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公开(公告)号：CN102199668B
公开(公告)日：2014-03-12
申请号：CN201110095717.5
申请日：2011-04-15
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种生物遗传技术领域的纳米颗粒分子单倍型分型方法，以待测样本的基因组DNA为模板，用对应目的DNA片段中的SNP等位基因的正向等位基因特异性引物和反向通用引物，通过长片段AuNP ASPCR处理实现目的DNA片段的染色单体的分离和扩增。本发明创新地在ASPCR体系中加入AuNP，有效的提高了单倍型分型的特异性；得到的单倍体PCR产物可直接用于SNP基因分型，如TaqMan探针和测序等，来获得待测两倍体个体的一个单倍型。待测样本的另一个单倍型可以用同样的方法得到，或者从基因型来推测。
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公开(公告)号：CN118604346A
公开(公告)日：2024-09-06
申请号：CN202410707752.5
申请日：2024-06-03
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: G01N33/58 , G01N33/543
Abstract: 本发明公开了一种通过抗体吸附构建高通量蛋白捕获界面的方法，该方法包括以下步骤：S1，合成四面体框架核酸结构；S2，将捕获抗体和合成的四面体框架核酸结构混合制备于金岛基底上，构建高通量蛋白捕获界面；S3，将金岛基底置于湿盒中孵育过夜；S4，对捕获界面进行封闭，防止非特异性吸附；S5，孵育蛋白靶标；S6，孵育检测抗体；S7，孵育荧光二抗；S8，纯水洗涤捕获界面，并离心晾干；S9，利用芯片扫描仪对捕获界面进行荧光成像和定量。本发明一种通过抗体吸附构建高通量蛋白捕获界面的方法具有高度的均一性，可以实现高通量、高灵敏度、高准确性的蛋白捕获和定量检测。
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公开(公告)号：CN118421298A
公开(公告)日：2024-08-02
申请号：CN202410511492.4
申请日：2024-04-25
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种高亮度发光金属团簇纳米聚集体的制备及应用，具体地，本发明提供了一种发光金属团簇纳米聚集体，聚集体包括两亲性DNA框架纳米模版和组装于模板内的发光金属团簇，其中两亲性DNA框架纳米模版包括核酸纳米外壳和位于外壳中心的疏水性烷基核；核酸纳米外壳为中空的结构，外壳的内表面上有突触链；疏水性烷基核由疏水性分子构成，疏水性分子包括互补段、延伸段、尾段，互补段与突触链碱基互补构成联结，尾段形成核位点；发光金属团簇包括富集在疏水性烷基核的核位点周围、被限制于中空区域内的分子结构。本发明的聚集行为具备尺寸可控，亮度高，光稳定性强等优点。相比现有纳米荧光探针具有显著优势，为生物成像提供了新的工具。
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公开(公告)号：CN118374489A
公开(公告)日：2024-07-23
申请号：CN202410608484.1
申请日：2024-05-16
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: C12N15/11 , C12N15/115 , G01N33/569 , G01N33/543 , G01N33/574
Abstract: 本发明公开了一种DNA纳米结构，该DNA纳米结构包括基础框架核酸结构，在所述基础框架核酸结构的某一顶端延伸出一段碱基序列。制备方法包括以下步骤：1)DNA纳米结构自组装：将DNA单链通过退火反应经碱基互补配对合成DNA纳米结构；2)在复杂环境中，使DNA纳米结构与靶向的肿瘤细胞表面特异性抗原结合；3)通过磁珠孵育和磁分离手段将与DNA纳米结构结合的肿瘤细胞从溶液中分离和捕获。所述DNA纳米结构应用于肿瘤细胞的分离捕获。本发明所制备的DNA纳米结构，以框架核酸结构为基础，有效提高适配体在复杂环境中的稳定性和结构的完整性，且该结构能进一步提高DNA纳米结构的特异性和灵敏性，从而实现复杂体系中肿瘤细胞的捕获。
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公开(公告)号：CN118256467A
公开(公告)日：2024-06-28
申请号：CN202410333012.X
申请日：2024-03-22
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及末端脱氧核苷酸转移酶变体、核酸及应用，涉及基因工程领域。其包括野生型或携带突变的末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)、单链DNA稳定因子(sSF)和柔性连接子；所述单链DNA稳定因子通过所述柔性连接子融合至所述末端脱氧核苷酸转移酶的N末端或/和C末端，或者插入至所述末端脱氧核苷酸转移酶的序列中间处。本发明获得了不依赖于模板的末端脱氧核苷酸转移酶突变体，这些TdT突变体能显著提高其耦合天然核苷酸和3’‑OH修饰核苷酸的效率，同时增强了3’‑OH修饰核苷酸掺入到具有发卡二级结构寡核苷酸的合成效率，可用于高效可控的合成寡核苷酸，这些TdT突变体可用于酶促寡核苷酸的合成，或用于其他循环合成功能DNA片段。
