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公开(公告)号:CN106480205A
公开(公告)日:2017-03-08
申请号:CN201610994059.6
申请日:2016-11-11
Applicant: 北京吉因加科技有限公司 , 苏州吉因加生物医学工程有限公司
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q1/6874 , C12Q2600/118 , C12Q2600/156 , C12Q2600/16 , C12Q2565/501 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了用于同时检测多种突变类型的序列组合和探针。更具有而言,本发明提供了高灵敏度、高特异性的可以同时检测表1中列出的57个肿瘤驱动基因的点突变、短片段插入缺失、拷贝数变异和融合基因的序列组合、探针、基因芯片、方法和试剂盒。本发明还公开了所述序列组合和探针相关的基因芯片和试剂盒以及用于同时检测多种突变类型的方法。本发明通过检测血液、胸水、腹水等体液以及肿瘤冰冻组织或石蜡切片获得全面的肿瘤驱动基因突变信息,提高了肿瘤基因检测的灵敏度和准确率,从而实现辅助临床医生制定个体化用药方案,使精准治疗达到最好效果。
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公开(公告)号:CN105063209A
公开(公告)日:2015-11-18
申请号:CN201510488030.6
申请日:2015-08-10
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6851 , C12Q2525/191 , C12Q2525/207 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明提供了一种外泌体miRNA的定量检测方法,包括外泌体总RNA提取、3’端和5’端特异性唯一标签接头连接、反转录合成cDNA并进行PCR扩增、miRNA文库的筛选纯化与上机测序、纠错算法的信息分析等步骤。本发明方法基于特异性的唯一标签接头的标记,对每个原始模板进行区分,避免了扩增时分子间存在的偏好性,可以精确检测低于10拷贝以下的miRNA分子,且特异性高,可用于肿瘤源性的外泌体miRNA的检测,神经退行性疾病、心血管疾病,生育健康等领域的检测,可为疾病的早期筛查提供依据,还可应用于其他小RNA精准定量检测领域。具有广阔的应用前景和市场价值。
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公开(公告)号:CN112029858B
公开(公告)日:2023-11-24
申请号:CN202010844019.X
申请日:2020-08-20
Applicant: 北京吉因加科技有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12M1/34 , C12M1/00 , G16B20/30 , G16B30/00
Abstract: 本发明公开了一种PD‑1/PD‑L1抑制剂免疫治疗疗效预测的方法和系统。所述方法包括:获取受试者的肿瘤浸润淋巴细胞的T细胞受体的种类和丰度,以及基线外周血的CD8+PD1+T细胞的T细胞受体的种类;统计受试者的肿瘤浸润淋巴细胞与CD8+PD1+T细胞共有T细胞受体的种类,计算所述肿瘤浸润淋巴细胞中具有共有T细胞受体的肿瘤浸润淋巴细胞的平均比例,作为IR指数;通过所述IR指数判断PD‑1/PD‑L1抑制剂免疫治疗疗效。本发明的方法可以提供肿瘤免疫治疗疗效及预后的预测指标,能有效筛选免疫治疗应答患者群。
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公开(公告)号:CN109427412A
公开(公告)日:2019-03-05
申请号:CN201811303219.3
申请日:2018-11-02
Applicant: 北京吉因加科技有限公司 , 苏州吉因加生物医学工程有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
Abstract: 本发明公开了用于检测肿瘤突变负荷的序列组合和其设计方法。所述方法包括:a)确定需要设计探针的目标区域,并获得包含大样本测定的肿瘤突变数据的数据库;b)对于每个目标区域,以一个窗口长度进行滑动获得多个窗口,对所述每个窗口进行打分;c)对于每个目标区域,得分最高的窗口是目标探针区域。本发明还公开了计算组织和血浆样本TMB的方法,以及计算组织和血浆样本TMB的质控方法。
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公开(公告)号:CN105063209B
公开(公告)日:2017-12-12
申请号:CN201510488030.6
申请日:2015-08-10
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明提供了一种外泌体miRNA的定量检测方法,包括外泌体总RNA提取、3’端和5’端特异性唯一标签接头连接、反转录合成cDNA并进行PCR扩增、miRNA文库的筛选纯化与上机测序、纠错算法的信息分析等步骤。本发明方法基于特异性的唯一标签接头的标记,对每个原始模板进行区分,避免了扩增时分子间存在的偏好性,可以精确检测低于10拷贝以下的miRNA分子,且特异性高,可用于肿瘤源性的外泌体miRNA的检测,神经退行性疾病、心血管疾病,生育健康等领域的检测,可为疾病的早期筛查提供依据,还可应用于其他小RNA精准定量检测领域。具有广阔的应用前景和市场价值。
