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公开(公告)号:CN107400720A
公开(公告)日:2017-11-28
申请号:CN201710808013.5
申请日:2017-09-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种KLF3基因CNV标记辅助检测黄牛生长性状的方法及其专用试剂盒。基于实时荧光定量PCR技术,以黄牛基因组DNA为模板,扩增黄牛KLF3基因的拷贝数变异区域,并扩增牛通用转录因子BTF3基因作为内参,最后利用2-ΔΔCt方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立牛KLF3基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单,快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN111647649B
公开(公告)日:2023-08-18
申请号:CN202010612786.8
申请日:2020-06-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种基于CCDC39基因CNV检测辅助选择黄牛生长性状的方法:以黄牛基因组DNA为模板进行实时荧光定量PCR,利用一对特异性引物扩增CCDC39基因的拷贝数变异区域的部分片段,同时利用另外一对特异性引物扩增BTF3基因部分片段作为参考,根据2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。与黄牛生长数据的关联分析显示,所检测的CCDC39基因拷贝数变异对黄牛的体重有显著影响,其中缺失型个体的体重显著高于正常型和多拷贝型个体。本发明提供的方法有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作的进行。
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公开(公告)号:CN111088327B
公开(公告)日:2022-09-13
申请号:CN202010006023.9
申请日:2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种SIKE1基因CNV标记辅助检测黄牛体尺性状的方法及其应用:以黄牛血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增SIKE1基因CNV区域和内参基因BTF3的部分片段,根据定量结果并通过计算log22‑ΔΔCt鉴定个体SIKE1基因的拷贝数变异类型。基于SIKE1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,本发明提供的方法可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群,有利于加快云岭牛等的分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN107400720B
公开(公告)日:2020-04-21
申请号:CN201710808013.5
申请日:2017-09-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种KLF3基因CNV标记辅助检测黄牛生长性状的方法及其专用试剂盒。基于实时荧光定量PCR技术,以黄牛基因组DNA为模板,扩增黄牛KLF3基因的拷贝数变异区域,并扩增牛通用转录因子BTF3基因作为内参,最后利用2‑ΔΔCt方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立牛KLF3基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单,快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110964838A
公开(公告)日:2020-04-07
申请号:CN202010006026.2
申请日:2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种快速检测绵羊LRRFIP1基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以绵羊血样全基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩增绵羊LRRFIP1基因的拷贝数变异区域的部分片段,利用另外一对特异性引物扩增绵羊ANKRD1基因部分片段作为对照,然后利用2*2-ΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,基于绵羊LRRFIP1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,本发明提供的方法可用于快速建立茶卡羊等地方绵羊品种的遗传资源优势种群,有利于加快茶卡羊等的分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110760597A
公开(公告)日:2020-02-07
申请号:CN201911159100.8
申请日:2019-11-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛NCSTN基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以云岭牛基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增牛NCSTN基因的拷贝数变异区域部分片段,同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛BTF3基因部分片段作为内参对照,最后利用-ΔΔCt计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立云岭牛NCSTN基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN113151501B
公开(公告)日:2023-08-08
申请号:CN202110513334.9
申请日:2021-05-11
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor: 黄永震 , 张家强 , 刘贤 , 张子敬 , 柴亚楠 , 李欣淼 , 杜蕾 , 李利娟 , 杨国杰 , 李志明 , 吕世杰 , 陈付英 , 施巧婷 , 王二耀 , 胡沈荣 , 茹宝瑞 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛WBP1L基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以黄牛个体基因组DNA为模板,以一对特异性引物扩增WBP1L基因拷贝数变异区域的部分片段,以另外一对特异性引物扩增BTF3基因的部分片段作为内参,最后利用‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于WBP1L基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,可用于快速建立遗传资源优势种群,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110592235B
公开(公告)日:2022-08-23
申请号:CN201910945253.9
申请日:2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测奶牛USP16基因CNV标记的方法及其应用:利用实时定量PCR技术,以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板,分别用引物对P1、P2扩增牛USP16基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域,最后利用2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记,可加快奶牛优良产乳性能的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN109943647B
公开(公告)日:2022-08-16
申请号:CN201910354837.9
申请日:2019-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛MLLT10基因CNV标记的方法及其应用,基于实时荧光定量PCR技术,以黄牛基因组DNA为模板,利用特异性PCR引物扩增黄牛MLLT10基因拷贝数变异区,并扩增黄牛BTF3基因部分片段作为内参,最后利用2‑ΔΔCt方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立黄牛MLLT10基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,检测方法简单、快速,可用于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110964838B
公开(公告)日:2022-07-22
申请号:CN202010006026.2
申请日:2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种快速检测绵羊LRRFIP1基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以绵羊血样全基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩增绵羊LRRFIP1基因的拷贝数变异区域的部分片段,利用另外一对特异性引物扩增绵羊ANKRD1基因部分片段作为对照,然后利用2*2‑ΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,基于绵羊LRRFIP1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,本发明提供的方法可用于快速建立茶卡羊等地方绵羊品种的遗传资源优势种群,有利于加快茶卡羊等的分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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