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公开(公告)号：CN104725453A
公开(公告)日：2015-06-24
申请号：CN201510031230.9
申请日：2015-01-21
Applicant: 上海交通大学
CPC classification number: C07H19/10 , C07C247/10 , C07H1/00 , C12Q1/6869 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明提供了一种基于偶氮连接单元的荧光标记核苷酸及其用途，其结构式如式VI所示：其中，荧光素选自BODIPY、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、Alexa、Squaring染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种；R1、R2、R3、R4、R6为各种取代基，R5为除-C2H5以外的取代基、且R1、R2、R3、R4、R5、R6不同时为H；n为0～10的整数。与现有技术相比，本发明合成了一类新的基于偶氮连接单元的可逆终端；该类可逆终端在温和的条件下可以实现高效率的剪切，可用于DNA测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN103539697A
公开(公告)日：2014-01-29
申请号：CN201310462509.3
申请日：2013-09-30
IPC: C07C245/08 , C07H19/10 , C07H1/00 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种还原敏感偶氮连接单元的合成及其在DNA测序中的用途；该还原敏感偶氮连接单元结构式如下：其中m为0～44中任一整数，n为0～44中任一整数。该还原敏感偶氮连接单元与核苷酸及荧光素连接得到可逆终端，所述可逆终端用于DNA合成测序。与现有技术相比，本发明合成了一类新的可裂解连接单元，并用于合成了基于这种连接单元的可逆终端；该类可逆终端在温和的条件下可以实现高效率的裂解，可用于DNA合成测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN118084996A
公开(公告)日：2024-05-28
申请号：CN202410228897.7
申请日：2024-02-29
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/10 , C12Q1/6869 , C07H19/14 , C07H1/00 , C09K11/06
Abstract: 本发明公开了一种可逆终止核苷酸及其在DNA合成测序及单分子测序中的应用，所述荧光标记核苷酸典型结构#imgabs0#其中Base为U,C,A,G四个不同的碱基；R是将噻唑烷连接单元与核苷酸连接在一起的化学分子基团；Cleavable Linker为噻唑烷连接单元；R1是将噻唑烷连接单元与荧光素连接在一起的化学分子基团；Dye是荧光染料。该可逆终止核苷酸在参与DNA链延伸后，可快速发生断裂。断裂后，残留在碱基上的基团较小，有利于DNA合成测序的顺利进行。在DNA合成测序及单分子测序中，连接单元可快死断裂，反应干净彻底，几乎没有观察到副反应发生；且该类化合物合成简单方便，且可以大量合成，能够极大降低测序成本。
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公开(公告)号：CN110343612B
公开(公告)日：2021-07-13
申请号：CN201810308292.3
申请日：2018-04-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , C12M1/34 , C12M1/00
Abstract: 本发明提供了一种基于多色荧光可逆终止核苷酸的DNA单分子测序系统及装置，所述测序系统包括引物、待测DNA模板、多色荧光可逆终止核苷酸测序试剂；所述引物固定在流通池反应器表面；将待测DNA模板与测序引物进行杂交，然后用多色荧光可逆终止核苷酸延伸引物后，检测延伸引物的荧光信号即可得到待测DNA序列信息；所述待测DNA模板的3’端不需要标记定位荧光。本发明通过利用测序循环过程中，延伸反应物的荧光作为下一次延伸的定位荧光，或采用固定在流通池反应器表面的定位荧光标记物作为定位荧光，无需对待测DNA模板的3’端标记定位荧光，从而有效避免了由于淬灭而导致定位信息丢失的问题，可进一步大幅延长测序读长并降低错误率。
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公开(公告)号：CN109232693A
公开(公告)日：2019-01-18
申请号：CN201811143066.0
申请日：2018-09-28
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种核苷四磷酸的合成方法。所述方法包括以下步骤：将核苷与环状磷酸化试剂发生选择性磷酸化反应，再经氧化、水解开环，即得所述核苷四磷酸。所述环状磷酸化试剂的结构如式I所示：式I。本方法将核苷在该高选择性磷酸化试剂作用下,选择性地生成5＇-核苷四磷酸，在此过程中并不需要将3＇-OH(以及2＇-OH)保护起来，即能有效抑制3＇(以及2＇-)四磷酸的生成。本发明合成的核苷四磷酸在DNA测序、标记、延伸等生物学领域具有广泛用途，目前其销售价格昂贵，合成方法复杂，反应选择性差；而本发明提供的合成方法选择性好，容易分离纯化，且所需实验条件简单，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108424844A
公开(公告)日：2018-08-21
申请号：CN201810307850.4
申请日：2018-04-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12M1/34 , C12M1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种单分子测序芯片及其制备方法，所述芯片包括流道板、基板和盖板，所述流道板设置在基板和盖板之间；所述流道板上设置流通池，所述流通池包括多个平行设置的流道；所述流通池的上方设置盖板、流通池的下方设置基板；所述流道的底部与基板表面连通；与流道板接触的所述基板的表面固定测序引物和定位用荧光标记物。该芯片表面负载有荧光寿命长、荧光强度高，荧光性能稳定的量子点或荧光微球，可以在测序过程中对目标DNA单分子进行定位。由于量子点或荧光微球在经过很多次的激发光照后仍然能够保持较高的荧光强度，解决了定位荧光信号无法长时间保持的问题，显著提高单分子测序读长，降低测序的错误率，并有效降低测序成本。