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公开(公告)号：CN117683095A
公开(公告)日：2024-03-12
申请号：CN202211068677.X
申请日：2022-09-02
Abstract: 提供了一种蛋白与核酸连接的方法。具体提供了末端脱氧核苷酸转移酶与核酸化学连接的方法，包括但不限于使用SPDP进行偶联，其特征在于，包括以下步骤：S1,NH2修饰的DNA与SPDP连接得到SPDP修饰的DNA；S2,SPDP修饰的DNA与TdT进行化学键连接，得到TdT‑DNA复合物。S3,测定TdT‑DNA复合物的紫外吸收光谱，确定复合物具体浓度。
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公开(公告)号：CN116850278A
公开(公告)日：2023-10-10
申请号：CN202310536645.6
申请日：2023-05-12
Applicant: 上海交通大学
IPC: A61K39/39 , A61K31/7068 , A61K31/7076 , A61K45/06 , A61P35/00 , A61P37/04 , C12N15/113
Abstract: 本发明属于医药化学和生物技术领域，尤其涉及一种负载治疗性核苷类似物的RNA佐剂及其制备方法和应用，例如用于肿瘤的干扰素疗法的化学疗法的联合治疗，负载治疗性核苷类似物的RNA佐剂中，RNA佐剂为单链二维RNA纳米结构，RNA佐剂的单链中掺杂有治疗性核苷类似物。本发明负载治疗性核苷类似物的RNA佐剂不仅具有治疗性核苷类似物对肿瘤细胞的杀伤作用，同时还保持了RNA佐剂免疫激活的功能，能够诱导肿瘤细胞自分泌干扰素，激活一系列干扰素抗癌功能，并增强敏化了化疗效果，实现了肿瘤细胞的联合杀伤。
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公开(公告)号：CN116376900A
公开(公告)日：2023-07-04
申请号：CN202310435275.7
申请日：2023-04-21
IPC: C12N15/10 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明提供一种用于模拟DNA链置换的亚微米元DNA系统的制备方法及其应用。包括如下步骤：A1：选择长链DNA作为支架链；A2：分别将支架链、不同类型的核心短链DNA和延伸出的元碱基DNA链混合在1×TAE缓冲液中；A3：PCR退火实现不同类型单链元DNA的组装；A4：通过加入TAE缓冲液，离心，获得单链元DNA S1、S2和S3；A5：将单链元DNA S1和部分互补单链元DNA S2以1:1混合，PCR退火，获得双链元DNA[S1:S2]。本发明的自主重构技术操作简单，特异性强，灵敏度高，适用范围广，与现有重构技术相比，本发明无需外源重构因子的引入即可实现亚微米尺度系统的自主程序化重构。
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公开(公告)号：CN113092425B
公开(公告)日：2022-09-27
申请号：CN202110334439.8
申请日：2021-03-29
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供一种基于pH响应的DNA纳米机器建立可编程细胞间通讯的方法，使用三链DNA结构使细胞表面功能化，赋予细胞响应pH变化的功能而进行细胞组装，固定在细胞表面的三链DNA纳米结构可以响应生理条件下的pH变化，实现三链结构与双链结构的相互转换，从而连接上另一组通过互补ssDNA修饰的细胞。根据本发明提供的一种基于pH响应的DNA纳米机器建立可编程细胞间通讯的方法，利用三链DNA结构赋予细胞可编程pH响应型通讯的能力，具有用量少、操作简便快速和灵敏度高等优点。
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公开(公告)号：CN113801912A
公开(公告)日：2021-12-17
申请号：CN202111208494.9
申请日：2021-10-18
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
Abstract: 本发明属于化学检测领域，涉及一种基于核酸介导的酶级联用于肌氨酸的检测方法及试剂盒。该方法包括：通过核酸调控肌氨酸氧化酶(SOX)和过氧化物氧化酶(HRP)之间的间距，以将酶级联反应限定在纳米级的特定区域；显色反应，并测定肌氨酸含量。该方法中核酸分子实现间距的精确调控和高特异性。该方法特异性强，效率高，显著提高检测的灵敏度和精确度，所需要的检测设备和场地苛刻度不高，成本低，具有重要的研究意义和应用价值。
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