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公开(公告)号：CN102043896A
公开(公告)日：2011-05-04
申请号：CN200910247213.3
申请日：2009-12-28
Applicant: 中国人民解放军第二军医大学东方肝胆外科医院 , 上海生物信息技术研究中心
IPC: G06F19/00
Abstract: 本发明揭示了临床组织样本库信息管理方法，包括：建立一临床组织样本库，所述样本库信息包括样本分类标签信息和定位标签信息，其中，所述样本分类标签信息包括医院、患者住院号、样本类型和数量等信息，所述定位标签信息包括存储设备及其内划分的抽屉、试管盒和试管编号等信息；对所述存储设备按照所述定位标签信息进行划分；采集患者样本，并对应贴上所述样本分类标签和所述定位标签后，根据所述定位标签信息，将所述患者样本存放入所述存储设备中；根据所述患者住院号提交调用请求；从所述样本库中获取所述患者的定位标签信息，自所述存储设备中取出，并导出所述患者的样本完整信息，返回步骤四。本发明大大提高标本库的标本管理效率和质量。
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公开(公告)号：CN101776680A
公开(公告)日：2010-07-14
申请号：CN200810037654.6
申请日：2008-05-20
Applicant: 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所 , 华东理工大学 , 上海生物信息技术研究中心
IPC: G01N33/38 , C07K14/435 , C07K1/00 , A61K38/00 , A61K31/702 , A61K39/395 , A61P33/12
CPC classification number: Y02A50/423
Abstract: 本发明公开了一种筛选治疗和/或预防日本血吸虫感染药物的药物作用靶标，所述的靶标为含有日本血吸虫腺苷酸转运蛋白(SjANT)和二磷酸腺苷(ADP)相互作用的活性位点。本发明还公开了所述靶标的构建方法及其用途。
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公开(公告)号：CN101538611A
公开(公告)日：2009-09-23
申请号：CN200910049306.5
申请日：2009-04-14
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明涉及生物信息学领域，具体涉及一种RNA和DNA双外参实时定量荧光PCR检测方法及其应用，包括如下步骤：选定外参基因；制备外参基因的mRNA与DNA，配制外参基因的mRNA与DNA的预混合液；在抽提样品时加入预混合液，收集样品中的总mRNA和DNA部分；实时定量荧光PCR，计算待测基因和外参基因mRNA和DNA的拷贝数；数据处理和归一化。本发明还公开了上述方法在基因芯片分析基因表达技术中的应用。本发明改进了对基因转录水平检测的实验设计，可以得到某个基因的真实的转录水平而不是一个相对水平，为基因表达数据和基因拷贝数据的整合提供新的概念和框架。
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公开(公告)号：CN1566143A
公开(公告)日：2005-01-19
申请号：CN03145229.9
申请日：2003-06-25
Applicant: 中国科学院上海生命科学研究院 , 上海生物信息技术研究中心
IPC: C07K14/165 , C07K16/08 , G01N33/569 , G01N33/577 , A61K38/16 , A61P31/14 , A61P11/00
Abstract: 本发明涉及SARS冠状病毒核衣壳蛋白(N蛋白)的抗原决定簇及其应用。具体地本发明使用人工合成的源自SARS病毒N蛋白的抗原多肽以及该多肽免疫动物后产生的抗体(单抗或多抗)，结合酶联免疫的方法检测人血清样品中的早期抗SARS抗体IgM或IgG，或直接检测血清样品中SARS病原体。该多肽还可用于制备治疗SARS疾病的药物或预防SARS疾病的疫苗。
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公开(公告)号：CN115261494A
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202110486116.0
申请日：2021-04-30
Applicant: 上海旺旺食品集团有限公司 , 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种检测小肠结肠炎耶尔森菌的系统、方法及其应用。所述方法包括：识别小肠结肠炎耶尔森菌基因组序列中富含AT碱基的序列作为目标序列；针对目标序列自动化、高通量地设计特异性引物；设计特定的Tm值计算公式计算反应变性及退火温度，并据此设置核酸扩增反应条件；在模板局部解链的条件下进行核酸扩增反应。本发明靶向传统核酸扩增方法通常需要规避的富含AT碱基的序列，极大地拓宽候选靶标区域；通过基于海量基因组数据的特异性排查，以及针对富含AT区域的Tm值的精确计算，实现双链DNA的局部解链，大大降低了核酸扩增技术中非特异性扩增的可能性。该方法有效地拓展了传统核酸扩增技术的应用范围，显著提升了反应性能。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108034712A
