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公开(公告)号：CN101441682A
公开(公告)日：2009-05-27
申请号：CN200710170732.5
申请日：2007-11-21
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明提供了一种中药药效物质机理的生物信息分析平台及其分析方法，包括中药活性成分及含量数据库模块，INVDOCK软件包模块和网络数据库模块，网络数据库模块包括人类蛋白相互作用数据库、代谢数据库、和信号转导数据库、治疗性药靶数据库、药物副作用靶点数据库和药物吸收分布代谢排出数据库，还提供了一种采用该生物信息分析平台分析中药药效物质机理的方法，该生物信息分析平台能全面分析中药药效物质的药理机制，具有准确、高效的特点，为中药药理研究提供指导，可以大大加快中药药理研究，加速开发新型中药。
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公开(公告)号：CN102507883B
公开(公告)日：2014-10-08
申请号：CN201110364010.X
申请日：2011-11-16
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: G01N33/15
Abstract: 本发明涉及一种基于生物过程预测药物新疗效的方法，以疾病为导向，基于生物过程谱的药物-疾病关联性来预测药物的潜在的新治疗功能，包括以下步骤：(1)构建疾病生物过程谱以及药物生物过程谱；(2)在生物过程谱层面上计算药物-疾病的关联性得分；(3)衡量关联性得分的显著性；(4)筛选有显著性的药物-疾病关系，用户可根据关联性得分排序结果，对药物的功能进行进一步的实验论证。还涉及上述方法在预测药物新疗效中的应用。本发明的预测方法设计巧妙，可以较为全面的评估药物-疾病的关系，对于寻找疾病新的治疗药物，药物潜在毒副作用发现，扩展现有药物的治疗功能空间以及“旧”药新用等有着重要的意义，适于大规模推广应用。
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公开(公告)号：CN101441632A
公开(公告)日：2009-05-27
申请号：CN200710170730.6
申请日：2007-11-21
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明涉及一种基于数据库技术的确定中药主要有效成份的方法，包括根据中药名称在HICD数据库中查询中药条目记录信息、根据中药条目记录信息在HICD数据库中查询对应的中药成份记录信息、将中药成份记录信息中的化合物含量信息进行单位统一化处理、将处理后的化合物含量信息逐一与系统预设的含量阈值比较、将含量值大于该含量阈值的相应的化合物为该中药的主要有效成份。采用该种基于数据库技术的确定中药主要有效成份的方法，能够快速准确的确定中药的主要有效成份，不仅灵活方便，而且工作性能稳定可靠，适用范围较为广泛，为后续的中药药理作用分析提供了较为准确可信的数据信息，并为中药研究的进一步发展奠定了坚实的基础。
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公开(公告)号：CN102507883A
公开(公告)日：2012-06-20
申请号：CN201110364010.X
申请日：2011-11-16
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: G01N33/15
Abstract: 本发明涉及一种基于生物过程预测药物新疗效的方法，以疾病为导向，基于生物过程谱的药物-疾病关联性来预测药物的潜在的新治疗功能，包括以下步骤：(1)构建疾病生物过程谱以及药物生物过程谱；(2)在生物过程谱层面上计算药物-疾病的关联性得分；(3)衡量关联性得分的显著性；(4)筛选有显著性的药物-疾病关系，用户可根据关联性得分排序结果，对药物的功能进行进一步的实验论证。还涉及上述方法在预测药物新疗效中的应用。本发明的预测方法设计巧妙，可以较为全面的评估药物-疾病的关系，对于寻找疾病新的治疗药物，药物潜在毒副作用发现，扩展现有药物的治疗功能空间以及“旧”药新用等有着重要的意义，适于大规模推广应用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN101776680A
公开(公告)日：2010-07-14
申请号：CN200810037654.6
申请日：2008-05-20
Applicant: 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所 , 华东理工大学 , 上海生物信息技术研究中心
IPC: G01N33/38 , C07K14/435 , C07K1/00 , A61K38/00 , A61K31/702 , A61K39/395 , A61P33/12
CPC classification number: Y02A50/423
Abstract: 本发明公开了一种筛选治疗和/或预防日本血吸虫感染药物的药物作用靶标，所述的靶标为含有日本血吸虫腺苷酸转运蛋白(SjANT)和二磷酸腺苷(ADP)相互作用的活性位点。本发明还公开了所述靶标的构建方法及其用途。
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公开(公告)号：CN102222177A
公开(公告)日：2011-10-19
申请号：CN201110191810.6
申请日：2011-07-08
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: G06F19/16
Abstract: 本发明涉及一种抗体蛋白的分子改造辅助预测方法，包括以下步骤：(1)扫描抗体与抗原相互作用界面的氨基酸残基；(2)对抗体与抗原相互作用界面上的氨基酸残基进行微环境判断；(3)确定候选改造位点，进行虚拟突变获得抗原与突变抗体复合物体系，计算结合自由能以及突变所造成的结合自由能改变；(4)根据步骤(3)的计算结果，按需求挑选可能对亲和力及特异性有较大影响的作为改造候选位点的氨基酸残基给出结果，从而指导实验。本发明设计巧妙独特，结合了抗体分子作用界面统计规律，能定性并定量的预测突变后抗体对抗原亲和力的改变，大大提高了预测准确度，适于大规模推广应用。
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公开(公告)号：CN101816648B
公开(公告)日：2013-10-02
申请号：CN200810037655.0
申请日：2008-05-20
Applicant: 华东理工大学 , 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所 , 上海生物信息技术研究中心
IPC: A61K31/403 , A61P33/12
CPC classification number: Y02A50/423
Abstract: 本发明公开了一类可以杀灭日本血吸虫的化合物，其结构如式I所示：其中，R1、R3、R4是氢键受体基团；R2是脂肪烃基团。
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公开(公告)号：CN101816648A
公开(公告)日：2010-09-01
申请号：CN200810037655.0
申请日：2008-05-20
Applicant: 华东理工大学 , 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所 , 上海生物信息技术研究中心
IPC: A61K31/403 , A61P33/12
CPC classification number: Y02A50/423
Abstract: 本发明公开了一类可以杀灭日本血吸虫的化合物，其结构如式I所示：其中，R1、R3、R4是氢键受体基团；R2是脂肪烃基团。
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公开(公告)号：CN101205555A
公开(公告)日：2008-06-25
申请号：CN200610147376.0
申请日：2006-12-18
Applicant: 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所 , 华东理工大学 , 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/25 , C12N9/00 , C40B30/04 , A61K31/427 , A61K31/422 , A61K31/4178 , A61K31/41 , C07D403/14 , C07D405/14 , C07D409/14 , A61P33/12
CPC classification number: Y02A50/423
Abstract: 本发明提供一种用于筛选治疗和/或预防日本血吸虫感染药物的药物作用靶标，所述靶标为同型二聚体，包含与嘌呤代谢的重要底物IMP相互作用的三维结构模型。本发明还提供所述药物作用靶标的构建方法，用所述药物作用靶标筛选治疗和/或预防日本血吸虫感染药物的方法，及通过体外抗血吸虫活性检测筛选确认抗日本血吸虫药物先导化合物的方法。
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