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公开(公告)号:CN111172295B
公开(公告)日:2022-07-05
申请号:CN202010117701.9
申请日:2020-02-25
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛VAMP7基因CNV标记的方法及专用试剂盒:以黄牛的血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增黄牛VAMP7基因CNV区域和参考基因BTF3的部分片段,根据2*2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定黄牛VAMP7基因的拷贝数变异类型。与云岭牛、夏南牛、皮南牛和郏县红牛生产数据的关联分析显示,正常型个体的十字部高显著高于插入型和正常型个体。本发明通过在DNA水平上检测与云岭牛生长性状密切相关的CNV标记,可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN111139303B
公开(公告)日:2022-07-05
申请号:CN202010006028.1
申请日:2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CADM2基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以山羊的基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增山羊CADM2基因的拷贝数变异区域部分片段,并应用另外一对特异性PCR引物扩增山羊内参基因MC1R部分片段作为对照,最后利用‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。基于山羊CADM2基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,本发明提供的方法可用于快速建立山羊遗传资源优势种群,有利于加快山羊分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110777166B
公开(公告)日:2021-11-30
申请号:CN201911167805.4
申请日:2019-11-25
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种牛KLF3基因真核过表达载体的构建与应用。针对秦川牛KLF3基因编码区设计引物,并扩增对应的牛KLF3基因;构建pcDNA3.1‑KLF3重组过表达载体,并转染细胞。本发明通过克隆牛KLF3基因并构建真核过表达载体,可应用于牛KLF3基因功能研究、鉴定和调控肌肉生长发育。
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公开(公告)号:CN113481303A
公开(公告)日:2021-10-08
申请号:CN202110892448.9
申请日:2021-08-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ACTR3基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术,以黄牛个体基因组DNA为模板,以一对特异性引物扩增ACTR3基因拷贝数变异区域的部分片段,以另外一对特异性引物扩增BTF3基因的部分片段作为内参,最后利用‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于ACTR3基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,可用于快速建立黄牛遗传资源优势种群,有利于加快牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN112813175A
公开(公告)日:2021-05-18
申请号:CN202110342428.4
申请日:2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor: 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 柴亚楠 , 刘贤 , 李克丽 , 杜雪儿 , 郑中华 , 乔小玉 , 郎利敏 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛CHRDL1基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及其应用:以牛血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR技术,用两对引物P1、P2分别对牛CHRDL1基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增,根据2*2‑ΔΔCt确定个体CHRDL1基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据CHRDL1基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果,本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记,可用于牛生长性状的标记辅助选择,加速良种选育进程。
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公开(公告)号:CN110564829A
公开(公告)日:2019-12-13
申请号:CN201910943149.6
申请日:2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种奶牛NCAM2基因CNV标记辅助检测泌乳性状的方法及其专用试剂盒:利用实时定量PCR技术,以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板,分别用两对引物P1、P2对牛NCAM2基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域进行扩增,最后利用2*2-ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记,可加快奶牛优良产乳性能的选育进程。该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN109371145A
公开(公告)日:2019-02-22
申请号:CN201811565430.2
申请日:2018-12-20
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛SPARC基因单核苷酸多态性标记的检测方法及其应用,根据黄牛SPARC基因SNP位点(g.12545 C>T)为C或T的碱基多态性,以待测黄牛基因组DNA为模板,以突变受阻扩增引物PCR扩增黄牛SPARC基因部分片段;扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛SPARC基因的基因型;本发明可以在DNA水平上检测与黄牛生长性状关联的分子标记,以加快黄牛的早期选育,培育出生长性状优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN112831576B
公开(公告)日:2023-07-07
申请号:CN202110343708.7
申请日:2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor: 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 刘贤 , 柴亚楠 , 李克丽 , 牛梦晓 , 乔小玉 , 郑中华 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛DYNC1I2基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及专用试剂盒,以牛血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR技术,用两对引物P1、P2分别对牛DYNC1I2基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增,根据2*2‑ΔΔCt确定个体DYNC1I2基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据DYNC1I2基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果,本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记,可用于牛生长性状的标记辅助选择,加速良种选育进程。
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公开(公告)号:CN110964839B
公开(公告)日:2022-11-08
申请号:CN202010006820.7
申请日:2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种SERPINA3‑1基因CNV标记辅助检测黄牛生长性状的方法及其应用。该方法基于实时荧光定量PCR,以黄牛基因组DNA为模板,扩增黄牛SERPINA3‑1基因的拷贝数变异区域及内参基因BTF3基因的部分片段,运用2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。基于黄牛SERPINA3‑1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,本发明提供的方法可用于快速建立种质资源优良的黄牛种群,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN111394474B
公开(公告)日:2022-08-16
申请号:CN202010213959.9
申请日:2020-03-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛GAL3ST1基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以黄牛(例如,秦川牛)基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增黄牛GAL3ST1基因的拷贝数变异区域的部分片段,利用另外一对特异性PCR引物扩增黄牛通用转录因子3基因部分片段作为内参,最后利用2*2‑ΔΔCt的方法对定量结果进行计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在秦川牛GAL3ST1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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