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公开(公告)号：CN106434890B
公开(公告)日：2020-02-21
申请号：CN201610767671.X
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测小肠结肠炎耶尔森氏菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增小肠结肠炎耶尔森氏菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在小肠结肠炎耶尔森氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN106434890A
公开(公告)日：2017-02-22
申请号：CN201610767671.X
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测小肠结肠炎耶尔森氏菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增小肠结肠炎耶尔森氏菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在小肠结肠炎耶尔森氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
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公开(公告)号：CN115261495A
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202110486126.4
申请日：2021-04-30
Applicant: 上海旺旺食品集团有限公司 , 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种检测金黄色葡萄球菌的方法、检测系统及其应用。所述方法包括：识别金黄色葡萄球菌基因组序列中富含AT碱基的序列作为目标序列；针对目标序列自动化、高通量地设计特异性引物；设计特定的Tm值计算公式计算反应变性及退火温度，并据此设置核酸扩增反应条件；在模板局部解链的条件下进行核酸扩增反应。本发明靶向传统核酸扩增方法通常需要规避的富含AT碱基的序列，极大地拓宽候选靶标区域；通过基于海量基因组数据的特异性排查，以及针对富含AT区域的Tm值的精确计算，实现双链DNA的局部解链，降低核酸扩增技术中普遍非特异性扩增的可能性。该方法有效地拓展传统核酸扩增技术的应用范围，显著提升反应性能。
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公开(公告)号：CN111073987A
公开(公告)日：2020-04-28
申请号：CN202010017857.X
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/10 , C12N15/11 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种针对小肠结肠炎耶尔森氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增小肠结肠炎耶尔森氏菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在小肠结肠炎耶尔森氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
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公开(公告)号：CN115261493A
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202110486075.5
申请日：2021-04-30
Applicant: 上海旺旺食品集团有限公司 , 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种检测阪崎克罗诺杆菌的方法及其应用。所述方法包括：识别阪崎克罗诺杆菌基因组序列中富含AT碱基的序列作为目标序列；针对目标序列自动化、高通量地设计特异性引物；设计特定的Tm值计算公式计算反应变性及退火温度，并据此设置核酸扩增反应条件；在模板局部解链的条件下进行核酸扩增反应。本发明靶向传统核酸扩增方法通常需要规避的富含AT碱基的序列，极大地拓宽候选靶标区域；通过基于海量基因组数据的特异性排查，以及针对富含AT区域的Tm值的精确计算，实现双链DNA的局部解链，降低核酸扩增技术中非特异性扩增的可能性。该方法有效拓展传统核酸扩增技术的应用范围，同时在引物设计通量、反应特异性等显著提升反应性能。
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公开(公告)号：CN115261494A
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202110486116.0
申请日：2021-04-30
Applicant: 上海旺旺食品集团有限公司 , 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种检测小肠结肠炎耶尔森菌的系统、方法及其应用。所述方法包括：识别小肠结肠炎耶尔森菌基因组序列中富含AT碱基的序列作为目标序列；针对目标序列自动化、高通量地设计特异性引物；设计特定的Tm值计算公式计算反应变性及退火温度，并据此设置核酸扩增反应条件；在模板局部解链的条件下进行核酸扩增反应。本发明靶向传统核酸扩增方法通常需要规避的富含AT碱基的序列，极大地拓宽候选靶标区域；通过基于海量基因组数据的特异性排查，以及针对富含AT区域的Tm值的精确计算，实现双链DNA的局部解链，大大降低了核酸扩增技术中非特异性扩增的可能性。该方法有效地拓展了传统核酸扩增技术的应用范围，显著提升了反应性能。
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