公开(公告)日：2018-05-15
申请号：CN201711452354.X
申请日：2017-12-28
Applicant: 上海市儿童医院 , 上海生物信息技术研究中心 , 上海产业技术研究院
IPC: C12Q1/6883 , G01N33/68
Abstract: 本发明涉及生物技术领域，具体提供了一种川崎病关联物质作为生物标志物在制备用于川崎病冠状动脉病变风险评估的试剂盒中的用途，所述川崎病关联物质选自以下一项或多项：川崎病关联基因或其片段、所述川崎病关联基因或其片段转录的mRNA、所述川崎病关联基因或其片段编码的蛋白质；其中，所述川崎病关联基因包括以下1~8项：CD247基因、TNFRSF1A基因、SMAD2基因、MMP9基因、BMP2基因、ACVR2B基因、CXCL14基因、CD14基因本发明可以评估川崎病患者以及可疑患儿的川崎病冠状动脉病变风险，从而使医护人员可以及早采取相应治疗或预防措施。
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公开(公告)号：CN106367475A
公开(公告)日：2017-02-01
申请号：CN201510437485.5
申请日：2015-07-23
Applicant: 上海生物信息技术研究中心 , 中国科学院上海生命科学研究院复旦大学
Abstract: 本发明属于分子生物学和医学领域，具体涉及人DNA错配修复基因（mismatch repairgenes，MMR）的突变检测试剂盒及其用途，更具体地是涉及人MLH1、MSH2、MSH6、PMS1、PMS2基因的突变检测及其与遗传性非息肉性结直肠癌HNPCC）相关性的检测。本发明的试剂盒可用于检测个体的MMR基因外显子突变的基因型，为判断该个体是否患有HNPCC以及家族成员患病风险是否大于普通人群提供参考数据。
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公开(公告)号：CN101864493B
公开(公告)日：2012-11-28
申请号：CN200910049555.4
申请日：2009-04-17
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种用于检测人乳头瘤病毒的检测试剂盒，包括人乳头瘤病毒测序引物溶液。本发明还公开了上述用于检测高危型人乳头瘤病毒的试剂盒的制备方法和使用方法。本发明的试剂盒可以确定待测样本中是否包含HPV病毒，以及具体病毒亚型。同时通过在待测DNA样本加上用来区分样本来源的身份标签，即可满足一次检测多人的高通量临检要求。本发明的试剂盒超过传统的检测手段，序列差异定位到碱基水平，检测更灵敏准确，同时也规避了假阳性污染的可能。
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公开(公告)号：CN102222177A
公开(公告)日：2011-10-19
申请号：CN201110191810.6
申请日：2011-07-08
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: G06F19/16
Abstract: 本发明涉及一种抗体蛋白的分子改造辅助预测方法，包括以下步骤：(1)扫描抗体与抗原相互作用界面的氨基酸残基；(2)对抗体与抗原相互作用界面上的氨基酸残基进行微环境判断；(3)确定候选改造位点，进行虚拟突变获得抗原与突变抗体复合物体系，计算结合自由能以及突变所造成的结合自由能改变；(4)根据步骤(3)的计算结果，按需求挑选可能对亲和力及特异性有较大影响的作为改造候选位点的氨基酸残基给出结果，从而指导实验。本发明设计巧妙独特，结合了抗体分子作用界面统计规律，能定性并定量的预测突变后抗体对抗原亲和力的改变，大大提高了预测准确度，适于大规模推广应用。
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公开(公告)号：CN101864493A
公开(公告)日：2010-10-20
申请号：CN200910049555.4
申请日：2009-04-17
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种用于检测人乳头瘤病毒的检测试剂盒，包括人乳头瘤病毒测序引物溶液。本发明还公开了上述用于检测高危型人乳头瘤病毒的试剂盒的制备方法和使用方法。本发明的试剂盒可以确定待测样本中是否包含HPV病毒，以及具体病毒亚型。同时通过在待测DNA样本加上用来区分样本来源的身份标签，即可满足一次检测多人的高通量临检要求。本发明的试剂盒超过传统的检测手段，序列差异定位到碱基水平，检测更灵敏准确，同时也规避了假阳性污染的可能。
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