-
公开(公告)号：CN100583112C
公开(公告)日：2010-01-20
申请号：CN200810069934.5
申请日：2008-07-07
Applicant: 重庆大学
IPC: G06F19/00
Abstract: 本发明公开了一种人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析方法，能够用于人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析，进而设计更易裂解的肽样本，进一步开发有效的人免疫缺陷病毒蛋白酶抑制剂，包括如下步骤：a)基于主成分分析方法，建立氨基酸多维信息得分矢量；b)应用氨基酸多维信息得分矢量对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的结构进行表征；c)用逐步方法挑选与肽裂解密切相关的性质参数；d)应用线性判别分析方法建立裂解位点预测及特异性分析模型；e)分别以自取代检验，留一法交互检验以及外部检验三种方法验证模型的预测能力；f)对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的各位点的性质参数进行方差分析。
-
公开(公告)号：CN101350040A
公开(公告)日：2009-01-21
申请号：CN200810070173.5
申请日：2008-08-25
Applicant: 重庆大学
IPC: G06F19/00
Abstract: 本发明属于分子定量结构－性质/活性关系研究方法领域。本发明公开一种新颖分子结构表征方法的设计及应用，包括如下步骤：a)定义原子类型，将原子按其所处周期表的主族分为5类，再把不同主族中的原子按其杂化状态细分为10类；b)将原子相对碳原子的鲍林电负性大小定义为原子相对电负性；c)将连接两原子最短路径中所有化学键相对键长之和定义为原子相对键长；d)根据库仑定律计算10类原子间的相互作用，从而定义分子电性杂化作用矢量。本发明的分子结构表征方法具有物化意义明确、结构表征能力强、操作简便及拓展性能好的优点，用于多类分子的定量构谱关系研究获得了成功，也可以用于相关领域的分子结构－性质/活性关系研究等。
-
公开(公告)号：CN101343779A
公开(公告)日：2009-01-14
申请号：CN200810070171.6
申请日：2008-08-25
Applicant: 重庆大学
Abstract: 本发明属于药物分子设计研究领域。本发明公开一种新颖流感病毒神经氨酸酶抑制剂三维定量构效关系研究方法，包括如下步骤：a)将原子按族和杂化状态分类，从分子立体结构的原子相对距离和原子自身性质出发，经计算药物分子内部不同类型原子之间的静电、立体和疏水性质得三维原子场全息作用矢量；b)应用三维全息原子场作用矢量对酰基硫脲类似物的结构进行表征；c)用逐步回归技术挑选与酰基硫脲类似物活性密切相关的结构特征；d)用偏最小二乘法建立酰基硫脲类似物构效关系模型。该方法可以用于酰基硫脲类似物活性预测，分析其构效关系，设计针对流感病毒神经氨酸酶具有特定抑制活性的酰基硫脲类似物新品种提供依据。
-
公开(公告)号：CN101320405A
公开(公告)日：2008-12-10
申请号：CN200810069934.5
申请日：2008-07-07
Applicant: 重庆大学
IPC: G06F19/00
Abstract: 本发明公开了一种人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析方法，能够用于人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析，进而设计更易裂解的肽样本，进一步开发有效的人免疫缺陷病毒蛋白酶抑制剂，包括如下步骤：a)基于主成分分析方法，建立氨基酸0D－3D信息得分矢量；b)应用氨基酸0D－3D信息得分矢量对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的结构进行表征；c)用逐步方法挑选与肽裂解密切相关的性质参数；d)应用线性判别分析方法建立裂解位点预测及特异性分析模型；e)分别以自取代检验，留一法交互检验以及外部检验三种方法验证模型的预测能力；f)对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的各位点的性质参数进行方差分析。
-
公开(公告)号：CN101307359A
公开(公告)日：2008-11-19
申请号：CN200810069941.5
申请日：2008-07-08
Applicant: 重庆大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种人类基因启动子识别方法，能够用于人类基因启动子区域的确定及其结构功能的诠释，可用于发现新的未知基因，包括如下步骤：a)基于主成分分析方法，建立碱基广义性质得分表征体系；b)应用碱基广义性质得分对人类基因启动子和非启动子的结构进行表征；c)用自交叉协方差方法对每个启动子和非启动子的表征变量做归一化处理；d)用径向基核支持向量机建立人类基因启动子识别模型。
