一种寡核苷酸色谱保留时间预测方法

    公开(公告)号:CN101846658A

    公开(公告)日:2010-09-29

    申请号:CN200910191822.1

    申请日:2009-12-08

    Applicant: 重庆大学

    Abstract: 本发明公开了一种寡核苷酸色谱保留时间预测方法,包括如下步骤:a)基于主成分分析方法,建立核酸序列结构表征方法-碱基三维性质得分;b)用碱基三维性质得分表征寡核苷酸的结构;c)用自交叉协方差方法对每个寡核苷酸的表征变量做归一化处理;d)用遗传算法挑选与寡核苷酸的色谱保留指数密切相关的性质参数;e)应用径向基核支持向量机建立寡核苷酸色谱保留时间预测模型,分别以自取代检验,留一法交互检验以及外部检验三种方法验证模型的预测能力。该方法可用于寡核苷酸色谱保留时间预测,寡核苷酸定量结构保留关系分析,优化选择合适的色谱实验条件以及参数。

    一种蛋白质与RNA相互作用位点计算识别方法

    公开(公告)号:CN101710364A

    公开(公告)日:2010-05-19

    申请号:CN200910191887.6

    申请日:2009-12-14

    Applicant: 重庆大学

    Abstract: 本发明公开了一种蛋白质与RNA相互作用位点计算识别方法,包括如下步骤:a)基于主成分分析方法,建立蛋白质结构表征方法-氨基酸二维性质得分;b)用氨基酸二维性质得分表征蛋白质与RNA相互作用位点的结构特征;c)用遗传算法挑选同蛋白质与RNA相互作用位点密切相关的特征参数;d)应用径向基核支持向量机建立蛋白质与RNA相互作用位点识别模型,分别以自取代检验,留1/5法交互检验以及外部检验三种方法验证模型的预测能力。该方法可用于蛋白质与RNA相互作用位点预测及特异性分析,对于深入理解基因表达调节、蛋白质合成及许多病毒复制与装配等过程至关重要。

    一种人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析方法

    公开(公告)号:CN100583112C

    公开(公告)日:2010-01-20

    申请号:CN200810069934.5

    申请日:2008-07-07

    Applicant: 重庆大学

    Abstract: 本发明公开了一种人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析方法,能够用于人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析,进而设计更易裂解的肽样本,进一步开发有效的人免疫缺陷病毒蛋白酶抑制剂,包括如下步骤:a)基于主成分分析方法,建立氨基酸多维信息得分矢量;b)应用氨基酸多维信息得分矢量对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的结构进行表征;c)用逐步方法挑选与肽裂解密切相关的性质参数;d)应用线性判别分析方法建立裂解位点预测及特异性分析模型;e)分别以自取代检验,留一法交互检验以及外部检验三种方法验证模型的预测能力;f)对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的各位点的性质参数进行方差分析。

    一种功能多肽苦味预测方法

    公开(公告)号:CN110970098A

    公开(公告)日:2020-04-07

    申请号:CN201911174720.9

    申请日:2019-11-26

    Applicant: 重庆大学

    Abstract: 本发明公开了一种功能多肽的苦味预测方法,包括如下步骤:采用局部与整体组合策略表征功功能多肽与苦味相关的序列-结构-动力学特征,包括二维信息,三维结构信息,动力学特征,环境参数,共20种参数作为模型的输入变量,应用长短时记忆神经网络建立功能多肽苦味预测模型,以五折交互检验评价模型的内部预测能力,以测试集检验评价模型的外部预测能力。该方法可用于功能多肽的苦味预测,进行功能多肽的结构-苦味关系分析,协助优化选择合适的掩盖或者消除功能多肽苦味的实验条件与参数。

    一种抗黑色素瘤的化合物及其应用

    公开(公告)号:CN106366080A

    公开(公告)日:2017-02-01

    申请号:CN201510447483.4

    申请日:2015-07-21

    Applicant: 重庆大学

    CPC classification number: C07D417/04

    Abstract: 本发明公开了一种抗黑色素瘤的化合物,其名称为N-(3-(5-(2-amino-5-hydroxypyrimidin-4-yl)-2-tert-butylthiazol-4-yl)-2-fluoro-5-hydroxyphenyl)-2,6-difluoro-4-hydroxybenzenesulfonamide,结构式如式I。本化合物是天然产物中提取而来,并用黑色素瘤细胞株和免疫缺陷型SCID小鼠肿瘤移植模型予以评价。体内体外试验表明,该化合物即能显著抑制各黑色素瘤细胞株的生长,又能有效抑制小鼠体内人源黑色素瘤细胞的生长。因其安全、高效、理想的抗癌效果,可尝试开发为抗黑色素瘤的新型治疗药物,具有重要的开发和应用价值。

    一种抑制肠癌转移的化合物及其应用

    公开(公告)号:CN106146461A

    公开(公告)日:2016-11-23

    申请号:CN201510146126.4

    申请日:2015-03-24

    Applicant: 重庆大学

    CPC classification number: C07D401/12

    Abstract: 本发明公开了一种抑制肠癌转移的化合物,其名称为6-(4-amino-5-hydroxy-2-methylquinolin-6-ylamino)-2-(5-(diethylamino)pentan-2-yl amino)-4-methylpyrimidin-5(4H)-one trihydrochloride,结构式如下式I。本化合物是天然产物中提取而来,并用肠癌细胞株和免疫缺陷型小鼠肿瘤转移模型予以评价。体内体外试验表明,该化合物能有效抑制肠癌细胞株的转移,并显著抑制小鼠体内肠癌细胞的肝转移。因其安全、高效、理想的抗癌效果,可尝试开发为抗转移性肠癌的新型治疗药物,具有重要的开发和应用价值。

    一种具有抗乳腺癌活性的化合物及其应用

    公开(公告)号:CN106146336A

    公开(公告)日:2016-11-23

    申请号:CN201510146090.X

    申请日:2015-03-24

    Applicant: 重庆大学

    Abstract: 本发明公开了一种具有抗乳腺癌活性的化合物,其名称为methyl2-(4-fluoro-2-hydroxybenzamido)benzoate,结构式如I。本化合物是小分子化学物库经体外培养的肿瘤细胞中筛选得到,并进一步用肿瘤裸小鼠移植瘤模型予以评价。体内体外试验表明,该化合物对乳腺癌细胞的生长和增殖有很强的抑制作用,并能在较低浓度下杀死肿瘤细胞,而对正常乳腺细胞的生长和存活无影响。因其安全、高效、理想的抗癌效果,可尝试开发为抗乳腺癌的新型治疗药物,具有良好的应用前景。

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