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公开(公告)号:CN106676178A
公开(公告)日:2017-05-17
申请号:CN201710043183.9
申请日:2017-01-19
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种评估肿瘤异质性的方法及系统。具体而言,本发明提出了一种分子克隆分析方法,该方法基于高通量测序在循环肿瘤DNA中的多种类型变异检测结果,将所有变异划分为不同的分子克隆,利用分子克隆层级评估肿瘤的异质性。本发明的方法实现以ctDNA高通量变异检测为基础的肿瘤异质性评估,以有效辅助肿瘤预后和治疗方案制定。
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公开(公告)号:CN105132407A
公开(公告)日:2015-12-09
申请号:CN201510488017.0
申请日:2015-08-10
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
Abstract: 本发明提供了一种脱落细胞DNA的低频突变富集测序方法,包括脱落细胞DNA的提取与DNA的打断,样品DNA文库构建、通用文库TT-COLD PCR扩增富集、探针富集捕获、捕获产物PCR及上机测序、正反双链纠错低频信息分析步骤,具体为基于接头通用引物进行TT COLD PCR对所有类型变异实现第一级突变富集扩增;设计富集探针芯片,针对热点变异将人基因组参考序列hg19设计的探针替换为基于突变碱基设计的探针,其他位点探针不变,进行第二级富集捕获;文库构建中的插入DNA两端12bp自身序列作为标签进行正反双链纠错比对,提高数据利用率,实现低频精确检测,可以对0.01%低频变异具有高特异性检测。
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公开(公告)号:CN111662983B
公开(公告)日:2023-04-07
申请号:CN202010642606.0
申请日:2020-07-06
Applicant: 北京吉因加科技有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , G16B20/20 , G16B20/50 , G16B15/30
Abstract: 本发明公开了一种用于检测淋巴瘤基因变异的试剂盒及其应用,具体公开了一种用于检测或辅助检测淋巴瘤相关基因变异的试剂盒,包括用于检测BCL2、BCL6、MYC和/或基因IGH融合的物质;所述物质为成套DNA探针;所述成套DNA探针包括SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:376所示的376条探针。所述试剂盒可以用于:1)检测或辅助检测与淋巴瘤相关基因变异;2)对弥漫大B细胞淋巴瘤患者进行细胞起源(Cell of origin,COO)分型;3)对淋巴瘤患者进行辅助诊断、预后判断和/或靶向药物预测。
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公开(公告)号:CN112029858A
公开(公告)日:2020-12-04
申请号:CN202010844019.X
申请日:2020-08-20
Applicant: 北京吉因加科技有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12M1/34 , C12M1/00 , G16B20/30 , G16B30/00
Abstract: 本发明公开了一种PD-1/PD-L1抑制剂免疫治疗疗效预测的方法和系统。所述方法包括:获取受试者的肿瘤浸润淋巴细胞的T细胞受体的种类和丰度,以及基线外周血的CD8+PD1+ T细胞的T细胞受体的种类;统计受试者的肿瘤浸润淋巴细胞与CD8+PD1+ T细胞共有T细胞受体的种类,计算所述肿瘤浸润淋巴细胞中具有共有T细胞受体的肿瘤浸润淋巴细胞的平均比例,作为IR指数;通过所述IR指数判断PD-1/PD-L1抑制剂免疫治疗疗效。本发明的方法可以提供肿瘤免疫治疗疗效及预后的预测指标,能有效筛选免疫治疗应答患者群。
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公开(公告)号:CN105087789B
公开(公告)日:2018-08-03
申请号:CN201510488029.3
申请日:2015-08-10
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种检测血浆cfDNA中BCR和TCR免疫组库的方法,包括以下步骤:血浆cfDNA提取、BCR H链的全长多重PCR扩增和TCRβ链CDR3多重PCR扩增、两种扩增产物等体积混合后再进行一次PCR扩增、高通量测序、免疫组库精准信息分析。上述三次PCR扩增的引物分别如SEQ ID NO.1‑28、SEQ ID NO.29‑77、SEQ ID NO.78‑79所示。本发明还提供了含有上述引物的检测血浆cfDNA中BCR和TCR的试剂盒。本发明方法以及试剂盒能够同时检测血浆cfDNA中BCR和TCR,实现精准信息分析和免疫组库各亚克隆的精确定量,在无创检测领域具有广阔的应用前景。
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