-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN100999452B
公开(公告)日：2010-06-02
申请号：CN200710078105.9
申请日：2007-01-08
Applicant: 重庆大学
Abstract: 本发明涉及一种新的合成赛曲司特的方法，包括：1.以环庚酮为起始原料，与苯基格氏试剂发生格氏反应生成1-苯基环庚醇(II)；2.将1-苯基环庚醇(II)在脱水剂中脱水，生成1-苯基环庚烯(III)；3将1-苯基环庚烯(III)用氧化剂氧化，在烯键处发生开环断链，生成6-苯甲酰基己酸(IV)；4将6-苯甲酰基己酸(IV)用还原剂进行选择性还原，生成7-羟基-7-苯基庚酸(V)；5将生成的7羟基7-苯基庚酸(V)与三甲基氢醌在缩合剂作用下缩合反应，然后经三氯化铁处理后生成赛曲斯特(I)。上述各步反应均较易进行，各步收率好，均为90％～95％，总收率58％～78％。该方法工艺路线短，条件温和、各步收率好、易实施。
-
公开(公告)号：CN101344900A
公开(公告)日：2009-01-14
申请号：CN200810070172.0
申请日：2008-08-25
Applicant: 重庆大学
IPC: G06F19/00
Abstract: 本发明公开了一种新颖碱基和核苷及其衍生物的NMR氢谱化学位移预测方法，包括如下步骤：a)从分子二维拓扑结构出发，根据原子之间相互作用方式和自身所处状态得到用于描述原子所处分子微观化学环境和杂化状态的原子电性作用矢量和原子杂化状态指数；b)应用原子电性作用矢量和原子杂化状态指数对碱基、核苷及其衍生物的结构进行表征；c)用多元线性回归技术建立NMR氢谱化学位移预测模型，并采用留一法和留分子法交互校验评价模型的稳定性和预测能力。该发明方法具有预测能力强、简单方便、拓展性能好的优点，能够用于碱基和核苷及其衍生物NMR氢谱化学位移预测，以便于化合物的结构解析。
-
公开(公告)号：CN101303343A
公开(公告)日：2008-11-12
申请号：CN200810069918.6
申请日：2008-07-02
Applicant: 重庆大学
IPC: G01N33/48
Abstract: 本发明公开了一种基于氨基酸广义信息因子分析标度的抗原肽定量结构－亲和性关系分析方法，能够用于对抗原肽的亲和性预测，为设计具有特定亲和性抗原肽新品种提供参考，包括如下步骤：a)基于因子分析方法，建立氨基酸广义信息因子分析标度；b)应用氨基酸广义信息因子分析标度对抗原肽的结构进行表征；c)用遗传算法－偏最小二乘方法挑选与抗原肽活性密切相关的结构特征；d)用偏最小二乘法建立抗原肽定量结构－亲和性关系分析模型；e)对抗原肽各位点的性质参数进行方差分析。
-
公开(公告)号：CN100999452A
公开(公告)日：2007-07-18
申请号：CN200710078105.9
申请日：2007-01-08
Applicant: 重庆大学
Abstract: 本发明涉及一种新的合成赛曲司特的方法，包括：1.以环庚酮为起始原料，与苯基格氏试剂发生格氏反应生成1－苯基环庚醇(II)；2.将1－苯基环庚醇(II)在脱水剂中脱水，生成1－苯基环庚烯(III)；3.将1－苯基环庚烯(III)用氧化剂氧化，在烯键处发生开环断链，生成6－苯甲酰基己酸(IV)；4.将6－苯甲酰基己酸(IV)用还原剂进行选择性还原，生成7－羟基－7－苯基庚酸(V)；5.将生成的7－羟基－7－苯基庚酸(V)与三甲基氢醌在缩合剂作用下缩合反应，然后经三氯化铁处理后生成赛曲斯特(I)。上述各步反应均较易进行，各步收率好，均为90％～95％，总收率58％～78％。该方法工艺路线短，条件温和、各步收率好、易实施。
-
公开(公告)号：CN101308526B
公开(公告)日：2010-06-09
申请号：CN200810069933.0
申请日：2008-07-07
Applicant: 重庆大学
IPC: G06F19/00
Abstract: 本发明公开了一种高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别方法，能够用于高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别，可为理解高致病性禽流感病毒血凝素蛋白的结构特征提供参考，通过对血凝素蛋白的识别，从而可以间接地判别其所属的禽流感病毒株的致病性高低，包括如下步骤：a)基于主成分分析方法，建立氨基酸全息拓扑结构得分矢量；b)应用氨基酸全息拓扑结构得分矢量对流感病毒血凝素蛋白的结构进行表征；c)用自交叉协方差方法对每个流感病毒血凝素蛋白的表征变量做归一化处理；d)用径向基核支持向量机建立禽流感病毒血凝素蛋白识别模型；e)用径向基核支持向量机建立高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别模型。
-
-
-
-
-
-
-
-
-
Search Results
12
records
(took 0.018 seconds)
