一种基于通道内生成DNA纳米花的miRNA检测装置

    公开(公告)号:CN110470712A

    公开(公告)日:2019-11-19

    申请号:CN201810453521.0

    申请日:2018-05-09

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种用于检测miRNA的装置原理、即检测条件、最优条件及其应用,其中原理为:在铂片上面放阳极氧化铝薄膜PAA,PAA膜的上面放一个聚缘垫片防止溶液泄露,垫片上面形成一个圆形的电解池,在电解池中,将铂电极作为对电极,甘汞电极作为参比电极,铂片作为工作电极,形成三电极体系,在PAA孔道中修饰与miRNA互补的ssDNA,靶标的下面部分可以与之互补,再加入事先合成好的含有互补的发夹结构(带有primer)的DNA滚环链c-DNA,然后加入DNA聚合酶便可实现滚环扩增,形成DNA纳米花,从而使通道的空间位阻减少,而在电解池中的[Fe(CN)6]3-离子流入工作电极的速率变小,电流减小。根据电流的变化量来表征miRNA的浓度,用来检测肿瘤标注物miR-21。

    一种基于阳极氧化铝膜表面修饰的适配体结合刺突蛋白的SARS-CoV-2检测方法

    公开(公告)号:CN116008537A

    公开(公告)日:2023-04-25

    申请号:CN202111237400.0

    申请日:2021-10-22

    Applicant: 南京大学

    Inventor: 李根喜 石榴 王琳

    Abstract: 本发明公开了一种基于阳极氧化铝膜表面修饰的适配体结合刺突蛋白的SARS‑CoV‑2检测方法,为新型冠状病毒检测开辟了一个新的途径。利用阳极氧化铝材料为基础构建电流传输通道,表面氨基的活化可实现通道的功能化,修饰有醛基的S1核酸适配体可通过席夫碱反应桥联到电流通道的表面;靶标蛋白的引入改变通道内的空间位阻及通道表面的电荷性质,利用电流的变化实现对S1蛋白的生物传感。将电化学的检测灵敏性与阳极氧化铝材料的广域响应性结合,制备快速灵敏的电化学传感器,以用来特异性捕获和检测SARS‑CoV‑2刺突蛋白S1。与其他分析方法相比,该方法无需扩增,可以一步完成,具有响应快、成本低的优点,满足了检测群体广泛的迫切要求。实验结果显示该方法可成功检测SARS‑CoV‑2刺突蛋白S1,检测下限为1fM,且该方法成功用于临床样本检测,SARS‑CoV‑2患者组与正常人组临床样本分析存在显著差异。

    一种用于凋亡信号通路原位成像的一体式DNA纳米元件及其制备方法

    公开(公告)号:CN111004837B

    公开(公告)日:2022-12-06

    申请号:CN201910909652.X

    申请日:2019-09-24

    Applicant: 南京大学

    Inventor: 李根喜 石海

    Abstract: 本发明公开了一种用于细胞凋亡信号通路有效成像的DNA纳米器件的设计原理、最优条件及其成像应用。虽然许多细胞凋亡信号通路已由经典的分子生物学技术所揭示,但细胞凋亡相关研究仍然迫切需要研发具有可操作性和高效率的技术和方法。为此,我们设计了一种DNA纳米器件,它是通过在金纳米颗粒表面组装一层Y型DNA结构所构建而成。只有包含了上游的锰超氧化物歧化酶信使RNA和下游的细胞色素c的凋亡信号通路作为输入时,DNA纳米器件才能执行“与”逻辑门操作,使Y型DNA从金纳米颗粒表面去组装,输出荧光信号。与靶向单个信号分子的分析方法相比,本发明中的DNA纳米器件同时表征上下游两个相关的信号分子,可以实现对细胞凋亡的信号通路直接的原位分析。

    一种基于锆金属-有机框架的电化学传感器的制备方法及其应用

    公开(公告)号:CN112557473B

    公开(公告)日:2021-10-22

    申请号:CN201910914389.3

    申请日:2019-09-25

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明涉及了一种基于锆金属‑有机框架的电化学传感器的制备方法及其应用恶性胶质瘤是脑内最致命的肿瘤之一,由于致癌原因的复杂性以及血脑屏障的阻碍,早期诊断在技术上仍具有挑战性。恶性胶质瘤分泌的特异性外泌体可以穿过血脑屏障并在体液中循环,具有无创性早期诊断的潜力。因此,我们提出了一种基于锆金属有机骨架(Zr‑MOF)的新型无标记电化学生物传感器。在该方法中,设计的多肽链能够特异性地捕获恶性胶质瘤外泌体中高表达的人表皮生长因子受体(EGFR)和EGFR变异株(v)III突变株(EGFRvIII)。同时,以亚甲基蓝(MB)包裹的Zr‑MOF(MB@Zr‑MOF)作为化学选择标记,通过与外泌体磷脂双分子层膜外的磷酸基团相互作用,产生敏感的电化学信号。通过监测Z‑MOF内的电活性分子,可以定量检测外泌体的浓度,表现出广阔的临床诊断应用价值。

