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公开(公告)号：CN105063208B
公开(公告)日：2018-03-06
申请号：CN201510487759.1
申请日：2015-08-10
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种血浆中游离的目标DNA低频突变富集测序方法，包括血浆DNA提取与文库构建、通用文库TT COLD PCR扩增富集、探针富集捕获、捕获产物PCR及上机测序、正反双链纠错低频信息分析，具体为基于通用引物进行TT COLD PCR对所有类型变异实现第一级突变富集扩增；设计富集探针芯片，针对热点变异将人基因组参考序列hg19设计的探针替换为基于突变碱基设计的探针，其他位点探针不变，进行第二级富集捕获；基于文库构建中的插入DNA两端12bp自身序列作为标签进行正反双链纠错比对，提高数据利用率，实现低频精确检测。本发明方法操作简便，实用性强，可以对0.01％低频变异具有高特异性检测。
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公开(公告)号：CN105063209A
公开(公告)日：2015-11-18
申请号：CN201510488030.6
申请日：2015-08-10
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6851 , C12Q2525/191 , C12Q2525/207 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明提供了一种外泌体miRNA的定量检测方法，包括外泌体总RNA提取、3’端和5’端特异性唯一标签接头连接、反转录合成cDNA并进行PCR扩增、miRNA文库的筛选纯化与上机测序、纠错算法的信息分析等步骤。本发明方法基于特异性的唯一标签接头的标记，对每个原始模板进行区分，避免了扩增时分子间存在的偏好性，可以精确检测低于10拷贝以下的miRNA分子，且特异性高，可用于肿瘤源性的外泌体miRNA的检测，神经退行性疾病、心血管疾病，生育健康等领域的检测，可为疾病的早期筛查提供依据，还可应用于其他小RNA精准定量检测领域。具有广阔的应用前景和市场价值。
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公开(公告)号：CN105132407B
公开(公告)日：2017-12-12
申请号：CN201510488017.0
申请日：2015-08-10
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
Abstract: 本发明提供了一种脱落细胞DNA的低频突变富集测序方法，包括脱落细胞DNA的提取与DNA的打断，样品DNA文库构建、通用文库TT‑COLD PCR扩增富集、探针富集捕获、捕获产物PCR及上机测序、正反双链纠错低频信息分析步骤，具体为基于接头通用引物进行TT COLD PCR对所有类型变异实现第一级突变富集扩增；设计富集探针芯片，针对热点变异将人基因组参考序列hg19设计的探针替换为基于突变碱基设计的探针，其他位点探针不变，进行第二级富集捕获；文库构建中的插入DNA两端12bp自身序列作为标签进行正反双链纠错比对，提高数据利用率，实现低频精确检测，可以对0.01％低频变异具有高特异性检测。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN105087789B
公开(公告)日：2018-08-03
申请号：CN201510488029.3
申请日：2015-08-10
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种检测血浆cfDNA中BCR和TCR免疫组库的方法，包括以下步骤：血浆cfDNA提取、BCR H链的全长多重PCR扩增和TCRβ链CDR3多重PCR扩增、两种扩增产物等体积混合后再进行一次PCR扩增、高通量测序、免疫组库精准信息分析。上述三次PCR扩增的引物分别如SEQ ID NO.1‑28、SEQ ID NO.29‑77、SEQ ID NO.78‑79所示。本发明还提供了含有上述引物的检测血浆cfDNA中BCR和TCR的试剂盒。本发明方法以及试剂盒能够同时检测血浆cfDNA中BCR和TCR，实现精准信息分析和免疫组库各亚克隆的精确定量，在无创检测领域具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN105087789A
公开(公告)日：2015-11-25
申请号：CN201510488029.3
申请日：2015-08-10
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
CPC classification number: C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12Q2537/143 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明提供了一种检测血浆cfDNA中BCR和TCR免疫组库的方法，包括以下步骤：血浆cfDNA提取、BCR H链的全长多重PCR扩增和TCRβ链CDR3多重PCR扩增、两种扩增产物等体积混合后再进行一次PCR扩增、高通量测序、免疫组库精准信息分析。上述三次PCR扩增的引物分别如SEQ ID NO.1-28、SEQ ID NO.29-77、SEQ ID NO.78-79所示。本发明还提供了含有上述引物的检测血浆cfDNA中BCR和TCR的试剂盒。本发明方法以及试剂盒能够同时检测血浆cfDNA中BCR和TCR，实现精准信息分析和免疫组库各亚克隆的精确定量，在无创检测领域具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN105063208A
公开(公告)日：2015-11-18
申请号：CN201510487759.1
申请日：2015-08-10
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: A61K38/00 , C12Q1/68 , C12Q1/6874 , C12Q1/6886 , C12Q2600/156 , C12Q2565/501 , C12Q2535/122 , C12Q2531/113
Abstract: 本发明提供了一种血浆中游离的目标DNA低频突变富集测序方法，包括血浆DNA提取与文库构建、通用文库TT COLD PCR扩增富集、探针富集捕获、捕获产物PCR及上机测序、正反双链纠错低频信息分析，具体为基于通用引物进行TT COLD PCR对所有类型变异实现第一级突变富集扩增；设计富集探针芯片，针对热点变异将人基因组参考序列hg19设计的探针替换为基于突变碱基设计的探针，其他位点探针不变，进行第二级富集捕获；基于文库构建中的插入DNA两端12bp自身序列作为标签进行正反双链纠错比对，提高数据利用率，实现低频精确检测。本发明方法操作简便，实用性强，可以对0.01％低频变异具有高特异性检测。
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公开(公告)号：CN105063209B
公开(公告)日：2017-12-12
申请号：CN201510488030.6
申请日：2015-08-10
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明提供了一种外泌体miRNA的定量检测方法，包括外泌体总RNA提取、3’端和5’端特异性唯一标签接头连接、反转录合成cDNA并进行PCR扩增、miRNA文库的筛选纯化与上机测序、纠错算法的信息分析等步骤。本发明方法基于特异性的唯一标签接头的标记，对每个原始模板进行区分，避免了扩增时分子间存在的偏好性，可以精确检测低于10拷贝以下的miRNA分子，且特异性高，可用于肿瘤源性的外泌体miRNA的检测，神经退行性疾病、心血管疾病，生育健康等领域的检测，可为疾病的早期筛查提供依据，还可应用于其他小RNA精准定量检测领域。具有广阔的应用前景和市场价值。
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公开(公告)号：CN105132407A
公开(公告)日：2015-12-09
申请号：CN201510488017.0
申请日：2015-08-10
Applicant: 北京吉因加科技有限公司
Abstract: 本发明提供了一种脱落细胞DNA的低频突变富集测序方法，包括脱落细胞DNA的提取与DNA的打断，样品DNA文库构建、通用文库TT-COLD PCR扩增富集、探针富集捕获、捕获产物PCR及上机测序、正反双链纠错低频信息分析步骤，具体为基于接头通用引物进行TT COLD PCR对所有类型变异实现第一级突变富集扩增；设计富集探针芯片，针对热点变异将人基因组参考序列hg19设计的探针替换为基于突变碱基设计的探针，其他位点探针不变，进行第二级富集捕获；文库构建中的插入DNA两端12bp自身序列作为标签进行正反双链纠错比对，提高数据利用率，实现低频精确检测，可以对0.01％低频变异具有高特异性检测。
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