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公开(公告)号：CN111951895B
公开(公告)日：2023-12-26
申请号：CN202010656441.2
申请日：2020-07-09
申请人： 苏州协云基因科技有限公司
摘要： 本发明涉及一种基于宏基因组学的病原分析方法、分析装置、设备及存储介质。本发明所提出的基于宏基因组学的自动化病原分析方法，一方面整合优化了数据分析方法流程和工具，对病原鉴定过程进行标准化，能够大幅提速数据分析时间，缩减临床检测周期，实现快速检测。另一方面平台通过建立微生物参考序列数据库和病原信息库，综合评估参数和证据等级来有效区分病原菌与背景菌，可有效防止因未覆盖而导致的漏检，进一步提升临床检测结果的参考意义和可解读性。
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公开(公告)号：CN117275738A
公开(公告)日：2023-12-22
申请号：CN202310372956.3
申请日：2023-04-04
申请人： 姚景昊
摘要： 本发明公开了一种基于临床免疫炎症指标的HER2阴性晚期胃癌患者一线化疗后无进展生存期（PFS）的预测模型及其应用，包括用来评估HER2阴性晚期胃癌患者一线化疗后PFS的列线图，本发明中的列线图是针对HER2阴性晚期胃癌患者建立的基于临床免疫炎症指标的一线化疗后PFS的预测模型。基于临床免疫炎症指标的一线化疗后PFS预测模型能更准确预测HER2阴性晚期胃癌患者的一线化疗后无进展生存概率，整合了常用临床特征和实验室指标的PFS预测列线图简明扼要，便于临床医生及病人自身进行操作预测患者治疗后无进展生存时间。同时PFS预测模型列线图可以为今后HER2阴性晚期胃癌患者治疗方案的选择提供一定的帮助。
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公开(公告)号：CN117275587A
公开(公告)日：2023-12-22
申请号：CN202311094603.8
申请日：2023-08-29
摘要： 本发明公开了一种用于多组学联合分析展示的方法和装置及其应用。该方法包括如下步骤：步骤1、获取原始下机数据；步骤2、将所述原始下机数据的Hi‑C部分进行第一数据整理；将所述原始下机数据的Hi‑C以外部分进行第二数据处理；其中，所述第一数据处理的步骤包括：步骤3.1、在服务器上，采用Hic‑Pro进行基因比对，并对比到到酶切片段，生成vaildpairs数据；步骤3.2、在服务器上，采用juicer pre将所述vaildpairs数据生成.hic文件；步骤3.3、在服务器上，用juicer dump读取.hic文件；步骤3.4、在服务器上，用HiCCUPs进行call loop处理。本发明的方法和装置为基于linux服务器运行的工具，运用资源更灵活，支持多样本，大数据量处理和可视化，界面更友好，应用更广泛。
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公开(公告)号：CN117275584A
公开(公告)日：2023-12-22
申请号：CN202311281174.5
申请日：2023-09-28
申请人： 中元汇吉生物技术股份有限公司
发明人： 杨琴
摘要： 本申请公开了重测序数据分析方法、电子设备及可读存储介质，应用于重测序数据分析平台，所述重测序数据分析方法包括：获取待分析批量样本的原始测序数据和流程配置数据，其中，所述原始测序数据由所述待分析批量样本在至少一个测序平台基于至少一种测序策略生成；根据所述原始测序数据和所述流程配置数据，生成所述待分析批量样本的样本重测序程序，其中，所述样本重测序程序包括重测序流程数据；根据所述重测序流程数据，通过运行所述样本重测序程序，对所述待分析批量样本进行重测序数据分析。本申请解决了分析批量样本的高通量全基因重测序数据的分析效率低的技术问题。
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公开(公告)号：CN117237198A
公开(公告)日：2023-12-15
申请号：CN202311497061.9
申请日：2023-11-10
申请人： 深圳赛陆医疗科技有限公司
摘要： 本申请实施例提供一种基于深度学习的超分辨测序方法及装置、测序仪及介质，所述方法包括：获取针对测序芯片的与不同碱基类型的测序信号响应对应的多张待测荧光图像形成的多通道输入图像数据；通过超分辨率图像模型的超分图像生成网络对所述多通道输入图像数据分别进行特征提取得到对应的特征图，通过亮度线性度矫正网络对所述多通道输入图像数据进行亮度分布特征统计得到亮度信息直方图，所述超分图像生成网络根据所述特征图进行图像重建得到超分重建图像，基于所述亮度信息直方图对所述超分重建图像进行亮度信息矫正，得到与各通道输入图像数据分别对应的超分辨率图像；基于所述超分辨率图像进行碱基分类预测，得到对应的碱基识别结果。
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公开(公告)号：CN117219191A
公开(公告)日：2023-12-12
申请号：CN202310792491.7
申请日：2023-06-30
