或CD52;具有产板功能的MK分子标记物为ARNTL。这些分子标记物可以用来分离或标记具有不同功能的MK,进而促进MK行使不同的功能,包括支持HSC静息、免疫调节、产板等。
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公开(公告)号:CN119322178A
公开(公告)日:2025-01-17
申请号:CN202310876740.0
申请日:2023-07-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) , 中国科学院动物研究所 , 衢州市人民医院
Abstract: 本发明涉及生物技术领域。具体的,本发明涉及衰老相关蛋白用于评估受试者的生物学年龄、受试者的衰老程度、衰老干预手段效果和/或受试者患衰老相关疾病的风险。此外,本发明还涉及衰老相关蛋白用于筛选延缓或逆转衰老、预防和/或治疗衰老相关疾病的药物。
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公开(公告)号:CN119320820A
公开(公告)日:2025-01-17
申请号:CN202310878662.8
申请日:2023-07-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) , 中国科学院动物研究所 , 衢州市人民医院
IPC: C12Q1/6883
Abstract: 本发明涉及衰老相关基因LRRN3、CACHD1、NT5E和SATB1及其应用,具体地,本发明基于人类外周单核细胞样本,通过转录组学技术分析增龄伴随的基因表达改变,挖掘到了增龄相关基因LRRN3、CACHD1、NT5E、SATB1并将其应用于基于亚洲人群,尤其是东亚或东南亚人群外周单核细胞样本的衰老衡量。
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公开(公告)号:CN118647729A
公开(公告)日:2024-09-13
申请号:CN202380014812.9
申请日:2023-09-18
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12Q1/6806
Abstract: 一种在来源于细胞的核酸分子中引入双重细胞特异性标签的方法,以及基于所述方法构建用于单细胞转录组测序、单细胞染色质可及性测序或单细胞转录组+染色质可及性多组学测序的核酸分子文库,或,对单细胞转录组、单细胞染色质可及性或单细胞转录组+染色质可及性多组学进行高通量测序的方法。还提供了利用所述方法构建的核酸分子文库,以及用于实施所述方法的试剂盒。
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公开(公告)号:CN117942401A
公开(公告)日:2024-04-30
申请号:CN202311422471.7
申请日:2023-10-30
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: A61K45/00 , A61P7/04 , C12N5/10 , C12N5/078 , A61K31/496 , A61K31/404 , A61K31/519 , A61K39/395 , A61K31/7088
Abstract: 本发明属于生物医药领域,涉及SETD2的医药用途或者SETD2的抑制剂的医药用途。具体地,本发明涉及选自如下的(1)-(4)项中的任一项在制备促进哺乳动物的巨核细胞生成或分化的药物、巨核祖细胞生成或分化的药物、治疗巨核细胞发育障碍的药物或者促进血小板生或前血小板成的药物中的用途:(1)SETD2蛋白;(2)SETD2基因;(3)抑制SETD2蛋白活性的药物;(4)降低SETD2基因表达水平的药物。本发明能够有效地促进体外巨核细胞的生成,从而显著提高体外制备血小板的效率,具有良好的应用前景。
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公开(公告)号:CN114015755B
公开(公告)日:2024-03-01
申请号:CN202111553752.7
申请日:2021-12-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C40B40/06
Abstract: 用于标记核酸分子的方法和试剂盒。本申请涉及一种处理细胞或细胞核以产生核酸片段群的方法,以及利用所述核酸片段群来生成经标记的核酸分子,构建用于转录组测序的核酸分子文库,或,对单细胞转录组进行高通量测序的方法。此外,本申请还涉及,利用所述方法构建的核酸分子文库,以及用于实施所述方法的试剂盒。
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