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公开(公告)号：CN111073986A
公开(公告)日：2020-04-28
申请号：CN202010017854.6
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/10 , C12N15/11 , C12R1/42
Abstract: 本发明公开了一种针对沙门氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增沙门氏菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在沙门氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
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公开(公告)号：CN106434890B
公开(公告)日：2020-02-21
申请号：CN201610767671.X
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测小肠结肠炎耶尔森氏菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增小肠结肠炎耶尔森氏菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在小肠结肠炎耶尔森氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
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公开(公告)号：CN108179186A
公开(公告)日：2018-06-19
申请号：CN201810236209.6
申请日：2018-03-21
Applicant: 上海市儿童医院 , 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于检测与川崎病相关基因及SNP位点的DNA探针池、其制备方法及用途。所述DNA探针池包含558个寡核苷酸探针序列，分别如SEQ ID NO：3～SEQ ID NO：560所示。每个所述寡核苷酸探针序列包括5’末端21bp的通用序列、120bp能与基因特异性结合的序列、3’末端21bp的通用序列，所述寡核苷酸探针序列的5‘末端21bp、3’末端21bp的通用序列分别如SEQ ID NO：1～SEQ ID NO：2所示。本发明的检测方法可降低检测成本，提高检测精确程度，能对川崎病发病机制、预后和药物疗效提供体外定性检测的手段，为降低川崎病后期引发冠状动脉损伤及其他心脏病提供有效的辅助诊断方法。
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公开(公告)号：CN106434890A
公开(公告)日：2017-02-22
申请号：CN201610767671.X
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测小肠结肠炎耶尔森氏菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增小肠结肠炎耶尔森氏菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在小肠结肠炎耶尔森氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
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公开(公告)号：CN106367499A
公开(公告)日：2017-02-01
申请号：CN201610780407.X
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测创伤弧菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增创伤弧菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在创伤弧菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN106367493A
公开(公告)日：2017-02-01
申请号：CN201610767608.6
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测沙门氏菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增沙门氏菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在沙门氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
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公开(公告)号：CN103589803B
公开(公告)日：2015-06-10
申请号：CN201310595973.X
申请日：2013-11-21
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种RNA和DNA双外参以及DNA内参实时定量荧光PCR检测方法，包括步骤：选定外参基因和内参基因；制备外参基因mRNA与DNA的预混合液；收集样品及预混合液的总mRNA和DNA；实时定量荧光PCR，检测外参基因和待测基因的mRNA和DNA拷贝数以及内参基因DNA拷贝数，从而同时得到基因的表观表达水平、DNA拷贝数相对量以及细胞水平相对表达量，为基因样本检测及机理研究提供了多层次信息。
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公开(公告)号：CN102507883B
公开(公告)日：2014-10-08
申请号：CN201110364010.X
申请日：2011-11-16
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: G01N33/15
Abstract: 本发明涉及一种基于生物过程预测药物新疗效的方法，以疾病为导向，基于生物过程谱的药物-疾病关联性来预测药物的潜在的新治疗功能，包括以下步骤：(1)构建疾病生物过程谱以及药物生物过程谱；(2)在生物过程谱层面上计算药物-疾病的关联性得分；(3)衡量关联性得分的显著性；(4)筛选有显著性的药物-疾病关系，用户可根据关联性得分排序结果，对药物的功能进行进一步的实验论证。还涉及上述方法在预测药物新疗效中的应用。本发明的预测方法设计巧妙，可以较为全面的评估药物-疾病的关系，对于寻找疾病新的治疗药物，药物潜在毒副作用发现，扩展现有药物的治疗功能空间以及“旧”药新用等有着重要的意义，适于大规模推广应用。
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公开(公告)号：CN101452503A
公开(公告)日：2009-06-10
申请号：CN200810203721.7
申请日：2008-11-28
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Inventor： 李作峰
Abstract: 本发明揭示一种异构临床医疗信息共享系统及方法，所述系统包括：术语集模块、文档模板生成模块、文档管理模块、存储临床数据的数据库；所述术语集模块、文档模板生成模块、文档管理模块、数据库依次连接。术语集模块，用于规范共享文档中所使用的术语；文档模板生成模块，用于定义标准临床数据文档的组成元素及个元素之间的关系并自动生成文档模板，收集管理元数据；文档管理模块，用于文档管理，用户通过该文档管理模块对医疗文档进行管理，进行录入、修改、查询操作、及文档的传输和共享。本发明通过临床数据字典、标准文档生成装置，实现标准临床文档的自动生成；最终通过映射，建立完善的临床文档数据库，对标准临床文档进行管理和共享。
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公开(公告)号：CN101441632A
公开(公告)日：2009-05-27
申请号：CN200710170730.6
申请日：2007-11-21
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明涉及一种基于数据库技术的确定中药主要有效成份的方法，包括根据中药名称在HICD数据库中查询中药条目记录信息、根据中药条目记录信息在HICD数据库中查询对应的中药成份记录信息、将中药成份记录信息中的化合物含量信息进行单位统一化处理、将处理后的化合物含量信息逐一与系统预设的含量阈值比较、将含量值大于该含量阈值的相应的化合物为该中药的主要有效成份。采用该种基于数据库技术的确定中药主要有效成份的方法，能够快速准确的确定中药的主要有效成份，不仅灵活方便，而且工作性能稳定可靠，适用范围较为广泛，为后续的中药药理作用分析提供了较为准确可信的数据信息，并为中药研究的进一步发展奠定了坚实的基础。
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