申请人： 哈尔滨商业大学
IPC分类号： G16C20/50 , G16C20/70 , G16C20/80 , G16C20/90 , G16B15/30 , G16B20/00 , G16B25/10 , G16B40/00 , G16B45/00 , G16H70/40
摘要： 一种中药方剂组分中药的构建方法，它涉及中药药理学技术领域，本发明的目的是基于网络药理学与组分中药学相结合，利用网络药理学研究方法对组分中作用机理进行研究，将体内外药效学的实验结果与网络药理学获得的关键靶点以及相关通路进行对应验证，确定其潜在的分子机制。本发明通过将药物活性成分与对应靶点的研究方法网络化、系统化，以整体的观念分析药物活性成分及作用机制。与传统研究方法相比，将实验范围缩小化，效率提高，研发目的精确化，从而节省了药物研发实验费用。同时大幅度提高了药物筛选和预测的效率。
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公开(公告)号：CN117198406A
公开(公告)日：2023-12-08
申请号：CN202311222677.5
申请日：2023-09-21
申请人： 亦康(北京)医药科技有限公司
摘要： 本发明公开了一种特征筛选方法、系统、电子设备及介质，可基于元启发式算法和图神经网络解释器，尤其是创造性地将每个候选特征无偏、稳定的特征域内重要性作为一个关键的节点数据纳入到异构图中并使用图神经网络解释器基于异构图可整合、拓扑地得到每个候选特征无偏、稳定的特征域间重要性，从若干特征域的稠密、冗余、超高维、大规模的候选特征中筛选得到数量少、非冗余、可解释、且预测效能高的最优特征组合，有效解决了现有技术中的不足，并取得了积极的技术效果。
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公开(公告)号：CN117174173A
公开(公告)日：2023-12-05
申请号：CN202310839182.0
申请日：2023-07-10
申请人： 武汉科技大学
发明人： 杨珩
摘要： 本发明提出了一种多样本单细胞转录组数据探索不同原发癌症肝转移的新方法，具体地，本发明为整合多来源癌症转移单细胞数据，针对胰腺导管癌、结直肠癌、小肠神经内分泌癌等癌种到相同靶器官‑肝的转移，探索不同癌症肝转移的共性与差异，从而揭示癌症肝转移的器官亲和性，借此，本发明具有的优在于根据可视化结果和分析工具得到的结果，可对差异表达基因、生物学通路和肿瘤微环境等进行解释和探索，利于筛选关键的生物标志物或通路，发现新的细胞类型或亚群等。
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公开(公告)号：CN117153242A
公开(公告)日：2023-12-01
申请号：CN202310881949.6
申请日：2023-07-18
申请人： 中山市人民医院
摘要： 本发明公开一种基于网络药理学与分子对接分析黄岑汤(HD)治疗肝癌的靶点及分子机制的方法，包括以下过程：从TCMSP数据库中鉴定出HD的有效成分和靶点，同时从GeneCards数据库中鉴定出肝癌相关基因；接着利用STRING构建了交叉基因的蛋白质‑蛋白质相互作用(PPI)网络；构建HD有效成分‑作用靶点的网络图，利用Cytoscape 3.9.1分析PPI拓扑结构；并且在Metscape平台上进行GO和KEGG富集通路分析，使用PubChem数据库、SwissADME数据库、Pymol软件和AutoDock软件进行分子对接；最后使用GEPIA数据库评估mRNA表达水平、生存分析和病理分期；用HPA数据库检测蛋白表达水平；使用TCGA数据库检索临床和RNA‑seq数据；采用R包进行HD治疗肝癌的临床分析。通过网络药理学与分子对接筛选出8种HD的有效成分和7种肝癌的相关基因，发现HD可调节7种肝癌相关基因的表达，并且HD可能通过PI3K‑AKT通路治疗肝癌，验证HD对肝癌的治疗作用。
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公开(公告)号：CN117070593A
公开(公告)日：2023-11-17
申请号：CN202310830890.8
申请日：2023-07-06
申请人： 广东工业大学
IPC分类号： C12Q1/06 , G01N21/64 , G01N1/28 , G16B45/00 , C12Q1/14 , C12Q1/10 , C12R1/19 , C12R1/445 , C12R1/385 , C12R1/725 , C12R1/01
摘要： 本发明属于生物气溶胶检测技术领域，具体涉及一种生物气溶胶中微生物浓度和活性的检测方法及其应用。该方法基于改进ATP生物化学发光法，通过构建气溶胶中微生物浓度与相对荧光强度(RLU)之间的标准曲线，利用测定的RLU获得微生物的浓度；并建立ATP浓度与RLU的标准曲线，结合气溶胶中细菌浓度与RLU之间的标准曲线，计算气溶胶中微生物ATP浓度，获得气溶胶中微生物的活性，实现快速检测空气中微生物浓度和活性。该方法可操作性强、不依赖于培养时间、成本低、反应灵敏、条件易达成，为生物气溶胶提供了即时的检测手段。
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