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公开(公告)号：CN106588722A
公开(公告)日：2017-04-26
申请号：CN201510684831.X
申请日：2015-10-20
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C323/52 , C07C319/20 , C07H19/10 , C07H1/00 , C12Q1/68
CPC classification number: C07C319/20 , C07C323/52 , C07H1/00 , C07H19/10 , C12Q1/6869 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了一种硫代缩酮连接单元的合成及其在DNA测序中的用途。该连接单元的结构式为：，其中R＝OH或者COOH；R1＝R2＝甲基，或R1＝苯基、对甲氧基苯基、2，4，6-三甲氧基苯基、萘基或对甲氧基萘基，R2＝H，或R1、R2共同构成环己基、环戊基。该连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的荧光素标记核苷酸可用于DNA测序。与现有技术相比，本发明合成的基于硫代缩酮结构的连接单元的可逆终止剂用于DNA测序时，其延伸效率接近100％，并且在模板为连续多个相同碱基时，一次只延伸一个可逆终止剂；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN104262637B
公开(公告)日：2017-01-11
申请号：CN201410425382.2
申请日：2014-08-26
Applicant: 上海交通大学
IPC: C08G81/00 , C08G63/91 , C08G65/48 , C07C319/20 , C07C323/52 , A61K47/34 , A61K9/107 , A61P35/00 , A61K31/704 , A61K31/337 , A61K31/015 , A61K31/4745
Abstract: 本发明公开一种双重敏感嵌段共聚物及其自组装胶束及其制备方法，还公开制备该双重敏感嵌段共聚物的亲水化合物及疏水化合物及其制备方法，更公开制备该亲水化合物的中间体及其制备方法，该双重敏感嵌段共聚物M的结构式为 通过分别制备亲水化合物和疏水化合物；取亲水化合物、疏水化合物在卤代烃溶剂中混合进行氧化反应制得双重敏感嵌段共聚物M。该双重敏感嵌段共聚物或与药物溶于极性溶剂中可制成胶束，该胶束可用于空白胶束的稳定性测定、对不同浓度GSH,H2O2的应激效应、载药胶束在GSH，H2O2的应激作用下的药物控制释放。本发明化合物合成原料简单易得，制得的胶束具有良好的稳定性，反应条
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公开(公告)号：CN106177987A
公开(公告)日：2016-12-07
申请号：CN201610680172.7
申请日：2016-08-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: A61K47/48 , A61K9/107 , A61K31/655 , A61P35/00 , A61K31/7068 , A61K31/7072 , A61K31/4745
CPC classification number: A61K33/00 , A61K31/4745 , A61K31/655 , A61K31/7068 , A61K31/7072 , A61K2300/00
Abstract: 本发明公开了一种小分子-高分子轭合物自组装载药纳米颗粒及其制备方法；本发明采用简单高效的方法将小分子抗癌药和高分子链通过特定基团连接起来，形成自组装纳米胶束，同时利用疏水相互作用包裹一氧化氮前体药物于高分子链段中，得到具有酸敏感性的载药纳米颗粒，能够稳定地输送至肿瘤组织，在肿瘤细胞内酸性环境的刺激下分解释放抗癌药和一氧化氮，可以实现对肿瘤的协同治疗。与现有技术相比，本发明的小分子-高分子轭合物自组装载药纳米颗粒能够在肿瘤细胞内环境中同时释放抗癌药和一氧化氮，有效降低肿瘤细胞的多药耐药性，明显提升肿瘤的治疗效果，因此在肿瘤的治疗方面有着广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN106083676A
公开(公告)日：2016-11-09
申请号：CN201610402708.9
申请日：2016-06-07
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C323/52 , C07C323/25 , C07H19/10 , C07H19/14 , C07H1/00 , C12Q1/68
CPC classification number: Y02P20/55 , C07C323/52 , C07C323/25 , C07H1/00 , C07H19/10 , C07H19/14 , C12Q1/6869 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开一种硫代缩酮连接单元及其合成方法、用途；所述硫代缩酮连接单元的结构如式(Ⅰ)所示:其中，R＝‑OH或者‑COOH；R1与R2的满足如下条件中的一种：(1)R1＝R2＝甲基；或，(2)R1＝苯基、对甲氧基苯基、2,4,6‑三甲氧基苯基、萘基或对甲氧基萘基，R2＝H；或，(3)R1、R2共同构成环己基或环戊基。该单元与核苷酸及荧光素连接得到的荧光素标记核苷酸可用于DNA测序。与现有技术相比，本发明连接单元的可逆终止剂用于DNA测序时，其延伸效率接近100％，并且在模板为连续多个相同碱基时，一次只延伸一个可逆终止剂；其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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