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公开(公告)号:CN115261495A
公开(公告)日:2022-11-01
申请号:CN202110486126.4
申请日:2021-04-30
Applicant: 上海旺旺食品集团有限公司 , 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种检测金黄色葡萄球菌的方法、检测系统及其应用。所述方法包括:识别金黄色葡萄球菌基因组序列中富含AT碱基的序列作为目标序列;针对目标序列自动化、高通量地设计特异性引物;设计特定的Tm值计算公式计算反应变性及退火温度,并据此设置核酸扩增反应条件;在模板局部解链的条件下进行核酸扩增反应。本发明靶向传统核酸扩增方法通常需要规避的富含AT碱基的序列,极大地拓宽候选靶标区域;通过基于海量基因组数据的特异性排查,以及针对富含AT区域的Tm值的精确计算,实现双链DNA的局部解链,降低核酸扩增技术中普遍非特异性扩增的可能性。该方法有效地拓展传统核酸扩增技术的应用范围,显著提升反应性能。
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公开(公告)号:CN111073987A
公开(公告)日:2020-04-28
申请号:CN202010017857.X
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/10 , C12N15/11 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种针对小肠结肠炎耶尔森氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增小肠结肠炎耶尔森氏菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在小肠结肠炎耶尔森氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN111004856A
公开(公告)日:2020-04-14
申请号:CN202010018176.5
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/63
Abstract: 本发明公开了一种针对创伤弧菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增创伤弧菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在创伤弧菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN111004854A
公开(公告)日:2020-04-14
申请号:CN202010003937.X
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种同时针对创伤弧菌和霍乱弧菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增创伤弧菌和霍乱弧菌共有特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在创伤弧菌和/或霍乱弧菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN106434887A
公开(公告)日:2017-02-22
申请号:CN201610767557.7
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测金黄色葡萄球菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增金黄色葡萄球菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在金黄色葡萄球菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN103571964A
公开(公告)日:2014-02-12
申请号:CN201310594531.3
申请日:2013-11-21
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6851 , C12Q2531/113 , C12Q2545/113 , C12Q2537/16
Abstract: 本发明公开了一种基于RNA和DNA双外参实时定量荧光PCR策略的基因表达校准值的检测方法,包括:选定外参基因;配制外参基因的RNA与DNA的预混合液;样品中加入预混合液,收集样品RNA和DNA;实时定量荧光PCR,检测待测基因和内参基因RNA拷贝数、内参基因DNA拷贝数以及外参基因RNA和DNA拷贝数,计算得到内参基因的表观表达水平后,再根据公式得到待测基因的表达校准值。本发明还公开了上述方法在PCR array以及表达谱芯片检测分析技术中的应用。本发明将基因的表观表达水平概念和检测方法与传统表达检测体系相结合,以更少的检测反应、更低廉的成本实现更精确的基因表达水平检测,修正由内参基因真实表达水平在不同样本间不恒定所造成的检测结果的不准确。
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公开(公告)号:CN111073985A
公开(公告)日:2020-04-28
申请号:CN202010017846.1
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/10 , C12N15/11 , C12N15/63
Abstract: 本发明公开了一种针对沙门氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增沙门氏菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在沙门氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN106367501B
公开(公告)日:2020-02-21
申请号:CN201610780485.X
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/42
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测沙门氏菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增沙门氏菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在沙门氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN106434900B
公开(公告)日:2020-02-14
申请号:CN201610780489.8
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/63
Abstract: 本发明公开了一种同时快速恒温检测创伤弧菌和霍乱弧菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增创伤弧菌和霍乱弧菌共有特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在创伤弧菌和/或霍乱弧菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN106434900A
公开(公告)日:2017-02-22
申请号:CN201610780489.8
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种同时快速恒温检测创伤弧菌和霍乱弧菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增创伤弧菌和霍乱弧菌共有特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在创伤弧菌和/或霍乱弧菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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