公开(公告)号：CN117153242B

公开(公告)日：2024-10-15

申请号：CN202310881949.6

申请日：2023-07-18

申请人： 中山市人民医院

发明人： 洪明 ,  蓝婷 ,  李秋霞 ,  王伟佳 ,  罗丽香 ,  梁颖文 ,  郭镇聪

IPC分类号： G16B15/30 ,  G16B50/00 ,  G16B45/00

摘要： 本发明公开一种基于网络药理学与分子对接分析黄芩汤（HD）治疗肝癌的靶点及分子机制的方法，包括以下过程：从TCMSP数据库中鉴定出HD的有效成分和靶点，同时从GeneCards数据库中鉴定出肝癌相关基因；接着利用STRING构建了交叉基因的蛋白质‑蛋白质相互作用（PPI）网络；构建HD有效成分‑作用靶点的网络图，利用Cytoscape 3.9.1分析PPI拓扑结构；并且在Metscape平台上进行GO和KEGG富集通路分析，使用PubChem数据库、SwissADME数据库、Pymol软件和AutoDock软件进行分子对接；最后使用GEPIA数据库评估mRNA表达水平、生存分析和病理分期；用HPA数据库检测蛋白表达水平；使用TCGA数据库检索临床和RNA‑seq数据；采用R包进行HD治疗肝癌的临床分析。通过网络药理学与分子对接筛选出8种HD的有效成分和7种肝癌的相关基因，发现HD可调节7种肝癌相关基因的表达，并且HD可能通过PI3K‑AKT通路治疗肝癌，验证HD对肝癌的治疗作用。

公开(公告)号：CN117153242A

公开(公告)日：2023-12-01

申请号：CN202310881949.6

申请日：2023-07-18

申请人： 中山市人民医院

发明人： 洪明 ,  蓝婷 ,  李秋霞 ,  王伟佳 ,  罗丽香 ,  梁颖文 ,  郭镇聪

IPC分类号： G16B15/30 ,  G16B50/00 ,  G16B45/00

摘要： 本发明公开一种基于网络药理学与分子对接分析黄岑汤(HD)治疗肝癌的靶点及分子机制的方法，包括以下过程：从TCMSP数据库中鉴定出HD的有效成分和靶点，同时从GeneCards数据库中鉴定出肝癌相关基因；接着利用STRING构建了交叉基因的蛋白质‑蛋白质相互作用(PPI)网络；构建HD有效成分‑作用靶点的网络图，利用Cytoscape 3.9.1分析PPI拓扑结构；并且在Metscape平台上进行GO和KEGG富集通路分析，使用PubChem数据库、SwissADME数据库、Pymol软件和AutoDock软件进行分子对接；最后使用GEPIA数据库评估mRNA表达水平、生存分析和病理分期；用HPA数据库检测蛋白表达水平；使用TCGA数据库检索临床和RNA‑seq数据；采用R包进行HD治疗肝癌的临床分析。通过网络药理学与分子对接筛选出8种HD的有效成分和7种肝癌的相关基因，发现HD可调节7种肝癌相关基因的表达，并且HD可能通过PI3K‑AKT通路治疗肝癌，验证HD对肝癌的治疗作用。