    一种circRNA驱动的基于长链DNA支架的DNA纳米带的制备方法及其肿瘤应用

    公开(公告)号:CN111549104A

    公开(公告)日:2020-08-18

    申请号:CN202010439342.9

    申请日:2020-05-22

    Applicant: 南京大学

    Inventor: 项阳 焦瑾 李根喜

    Abstract: 本发明公开了一种circRNA驱动的基于长链DNA支架的DNA纳米带的制备方法及其肿瘤应用,包括如下步骤:(1)设计一个环状DNA模板,该模板上含有发夹探针H1和发夹探针H2两种安装位点,以及可以特异性识别靶标BSJ位点的序列片段;(2)以该环状DNA为模板;(3)将发夹探针H1和发夹探针H2通过自组装结合在长链DNA上,所述的发夹探针H2包含荧光基团HEX和猝灭基团BHQ1,(4)最终合成了一种BSJ位点驱动的基于长链DNA支架的DNA纳米带。本发明的DNA纳米带可以特异性的识别目标circRNA,用于复杂生物样品中circRNA的直接分析。

    一种新型冠状病毒的试剂盒及其单独闭管一步法检测新型冠状病毒核酸的方法

    公开(公告)号:CN111154919A

    公开(公告)日:2020-05-15

    申请号:CN202010144444.8

    申请日:2020-03-04

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种新型冠状病毒的试剂盒及其单独闭管一步法检测新型冠状病毒核酸的方法,本发明的一种单独闭管一步法检测新型冠状病毒核酸的试剂盒,包括引物、挂锁探针和RCA标准品,所述的RCA标准品具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列;所述的挂锁探针具有SEQ ID No.2所示的核苷酸序列;所述引物具有SEQ ID No.3所示的核苷酸序列。本发明的2019-CoV核酸的现场快速检测产品,缩短检测用时,提升便捷程度,推动诊断前移下移,实现疑似患者的快速诊断和密切接触人群的现场筛查。

    一种基于细胞印迹的肿瘤细胞识别与检测的新方法

    公开(公告)号:CN110514629A

    公开(公告)日:2019-11-29

    申请号:CN201810520196.5

    申请日:2018-05-21

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明在已制作的细胞生物印迹聚合物膜基础上,进一步对其表观单分子性质和作为传感器机制深入研究。制作出的高保真性的印迹聚合物膜,通过叶酸受体连接Ligprobe后,再经过RCA滚环扩增信号扩增表征,在微观分子程度上印迹聚合物与模板细胞的高度契合;生物印迹能够在纳米尺度上区分靶分析物的总体大小和表面特征,由于纳米尺度的差异,在此基础上生物印迹具有区分微米尺度上相同的细胞的能力,意味着印迹聚合物膜可能用作生物传感器,可应用在基于细胞表面膜蛋白种类差异分离细胞,这种差异可作为基于生物印迹的癌症诊断工具,本研究还制作基于印迹聚合物膜的电化学传感装置,该装置成本低廉,便于操作并可反复使用,在生物传感领域具有十分广阔的应用前景。

    一种新型细胞印迹模型的构建及性质与应用的研究

    公开(公告)号:CN110514504A

    公开(公告)日:2019-11-29

    申请号:CN201810519402.0

    申请日:2018-05-21

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 一种新型细胞印迹模型的构建与应用。原理如下:本发明工作中,我们利用聚二甲基硅氧烷本体和固化剂,研制出高度保真性的细胞印迹聚合物,细胞印迹产生了“人造受体”,可通过特异性的凹陷结构形状捕获靶细胞。本研究在研制高度保真细胞印迹聚合物时,创新使用通过双醛固定组合处理使细胞失活,其优点有(1)利用醛基交联而使细胞表面硬化;(2)消除活细胞分泌的化学物质,防止干扰细胞印迹形成过程的保真度。同时本研究提供了一个简单廉价的单细胞分离模型,不依靠专业或昂贵的设备,不需要亲和试剂或蛋白抗体,对靶细胞的捕获效率为89%,且高度抗干扰,可为单细胞分析、细胞组织分化及以细胞为基础的临床诊断提供广阔的应用前景。

    特异性DNA假结结构修饰的金电极及制备方法和应用

    公开(公告)号:CN105929001A

    公开(公告)日:2016-09-07

    申请号:CN201610243290.1

    申请日:2016-04-19

    Applicant: 南京大学

    CPC classification number: G01N27/3277 G01N27/48

    Abstract: 本发明属于电化学传感器技术领域,具体涉及一种特异性DNA假结结构修饰的金电极及制备方法和应用。本发明所述特异性DNA假结结构修饰的金电极表面通过金‑巯键的作用自组装修饰有末端带亚甲蓝氧化还原标签、茎环1含Nanog结合序列的DNA假结结构,该生物传感器利用功能化的DNA假结结构探针修饰的金电极与目标蛋白反应后,引起DNA假结结构构象改变,借助具有良好导电性的电信号分子MB,实现了对转录因子Nanog的灵敏检测,可以有效区分靶蛋白与其他对照蛋白。本方法操作简单,具有较高灵敏性和特异性,最小检测范围是170pM。

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