生猪全域数字智能育种系统
    92.
    发明公开

    公开(公告)号:CN117934195A

    公开(公告)日:2024-04-26

    申请号:CN202410311051.X

    申请日:2024-03-19

    Abstract: 本发明公开了生猪全域数字智能育种系统,包括应用智能设备对生猪全生命周期、全产业链、世代、环境因子及基因组五个域的数据信息进行大规模智能化收集,并通过生猪全域数字智能育种信息系统对五个域的数据进行智能管理,同时利用育种大模型算法,高效利用五个域的数据信息,对育种值进行精准估计,进行高效育种的全套技术和体系。具体来讲包括:生猪全生命周期检测系统;全产业链系统;世代检测系统;环境检测系统;基因组检测系统;数据整合平台。通过实现智能设备数据信息智能收集及设备自动管理,通过整合智能硬件的数据信息及大数据处理智能算法,实现育种值精准评估,提升育种效率,开展数字智能育种。

    一种与猪的饲料转化效率相关的SNP分子标记

    公开(公告)号:CN111500746B

    公开(公告)日:2021-09-17

    申请号:CN202010438668.X

    申请日:2020-05-22

    Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及一种与猪的饲料转化效率相关的SNP分子标记。该SNP分子标记登陆号为MARC0045707,通过整合实验室采集的16个批次的包含大白猪、长白猪、杜洛克猪和皮特兰猪这四个品种的4005头猪的SNP芯片数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,得到一种与猪的饲料转化效率相关的SNP分子标记,该SNP标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,该序列的第51位的碱基处R是突变位点,由碱基A突变为碱基G,该突变位点导致所示序列的核苷酸产生多态性;当SEQ ID NO:1所述序列的第51位核苷酸为G时,判定猪的饲料转化效率较低。

    与母猪肢蹄骨密度相关的FAM131C基因的SNP分子标记

    公开(公告)号:CN108384864B

    公开(公告)日:2021-06-01

    申请号:CN201810483700.9

    申请日:2018-05-19

    Abstract: 本发明属于动物分子标记筛选领域,具体涉及与与母猪肢蹄骨密度相关的FAM131C基因的SNP分子标记。通过基因分型技术并参阅Ensembl数据库,得到登录号为ASGA0099279基因上下游100bp序列的FAM131C基因片段,序列如SEQ ID NO:1所示。利用基因芯片技术对FAM131C基因进行分型,筛选到与母猪肢蹄骨密度相关的标记,其序列如SEQ ID NO:1所示,上述序列的第101位碱基处的R是C或T,导致核苷酸序列的多态性。可作为检测与猪骨密度相关的分子标记,当SEQ ID NO:1上的第101位核苷酸为C时,则母猪的肢蹄具有更高的骨密度。本发明为猪骨密度的标记辅助选择提供了新的SNP标记。

    克隆自CNV片段的与猪耳形性状相关的分子标记

    公开(公告)号:CN110373477B

    公开(公告)日:2021-05-07

    申请号:CN201910680683.2

    申请日:2019-07-23

    Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及克隆自CNV片段的与猪耳形性状相关的分子标记。该分子标记为通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,根据全基因组关联分析(GWAS)技术得到一种与猪耳形性状关联的拷贝数变异分子标记(CNV),当个体拥有该片段的多拷贝(拷贝数>3)时,则有利于猪拥有非直立的耳形,该片段的核苷酸序列如序列表中所示。公开了筛选与猪耳形相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪耳形的标记辅助选择提供了遗传标记资源。

    克隆自InDel片段的与猪毛色性状相关的分子标记

    公开(公告)号:CN110408707B

    公开(公告)日:2021-02-12

    申请号:CN201910680292.0

    申请日:2019-07-23

    Abstract: 本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及克隆自InDel片段的与猪毛色性状相关的分子标记。该分子标记通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所中公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,根据全基因组关联分析(GWAS)得到一种与猪毛色性状相关的分子标记,即发生在Chr 11:50076946bp处的缺失,由原片段CTGGGAACTT缺失为C,具体核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。当个体基因型为CC时,有利于个体拥有渐变带毛色。本发明公开了筛选猪毛色性状相关分子标记的方法及其关联分析的应用,为猪毛色性状的标记辅助选择提供了新的InDel分子标记。

    一种与母猪肢蹄骨密度相关的SNP分子标记

    公开(公告)号:CN108624701B

    公开(公告)日:2021-02-02

    申请号:CN201810452332.1

    申请日:2018-05-12

    Abstract: 本发明属于动物分子标记筛选技术领域,具体涉及与一种与母猪肢蹄骨密度相关SNP的分子标记。该分子标记克隆自登陆号为H3GA0030503的基因片段,通过基因芯片对该基因进行分型筛选得到一种与母猪肢蹄骨密度相关的分子标记,该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第51位的碱基处存在一个G/T的等位基因突变,且当SEQ ID NO:1上的第51位核苷酸为G时,则母猪的肢蹄具有更高的骨密度。本发明还公开了筛选与母猪肢蹄骨密度相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。

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