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公开(公告)号：CN115261495A
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202110486126.4
申请日：2021-04-30
Applicant: 上海旺旺食品集团有限公司 , 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种检测金黄色葡萄球菌的方法、检测系统及其应用。所述方法包括：识别金黄色葡萄球菌基因组序列中富含AT碱基的序列作为目标序列；针对目标序列自动化、高通量地设计特异性引物；设计特定的Tm值计算公式计算反应变性及退火温度，并据此设置核酸扩增反应条件；在模板局部解链的条件下进行核酸扩增反应。本发明靶向传统核酸扩增方法通常需要规避的富含AT碱基的序列，极大地拓宽候选靶标区域；通过基于海量基因组数据的特异性排查，以及针对富含AT区域的Tm值的精确计算，实现双链DNA的局部解链，降低核酸扩增技术中普遍非特异性扩增的可能性。该方法有效地拓展传统核酸扩增技术的应用范围，显著提升反应性能。
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公开(公告)号：CN111073987A
公开(公告)日：2020-04-28
申请号：CN202010017857.X
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/10 , C12N15/11 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种针对小肠结肠炎耶尔森氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增小肠结肠炎耶尔森氏菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在小肠结肠炎耶尔森氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
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公开(公告)号：CN111004856A
公开(公告)日：2020-04-14
申请号：CN202010018176.5
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/63
Abstract: 本发明公开了一种针对创伤弧菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增创伤弧菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在创伤弧菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
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公开(公告)号：CN111004854A
公开(公告)日：2020-04-14
申请号：CN202010003937.X
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种同时针对创伤弧菌和霍乱弧菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增创伤弧菌和霍乱弧菌共有特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在创伤弧菌和/或霍乱弧菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
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公开(公告)号：CN106434887A
公开(公告)日：2017-02-22
申请号：CN201610767557.7
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测金黄色葡萄球菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增金黄色葡萄球菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在金黄色葡萄球菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN101441686B
公开(公告)日：2011-01-12
申请号：CN200810203402.6
申请日：2008-11-26
Applicant: 复旦大学附属中山医院 , 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明提供了一种将自然语言书写的医疗文档自动进行格式化和统一化的装置包括：基于国内医院所使用的电子病历系统的以自然语言编写的医疗文档；以疾病类型为分类的中文医疗标准词词库；基于自然语言分析的数据抽提系统，用于将自然语言编写的文档转化为标准的格式化文档；按病种分类的用于临床科研的数据库；用于将格式化文档自动转化为统一格式的标准化文档的文档转换系统；用于保护患者以及相关治疗医生的隐私信息的权限系统。本发明实现了医疗信息管理的自动化，方便医生快速得查找到某种疾病的有关信息，节省了大量时间，使得医生有更多精力投入到对疾病的研究。
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公开(公告)号：CN101441686A
公开(公告)日：2009-05-27
申请号：CN200810203402.6
申请日：2008-11-26
Applicant: 复旦大学附属中山医院 , 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明提供了一种将自然语言书写的医疗文档自动进行格式化和统一化的装置包括：基于国内医院所使用的电子病历系统的以自然语言编写的医疗文档；以疾病类型为分类的中文医疗标准词词库；基于自然语言分析的数据抽提系统，用于将自然语言编写的文档转化为标准的格式化文档；按病种分类的用于临床科研的数据库；用于将格式化文档自动转化为统一格式的标准化文档的文档转换系统；用于保护患者以及相关治疗医生的隐私信息的权限系统。本发明实现了医疗信息管理的自动化，方便医生快速得查找到某种疾病的有关信息，节省了大量时间，使得医生有更多精力投入到对疾病的研究。
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公开(公告)号：CN101441682A
公开(公告)日：2009-05-27
申请号：CN200710170732.5
申请日：2007-11-21
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明提供了一种中药药效物质机理的生物信息分析平台及其分析方法，包括中药活性成分及含量数据库模块，INVDOCK软件包模块和网络数据库模块，网络数据库模块包括人类蛋白相互作用数据库、代谢数据库、和信号转导数据库、治疗性药靶数据库、药物副作用靶点数据库和药物吸收分布代谢排出数据库，还提供了一种采用该生物信息分析平台分析中药药效物质机理的方法，该生物信息分析平台能全面分析中药药效物质的药理机制，具有准确、高效的特点，为中药药理研究提供指导，可以大大加快中药药理研究，加速开发新型中药。
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公开(公告)号：CN115261494A
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202110486116.0
申请日：2021-04-30
Applicant: 上海旺旺食品集团有限公司 , 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种检测小肠结肠炎耶尔森菌的系统、方法及其应用。所述方法包括：识别小肠结肠炎耶尔森菌基因组序列中富含AT碱基的序列作为目标序列；针对目标序列自动化、高通量地设计特异性引物；设计特定的Tm值计算公式计算反应变性及退火温度，并据此设置核酸扩增反应条件；在模板局部解链的条件下进行核酸扩增反应。本发明靶向传统核酸扩增方法通常需要规避的富含AT碱基的序列，极大地拓宽候选靶标区域；通过基于海量基因组数据的特异性排查，以及针对富含AT区域的Tm值的精确计算，实现双链DNA的局部解链，大大降低了核酸扩增技术中非特异性扩增的可能性。该方法有效地拓展了传统核酸扩增技术的应用范围，显著提升了反应性能。
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公开(公告)号：CN101864493B
公开(公告)日：2012-11-28
申请号：CN200910049555.4
申请日：2009-04-17
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种用于检测人乳头瘤病毒的检测试剂盒，包括人乳头瘤病毒测序引物溶液。本发明还公开了上述用于检测高危型人乳头瘤病毒的试剂盒的制备方法和使用方法。本发明的试剂盒可以确定待测样本中是否包含HPV病毒，以及具体病毒亚型。同时通过在待测DNA样本加上用来区分样本来源的身份标签，即可满足一次检测多人的高通量临检要求。本发明的试剂盒超过传统的检测手段，序列差异定位到碱基水平，检测更灵敏准确，同时也规避了假阳性污染的可能。
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